Das Magazin für Biowissenschaften...BIO spektrum D13808F · ISSN 0947-0867 Das Magazin für...
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spektrum BIO D13808F · ISSN 0947-0867 Das Magazin für Biowissenschaften www.biospektrum.de 2011 Sonderausgabe Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 2011 Karlsruhe, 3.–6. April 2011
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spektrumBIO
D13808 F · ISSN 0947-0867
Das Magazin für Biowissenschaften
www.biospektrum.de
2011Sonderausgabe
Tagungsband zur
VAAM-Jahrestagung 2011
Karlsruhe, 3.–6. April 2011
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BIOspektrum | Tagungsband 2011
3 Inhalt
4 Welcome address of the President of the KarlsruheInstitute of Technology (KIT)
Horst Hippler4 Greeting of the President of the VAAM
Axel Brakhage6 Welcome address of the Organizing committee
8 General Information
11 Sponsors and Exhibitors of the Annual Meetingof the VAAM
14 Einladung zur Mitgliederversammlung der VAAM
14 Industrial Symposium
14 Karrieresymposium
16 Aus den Fachgruppen
22 Institutsportraits
25 Conference Programme Overview
28 Conference Programme
31 Mini-Symposia of the Special Groups of the VAAM
35 Short Lectures
44 Abstracts Oral Presentations/Postersessions
44 Invited Speaker ISV50/52 Anaerobic metabolism AMV/AMP63/65 Archaea ARV/ARP69/73 Cell biology CBV/CBP82/90 Environmental microbiology EMV/EMP
121/127 Fungal biology and FBV/FBPbiotechnology
136/137 Functional genomics FGV/FGP142/144 Food microbiology FMV/FMP149/154 Green and white biotechnology GWV/GWP168/171 Microbial diversity MDV/MDP177/182 Microbial pathogens and MPV/MPP
pathogenicity198/199 New techniques in microbiology NTV/NTP204/207 Open topics OTV/OTP
220 Physiology PSV/PSP228/229 Regulation RGV/RGP
241 Systems biology SBP243/245 Symbiotic interactions SIV/SIP250/254 Stress responses SRV/SRP
263 Author index
275 Personalia aus der Mikrobiologie 2010
277 Promotionen 2010
282 Impressum
Zum Titelbild:
Der filamentöse Pilz Aspergillus niger wird zur Phytaseproduktion ein-gesetzt. Das linke Bild zeigt eine Myzelflocke. Das rechte Bild zeigtLactobacillus paracasei und Streptococcus mutans. Das probiotischeBakterium soll zum Kariesschutz eingesetzt werden (pro-t-action™).L. paracasei verklumpt mit S. mutans so dass die Bakterien leicht ausdem Mund gespült werden können.
Das Karlsruher Schloss (unten) ist das Zentrum des KarlsruherFächers. Karlsruhe wurde am 17. Juni 1715 von Markgraf Karl Wilhelmvon Baden-Durlach an der Stelle gegründet, an der er der Sage nachbei der Jagd geschlafen und von seiner neuen Stadt geträumt hatte,daher der Name - Karlsruhe. Das Zentrum bildet das klassizistischeResidenzschloss, zu dem strahlenförmig 32 Straßen führen.
Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie (VAAM)
Tagungsband zur VAAM-Jahrestagung 20113. bis 6. April in Karlsruhe
Conference President: Reinhard Fischer
Scientific Committee: Karlsruhe Institute of Technology (Campus South): Reinhard Fischer, NataliaRequena, Jörg Kämper, Christoph Syldatk, Tilman Lamparter, Josef Winter, Clemens Posten;Karlsruhe Institute of Technology (Campus North): Ursula Obst; Max Rubner Institute: Rolf Geisen;BASF SE: Claus Bollschweiler, Marvin Karos, Oskar Zelder; nadicom GmbH: Bernhard Nüßlein
4 WELCOME ADDRESS
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Welcome address of the President of the Karlsruhe Instituteof Technology (KIT)
about 8.700 administrative employees andabout 384 Professors KIT is now one of thelargest research and education centers inEurope and it is well equipped to tackle allkinds of scientific problems.
KIT research is primarily based on the capa-cities and knowledge of the scientists. In 157institutes – thereof 27 Helmholtz-institutes –our scientists work in an excellent and world-wide unique scientific infrastructure. Thisgives us the opportunity to cooperate on com-pletely new levels with other research cen-ters, universities and industry partners. AtKIT research, teaching and innovation are lin-ked closely. We see our strength in the con-nection between people, infrastructure andknow-how.
The work of every single scientist at KITcontributes to the KIT idea – to create newpossibilities for research; to cooperate on newlevels with scientists all over the world; to
ó On behalf of the KarlsruheInstitute of Technology I amdelighted to welcome you tothe Annual Conference of theAssociation for General andApplied Microbiology – theVAAM 2011.
In the last five years the appearance ofKarlsruhe in the international educationallandscape has changed dramatically. Afterthree years of preparation, on October 1st2009, the state Technical University Karlsru-he, Fridericiana, and the federal ResearchCenter Karlsruhe, became one legal unity.This newly created institution is a completenovelty in the German science system wherestate and federation have very different sove-reign rights. Two strong and equal partnershave merged by creating an organizationwhich has the potential to influence and chan-ge the research community profoundly. With
bring the cream of the crop together for out-standing research goals. Therefore we arehonored to welcome every single participantof the VAAM 2011 at Karlsruhe. This annualconference provides insights into the latestdevelopments of General and Applied Micro-biology and gives the chance for the interna-tional research community to amplify theirknowledge. In this spirit we wish you inter-esting and fruitful discussions. Enjoy yourstay! ó
Prof. Dr. Horst HipplerPresident of the Karlsruhe Institute of Technology
Greeting of the President of the VAAM to theAnnual Meeting 2011
tists have been recruited to present theirrecent data in plenary talks. These plenarysessions will also include overviews of thecurrent state of the art in various aspects ofmicrobiology. As president of the VAAM, Iam particularly glad that the meeting attractsso many junior members, who will be offeredthe possibility to present their work.
In addition, the meeting will host the tra-ditional career symposia, to highlight careerpaths and encourage professional develop-ment.
I would also like to invite you to the generalassembly of VAAM members, where we willelect a new executive board and new honorarymembers will be proposed and elected. Here,the presentation of awards and PhD lectureswill take place.
On behalf of the VAAM, I would like tothank the president of the meeting, ReinhardFischer, all the members of the organizingcommittee of the Karlsruher Institute of Tech-nology, the Max Rubner Institute, the nadi-
ó Dear Microbiologists,the VAAM is committed topromote both fundamentaland applied microbiologicalresearch and, as a result,has established considerablecontacts with companies.
This connection is mirrored by the annualmeeting, this year to be held in Karlsruheand organised by scientists of both the Karls-ruher Institute of Technology and the BASFSE. This inter-disciplinary environment isalso emphasised by the research areas cov-ered this year. These topics include cell biol-ogy, environmental microbiology, food micro-biology, microbial interactions, stressresponse and white biotechnology. This veryinteresting program reflects our success inattracting both national and international sci-entists. Because the VAAM now has morethan 3300 members, we expect more than1000 participants to attend the annual meet-ing in Karlsruhe. World-wide leading scien-
com GmbH and the BASF SE, as well as themany assistants for their great effort inpreparing this interesting meeting. I am real-ly pleased about the offer of child care duringthe program, that will allow parents withyoung children to attend the VAAM meeting.I would also like to express my gratitude to allparticipants, whose scientific contributionsare essential for the success of such a meet-ing. I am sure that the meeting in Karlsruhewill be of the highest scientific quality andwill also give the opportunity for enjoyablescientific exchange and interactions. ó
Prof. Dr. Axel BrakhagePresident of the VAAM
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6 WELCOME ADDRESS
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Welcome address of the organizing committeescientific society, we continuously rely onexcellent students who are fascinated by themicrobial world, and we do hope that thismeeting in Karlsruhe will help to stimulatetheir enthusiasm.
The entire meeting will be held without dis-traction in the same building, at theStadthalle, which will allow direct interactionwith all participants during the breaksbetween sessions. Posters will be located inthe break area, and thus will attract the mostattention of the participants.
The location of the Stadthalle, in the centerof Karlsruhe, is within walking distance ofthe castle, KIT’s South Campus, the city’spedestrian area and the large and modernshopping center Ettlinger Tor, which offers
ó It is a great pleasure forus to welcome you to theannual meeting of the VAAMat the Karlsruhe Institute ofTechnology (KIT). More than900 abstracts from all fieldsof microbiology have been
submitted and promise a very interesting andfruitful meeting. The topics of the main ses-sions reflect the broad microbiologicalresearch interests in Germany and are rep-resented by leading national and internationalscientists of the field of microbiology. In addi-tion to the plenary sessions, a large numberof concurrent sessions have been set up,where primarily young scientists will beencouraged to highlight their results. As a
the opportunity to experience the city beyondscience. If you have one or two extra days oftime, you can travel around Karlsruhe: with-in a few minutes you can cross the Rhine andbe in France; or Strasbourg and the beautifulwine villages in Alsace or Pfalz are only onehour away.
We will do our best to organize a mostinteresting and enjoyable meeting in Karls-ruhe! ó
Reinhard Fischer, Jörg Kämper, Tilman Lamparter, Clemens Posten,Natalia Requena, Christoph Syldatk,Josef Winter, Ursula Obst, Rolf Geisen,Claus Bollschweiler, Marvin Karos, Oskar Zelder, Bernhard Nüßlein
The Karlsruhe Institute of Technology (KIT) con-sists of Campus South (formerly University ofKarlsruhe) and Campus North (formerly ResearchCenter Karlsruhe) (right). Whereas Campus Southis located in the gardens of the castle, CampusNorth lies about 10 km north of the city. 1, Presidential Office; 2, Future building for Bio-logical Sciences (currently under renovation);3, Engler Bunte Institute; 4, Organic Chemistry;5, Inorganic Chemistry; 6, Physics; 7, Institute forFunctional Interfaces. The Max Rubner Institute islocated in the east part of the city, just 5 minutesaway from Campus South.
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Analytik | Zellgrößenverteilung | Apoptose
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reguläre und inverse Beleuchtung | Fluoreszenzlicht
für inverse und einfallende Beleuchtung | Optionen:
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UV LED und PI durch Anregung mittels grünem Laser
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Immunologie | HIV | TB | Malaria | Mikrobiologie |
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8 GENERAL INFORMATION
BIOspektrum | Tagungsband 2011
General InformationAnnual Conference 2011 of the VAAM
From motorway A65The A65 turns into the B10. Continue on theB10. Take exit 2 and continue towards thecongress centre (Kongresszentrum).Address for navigation systems: Kongress-
zentrum, Festplatz 9, Karlsruhe.
Car parkThere is space for approximately 1,000 vehi-cles in the underground parking at the con-gress centre.Address for navigation systems: Park
House 1 – Hermann-Billing-Straße 1, Karls-
ruhe; Park House 2 – Beiertheimer Allee 9,
Karlsruhe.
Hotel reservationWe have reserved a contingent of rooms atspecial rates in Karlsruhe. Please find thereservation fax on our conference homepagewww.vaam2011.de.Hotel rooms may also be looked through:www.karlsruhe.de
Registration and conference fees
Online registration is possible till 28 March2011 through the conference homepage
Venue
Stadthalle KarlsruheFestplatz 976137 KarlsruheGermany
Address for correspondence
Conventus Congressmanagement &Marketing GmbHIsabelle Lärz/Martin SingerCarl-Pulfrich-Straße 107745 Jena, GermanyPhone +49 (0)3641 311 63 -20/-10Fax +49 (0)3641 311 62 41www.vaam2011.de
Opening hours
Sunday 03.04.2011 14:30 – 19:30Monday 04.04.2011 07:30 – 19:00Tuesday 05.04.2011 07:30 – 19:00Wednesday 06.04.2011 08:00 – 12:00
Travelling to Karlsruhe
By trainKarlsruhe is a hub for ICE, InterCity, EuroCityand InterRegio connections and is locateddirectly on the ICE route from Hamburg toBasel through Frankfurt. The west-east route,from Karlsruhe to Munich through Stuttgart,begins here. It takes about 3 hours with a TGVtrain from Paris to arrive in Karlsruhe.
The congress centre is in walking distance(10 min) from the main station.
By public transport in KarlsruheYou can take tram S1, S4, S11, and 2 from themain station to the tram stop “Kongresszen-trum.” From the city centre, take any of thesame trams to the tram stop “Kongresszen-trum” or tram 5 to the tram stop “Kon-zerthaus”.
From motorway A5/A8From the A8 from Stuttgart continue onto theA5 toward Frankfurt. Take exit 45 “Karlsruhe-Mitte” and continue on the B10. Follow thesign-posting to Karlsruhe. From the B10, takeexit 2 towards the city centre and follow thesigns to the congress centre (Kongresszen-trum).Address for navigation systems: Kon-
gresszentrum, Festplatz 9, Karlsruhe.
www.vaam2011.de. Registrations after this dateare possible only on-site. Beside cash paymentswe also accept credit cards at the conferencereception desk (Master/ Euro, VISA, AmericanExpress and JBC) as well as EC-Cards.
Mixer
The Mixer will take place on Tuesday, 05 April2011 at 19:30 at the “Weinbrenner-Saal” atthe Main Floor in the Stadthalle Karlsruhe.Accompanying persons may purchase a ticket for the mixer at the conference receptiondesk.
Posters
Posters are to be presented in English and inthe format DIN A0 (84.1 cm × 118.9 cm,unlaminated). Authors are asked to attach tothe posters the time when they will be avail-able for discussion. The posters will have to befixed by pins. Materials will be provided.
The posters may be hung from 14:00 onSunday, 03.04.2011 and should be removedbefore 12:00 on Wednesday, 06.04.2011.
The poster sessions will be held on:• Monday, 04.04.2011, 15:15 – 17:30• Tuesday, 05.04.2011, 15:30 – 17:30
Registration fees (all days)
VAAM-Members
Regular 170 N
Student* 85 N
Non-members
Regular 240 N
Student* 110 N
Fee for day tickets (Monday, Tuesday, Wednesday)
Member 90 N
Non-member 115 N
Student member 40 N
Student non-member 70 N
* Please provide confirmation and quote VAAM 2011 as the reference.
Social programme
Welcome reception** (03 April 2011) included
Mixer** (05 April) included
** Registration required.
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BIOspektrum | Tagungsband 2011
Presentation of the HonoryAward, PhD Awards, and PosterPrizes
The presentation of the Honory Award willtake place on 04.04.2011 at 11:00.
The presentation of the PhD Thesis prizeswill take place on 05.04.2011 at 18:30.
The presentation of the Poster Prizes willtake place on 06.04.2011 at 11:30.
All awards will be presented in Brahms-Saal, Stadthalle.
Short lectures
The length of short lectures has been fixed at10 minutes plus 5 minutes for discussion. Dueto the fact that there will be up to 7–8 paral-lel sessions please adhere to the total time of15 minutes per presentation.
Short lectures are to be held in English.Data projectors are available in each of thelecture halls. In each lecture hall there will bean assistant for technical support. We ask alllectures to make use of the computer facilities
located at our media check-in to check theirpresentations in advance.
Please submit your presentation in at least120 minutes before your lecture will start.You are asked to clearly label your CD/mem-ory stick and the file with your short lecturecode number and the name of the person giv-ing the talk. All presentations will be loadedonto our computers and will be deleted afterthe talks.
General Tips for Authors andPresenters
Presentation SubmissionFollow the signs or ask at the check-in deskhow to find the media check-in.
Time AllotmentTo ensure smooth running of the entireprogramme, all speakers are encouragedto adhere to their allocated speaking time.The chair persons of the sessions areurged to cancel discussions in delay. Con-
tact your chair person before your sessionbegins and advise of any changes or specialwishes.
Presentation Form and Submission ofPresentationPDF and PowerPoint presentations are per-mitted. Open Office formats may also be used.Required technical equipment will be avail-able at the congress. Please make sure thatany required CODEC files for any videos arealso submitted.
The use of Macintosch or Open Office for-mats as well as the use of a personal laptop fora presentation is not planned, but possible.If necessary, please contact us by 23 March2011 at [email protected].
For video and audio files please submitAVI, WMV and MPG files only as a separatefile.
Please note: If you use a USB stick tosave your files, do not protect it with soft-ware.
Bars und Restaurants
10 GENERAL INFORMATION
BIOspektrum | Tagungsband 2011
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Sponsors and Exhibitors of the Annual Meeting of the VAAM 2011(as of 01.03.2011)
Main sponsor
Eurofins MWG Operon (Ebersberg)www.eurofinsdna.com
Sponsor Poster Prizes
nadicom GmbH (Karlsruhe)www.nadicom.de
Sponsors PhD Awards
BASF SE (Ludwigshafen)Bayer Schering Pharma AG (Berlin)Evonik Degussa GmbH (Hanau/Wolfgang)New England Biolabs GmbH (Frankfurt a. M.)Sanofi Aventis Deutschland GmbH (Frankfurt a. M.)
Sponsoren/Sponsors
BASF SE (Ludwigshafen)www.basf.com
DFG – Deutsche Forschungsgemeinschaft (Bonn)www.dfg.de
Evonik Degussa GmbH (Hanau/Wolfgang)www.corporate.evonik.de
Federation of European Microbiological Societies (FEMS)www.fems-microbiology.org
MP BIOMEDICALS GmbH (Illkirch/F) 26
New England Biolabs GmbH (Frankfurt) 16
Nippon Genetics Europe GmbH (Düren) 6
Oxoid Deutschland GmbH (Wesel) 15
Partec GmbH (Münster) 38
PerkinElmer LAS (Rodgau) 35
PreSens Precision GmbH (Regensburg) 44
Pyro Science (Aachen) 3
QIAGEN GmbH (Hilden) 18
R&D Systems GmbH (Wiesbaden) 1
Sarstedt AG & Co. (Nümbrecht) 10
SERVA Electrophoresis GmbH (Heidelberg) 19
Spektrum Akademischer Verlag (Heidelberg) 36
Süd-Laborbedarf GmbH (Gauting) 11
Technologie-Lizenz-Büro (TLB) (Karlsruhe) 8
Thermo Fisher Scientific (Langenselbold) 45
TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH (Berlin) 20
ZYMO Research Europe GmbH (Freiburg) 22
by booth number
R&D Systems GmbH (Wiesbaden) 1
Infors GmbH (Einsbach) 2
Pyro Science (Aachen) 3
Implen GmbH (München) 4
Applied Maths NV (Sint-Martens-Latem/BE) 5
Nippon Genetics Europe GmbH (Düren) 6
Bruker Daltonik GmbH (Bremen) 7
Technologie-Lizenz-Büro (TLB) (Karlsruhe) 8
IUL Instruments GmbH (Königswinter) 9
Sarstedt AG & Co. (Nümbrecht) 10
Süd-Laborbedarf GmbH (Gauting) 11
LGC Standards (Wesel) 12
Eurofins MWG Operon (Ebersberg) 13
MACHEREY-NAGEL GmbH & Co. KG (Düren) 14
Oxoid Deutschland GmbH (Wesel) 15
New England Biolabs GmbH (Frankfurt) 16
4titude (Berlin) 17
Exhibitorsalphabetically
3M Medica Zweigniederlassung der 3MDeutschland GmbH (Neuss) 464titude (Berlin) 17Abbott GmbH & Co. KG (Wiesbaden) 43AES CHEMUNEX GmbH (Bruchsal) 40Affymetrix UK Ltd., USB Europe (High Wycombe/UK) 25Agilent Technologies (Waldbronn/CH) 24Analytik Jena AG (Jena) 21AppliChem GmbH (Darmstadt) 31Applied Maths NV (Sint-Martens-Latem/BE) 5BioValley (Illkirch/FR) 29Bruker Daltonik GmbH (Bremen) 7Cameca (Unterschleissheim) 42Deutsche Forschungsgemeinschaft (Bonn) 39ELGA Labwater/VWS Deutschland GmbH (Celle) 28Eurofins MWG Operon (Ebersberg) 13GATC Biotech AG (Konstanz) 47GBRCN c/o JKI (Braunschweig) 49GE Healthcare Europe GmbH (München) 48IBA GmbH (Göttingen) 23Implen GmbH (München) 4Infors GmbH (Einsbach) 2Ingeniatrics Tecnologías S.L. (Seville/ES) 41IUL Instruments GmbH (Königswinter) 9Keyence Deutschland GmbH (Neu-Isenburg) 37Leibniz Institut DSMZ – Deutsche Sammlungvon Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH(Braunschweig) 30LGC Standards (Wesel) 12MACHEREY-NAGEL GmbH & Co. KG (Düren) 14Meintrup DWS Laborgeräte GmbH (Lähden-Holte) 27metaBIOn international AG (Martinsried) 32miacom diagnostics GmbH (Düsseldorf) 33MoBiTec GmbH (Göttingen) 34
QIAGEN GmbH (Hilden) 18
SERVA Electrophoresis GmbH (Heidelberg) 19
TIB MOLBIOL Syntheselabor GmbH (Berlin) 20
Analytik Jena AG (Jena) 21
ZYMO Research Europe GmbH (Freiburg) 22
IBA GmbH (Göttingen) 23
Agilent Technologies (Waldbronn/CH) 24
Affymetrix UK Ltd., USB Europe 25
MP BIOMEDICALS GmbH (Illkirch/F) 26
Meintrup DWS Laborgeräte GmbH (Lähden-Holte) 27
ELGA Labwater/VWS Deutschland GmbH (Celle) 28
BioValley (Illkirch/FR) 29
Leibniz Institut DSMZ – Deutsche Sammlungvon Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH(Braunschweig) 30
AppliChem GmbH (Darmstadt) 31
metaBIOn international AG (Martinsried) 32
miacom diagnostics GmbH (Düsseldorf) 33
MoBiTec GmbH (Göttingen) 34
PerkinElmer LAS (Rodgau) 35
Spektrum Akademischer Verlag (Heidelberg) 36
Keyence Deutschland GmbH (Neu-Isenburg) 37
Partec GmbH (Münster) 38
Deutsche Forschungsgemeinschaft (Bonn) 39
AES CHEMUNEX GmbH (Bruchsal) 40
Ingeniatrics Tecnologías S.L. (Seville/ES) 41
Cameca (Unterschleissheim) 42
Abbott GmbH & Co. KG (Wiesbaden) 43
PreSens Precision GmbH (Regensburg) 44
Thermo Fisher Scientific (Langenselbold) 45
3M Medica Zweigniederlassung der 3MDeutschland GmbH (Neuss) 46
GATC Biotech AG (Konstanz) 47
GE Healthcare Europe GmbH (München) 48
GBRCN c/o JKI (Braunschweig) 49
12 GENERAL INFORMATION · SPONSORS & EXHIBITORS
BIOspektrum | Tagungsband 2011
47 48
C
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C
13
BIOspektrum | Tagungsband 2011
AusstellungsplanEbene 2/Obergeschoss
Jahrestagung der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie03.–06. April 2011
C C
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26
28 29 30 31 32 33 3534 36 37 38 39
40
41
42
Johannes-Brahms-Saal
2.06 2.07 2.10 2.09
C = Catering = Poster
49
2.052.08
14 GENERAL INFORMATION
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Einladung zur Mitgliederversammlung der VAAM6. Wahl des Präsidiums (Präsident, 1. Vize-
präsident, Schatzmeister, Schriftführer)und des Beirats (geheime Wahl währendder Mitgliederversammlung)
7. Ehrenmitgliederwahl8. VerschiedenesIm Anschluss findet die Verleihung der
VAAM-Promotionspreise 2011 statt.
Hiermit bitte ich alle Mitglieder, Vorschlägezur Wahl des Präsidiums und des Beiratsbeim Präsidenten einzureichen (bis 14 Tagevor der Mitgliederversammlung), wobei Vor-schläge für das Präsidium von zehn VAAM-Mitgliedern und für den Beirat von drei Mit-gliedern unterschrieben sein müssen. Ichmöchte auch darauf hinweisen, dass der Vor-stand der VAAM den jetzigen 1. Vizepräsi-
ó Hiermit lade ich alle Mitglieder der VAAMzur Mitgliederversammlung ein. Sie wird amDienstag, den 5. April 2011, um 17.30 Uhr
in der Stadthalle in Karlsruhe stattfinden.
Vorläufige Tagesordnung:
1. Festlegung der Tagesordnung und Geneh-migung der Niederschrift der Mitglieder-versammlung vom 30. März 2010 in Han-nover (siehe BIOspektrum 4/10, Seiten 460und 461)
2. Bericht aus dem Vorstand, u.a. Haushalt2010 und Haushaltsplan 2011, Ort und Zeitder nächsten Jahrestagung, Aktivitäten derFachgruppen, VBIO
3. Neustrukturierung der Mitgliedsbeiträge4. Bericht der Kassenprüfer5. Entlastung des Vorstandes
denten entsprechend der Geschäftsordnung(siehe Homepage der VAAM) zur Wahl zumPräsidenten vorschlagen wird. Ordentlicheund studentische Mitglieder haben auf derMitgliederversammlung gleiches Stimm-recht.
Reisekostenzuschüsse für studentischeMitglieder können bei fristgerecht einge-gangenen Anträgen und bei Vorliegen dersonstigen Voraussetzungen nur persönlicham Dienstag, den 5. April 2011, von 15.00
– 17.00 Uhr sowie am Mittwoch, den 6.
April 2011, von 10.00 – 12.00 Uhr imTagungsbüro abgeholt werden. ó
Hubert BahlSchriftführer
KarrieresymposiumMontag, 4. 4. 2011
15.45 – 17.15 Uhr
Clubraum
Ulrike Gerischer, GöttingenWissenschaftskoordinatorin am MPI für biophysikalische Chemie
“Akademische Laufbahn: Plan B”
Anja Störiko, HofheimWissenschaftsjournalistin
Formulieren statt Forschen
“Von den Biowissenschaften in den Journalismus”
Martin Langer, Ute Dechert, ZwingenbergB.R.A.I.N
“Wachstum mit Weißer Biotechnologie:
Karrieren und Chancen bei BRAIN”
Symposium by Eurofins MWG Operon (Ebersberg)Tuesday, 5 April 2011, 16:00–17:30, Clubroom
and quantitative expression profiling isoffered with specially designed 3’-fragmentcDNA libraries, but also with standard mRNAsequencing protocols. Non-coding cDNAlibraries with longer than the standard 29 bpallow the analysis of non coding RNAs thatare not detectable with alternative sequenc-ing technologies.
As a certified NimbleGen service providerfor targeted enrichment and sequencing, the
Latest developments in NGS Sequencing
ó Eurofins MWG Operon, a global genomicsservice provider with the longest experiencefor Roche/454 sequencing technology in themarket has updated his sequencing machinepark and is offering now sequencing withRoche GS Junior and enhanced TAT service.
Built around meanwhile 3 Roche sequenc-ing machines Eurofins MWG Operon offers abroad portfolio for de novo sequencing of viral,bacterial and fungal genomes, as well as bioin-formatics analysis services like SNP identifi-cation, strain comparison and annotation ofgenomes.
Sequencing experience with bar-codedsamples allows multiplexing of different sam-ples like BAC clones, phages or smallgenomes, but also multiplexing of differenttypes of libraries in one lane, like shotgunand long paired-end libraries.
As transcriptome analysis and expressionprofiling by next generation sequencingbecomes more and more important, the con-struction and sequencing of cDNA librariesfor the identification of full length mRNAsand expression profiling is an important partof the portfolio. Meanwhile the protocols fornormalised cDNA and small RNA libraries,originally developed for GS FLX sequencing,are now also available for Illumina HiSeq 2000technology.
Illunima HiSeq 2000 services have becomepart of our broad product portfolio. Qualitative
sequencing of any genomic region of choice,as well as the proprietary complete exomesequencing is offered. In a exclusive world-wide strategic partnership with GenomatixSoftware GmbH high quality data mappingand data mining of target enriched samplesequencing and data analysis is available.
A selected number of examples will be pre-sented during the seminar. ó
Jahrestagung der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie
Annual Conference of the Association for General and Applied Microbiology (VAAM)
EINLADUNG/INVITATION
18–21 MARCH 2012• TÜBINGEN
www.vaam2012.de
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Topics• Bacterial Differentiation• Cell Envelope• Human Microbiota• Metabolic Regulation and Signalling
• Microbial Pathogenicity• Microbial Survival Strategies• Secondary Metabolites• Soil Microbiology
16 AUS DEN FACHGRUPPEN DER VAAM
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Fachgruppe: Fungal Biology and Biotechnology/Experimentelle Mykologie
deen) gewonnen, der einen Vortrag überOomyceten und ihre Pathogenität halten wird.Anschließend werden Kurzvorträge von Dok-toranden stattfinden, die anhand der einge-reichten Abstracts ausgewählt wurden.
Im Anschluss an das Minisymposium wirddie Fachgruppensitzung stattfinden. Auf derTagesordnung steht die Wahl der Fachgrup-pensprecher. Zudem sollen Ideen für künfti-ge Veranstaltungen diskutiert werden, ins-besondere Themenvorschläge für ein Mini-Symposium zur VAAM-Frühjahrstagung 2012in Tübingen.
Für den Herbst 2011 ist bereits die Tradi-tionstagung “Molecular Biology of Fungi” inPlanung. Vom 11.–14. September lädt dazuMichael Bölker nach Marburg ein. Informa-tionen unter: [email protected] ó
ó Es ist das Ziel unserer Fachgruppe, jun-gen Nachwuchswissenschaftlern, d.h. Dokto-randen, Post-Docs und Habilitanden, zweimalim Jahr ein Forum zur Diskussion eigenerErgebnisse zu bieten.
Im Jahr 2010 wurde dieses Ziel mit demHerbst-Symposium “Biotransformation byFungal Cells or Fungal Enzymes” in Senften-berg und mit dem Minisymposium “Fungi inthe Environment” im Rahmen der Früh-jahrstagung in Hannover erreicht.
Zur Frühjahrstagung in Karlsruhe fin-det das Fachgruppensymposium “FungalDevelopment and Pathogenicity Mechanisms”statt. Der frisch habilitierte Nachwuchswis-senschaftler Matthias Brock (Jena) wird eszusammen mit Stefanie Pöggeler (Göttingen)am Montag, den 4. April 2011, leiten. Als Gast-sprecher wurde Dr. Pieter van West (Aber-
Sprecher: Klaus-Peter Stahmann,Hochschule Lausitz
Email: [email protected]
Stellvertetende Sprecherin:Ursel Kües, Universität GöttingenEmail: [email protected]
Fachgruppe: Funktionelle GenomanalyseMetagenomik zur Charakterisierung von Can-didatus-Stämmen aus Metagenomsequenzen(F. Meyer, Argonne National. Laboratory, USA)und kombinierter Genom-Proteom-Analyse(L. Wöhlbrand, ICBM, Oldenburg) runden dasProgramm ab.
Die Mitglieder der Fachgruppe sowie Inter-essenten an der künftigen Gestaltung derFachgruppenveranstaltungen werden imAnschluss an das Symposium zur Mitglie-derversammlung der Fachgruppe eingeladen,
ó Die Fachgruppe ‚Funktionelle Genoma-nalyse’ wird bei der Jahrestagung in Karlsru-he ihr zwölftes Minisymposium abhalten, mitdem Thema “Standards for Large Scale (Meta-)Genomics and Metadata”. Die Veranstaltungwird einen Einblick in die Arbeit des “Geno-mic Standards Consortium” bieten (FO Glöck-ner, MPI Bremen), sowie neue Wege der Publi-kation und Verbreitung standardisierterGenominformation aufzeigen (G. Garrity,Univ. Michigan, USA). Beispiele angewandter
bei der die Wahl der Fachgruppenvertreterfür die nächsten Jahre stattfinden wird. ó
Sprecher: Hans-Peter Klenk, Deutsche Sammlung vonMikroorganismen undZellkulturen (DSMZ),BraunschweigEmail: [email protected]
Fachgruppe: Hefenmit dem Thema “Infectious agents and modelorganisms in medical research” durchgeführt.Des Weiteren haben Mitglieder der Fach-gruppe Hefen das Jubiläumssymposium zum10-jährigen Bestehen des französischen Hefe-konsortiums Genolevure (10.11.2011) mit orga-nisiert.
In 2011 soll im Herbst eine gesonderte Fach-gruppentagung stattfinden. Für 2013 wirdunter Mitwirkung der Fachgruppe Hefe erst-malig seit 1976 die internationale Hefekonfe-renz wieder in Deutschland (Frankfurt) statt-finden. ó
ó Hefen haben eine große Bedeutung in derBiotechnologie, und sie sind als Eukaryotenwichtige Modellorganismen in der Zellbiolo-gie. Darüber hinaus nimmt die Bedeutungeiniger Hefen als human- und pflanzenpa-thogene Infektionskeime stetig zu. Die Fach-gruppe Hefe fasst die Mitglieder der VAAMzusammen, die mit Hefen als Mikroorga-nismus an diesen Fragestellungen arbeitenund umfasst zurzeit 69 Mitglieder. Bei derletzten VAAM-Tagung in Hannover wurdegemeinsam mit Fachgruppe EukaryotischeKrankheitserreger der DGHM ein Symposium
Sprecher: Karl-Dieter Entian, J.W. Goethe-UniversitätFrankfurtEmail: [email protected]
Stellvertretender Sprecher: Bernd Schäfer, RWTH AachenEmail: [email protected]
17
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Fachgruppe: Mikrobielle Pathogenität (gemeinsam mit derDGHM – Deutschen Gesellschaft für Hygiene undMikrobiologie)
“Regulation und Signaltransduktion in Pro-karyoten” der VAAM (“Cell-cell communica-tion”) statt. Zudem wurde aus der Fachgrup-pe heraus eine Vielzahl qualitativ hochwer-tiger Poster präsentiert. Zukunftsweisend wardie gemeinsame Fachgruppensitzung derzuvor nur lose interagierenden Fachgruppen“Mikrobielle Pathogenität” der DGHM undVAAM. Hier wurden die großen Gemeinsam-keiten dieser beiden Fachgruppen herausge-arbeitet und der Wille bekräftigt, sich zukünf-tig als gemeinsame Fachgruppe zu verstehenund für ein engeres Zusammengehen der bei-den Fachgesellschaften einzutreten.
Ein wichtiges sichtbares Zeichen für dieseenge Zusammenarbeit war die Ausrichtungder alle zwei Jahre stattfindenden Fachgrup-pentagung in Bad Urach vom 21.6. bis23.6.2010. Die Tagung bot bereits zum fünf-ten Mal gerade jungen Nachwuchswissen-schaftlern aus Medizin und Naturwissen-schaften die Möglichkeit, ihre Ergebnisse inentspannter und diskursiver Atmosphäre zupräsentieren und zu diskutieren. Als Zeichender besonderen Bedeutung der Förderungjunger Wissenschaftler wurde im Rahmender Tagung zum zweiten Mal der “Sanofi-Aventis Förderpreis” verliehen. Preisträgersind Dipl. Biol. Inga Jensch, Greifswald undDipl. Biol. Marc Burian, Tübingen. Die Fort-
ó Die Fachgruppe “Mikrobielle Pathoge-nität” zählt zu den ältesten Fachgruppen derVAAM und ist ebenfalls die älteste und mit350 Mitgliedern auch die größte Fachgruppeder DGHM. Molekulare Mechanismen derErregervirulenz stellen den wissenschaft-lichen Schwerpunkt dar. Neben klassischenThemen der mikrobiellen Pathogenität (Toxin-funktionen, Adhäsion, Regulation von Viru-lenzgenen) ist die zelluläre Mikrobiologie einebedeutende Forschungsrichtung; Fragen zurWechselwirkung zwischen mikrobiellen Erre-gern und eukaryotischen Wirtszellen stehendabei im Mittelpunkt.
Wie auch in den Jahren zuvor hat die Fach-gruppe aktiv zentrale Veranstaltungen zu Fra-gen mikrobieller Pathogenität mitgestaltet.So war die Fachgruppe im März des Jahres2010 wesentlich an der erfolgreichen Orga-nisation und Durchführung der gemeinsamenJahrestagung von DGHM und VAAM beteiligt.Gemeinsam wurden drei Sessions zu wichti-gen aktuellen Themen wie “Pathogen-indu-ced host cell signalling”, “The cell envelope inbacterial infections” und “Bacterial metabo-lism and infection” ausgerichtet. Danebenfanden gemeinsame Sessions mit der Fach-gruppe “Gastrointestinale Infektionen” derDGHM (“Microbial pathogenesis and gastro-intestinal infections”) und der Fachgruppe
setzung der Veranstaltungsreihe 2012 ist inPlanung.
2011 wird sich die Fachgruppe schwer-punktmäßig mit der Organisation der DGHM-Jahrestagung in Essen und der VAAM-Jah-restagung in Karlsruhe beschäftigen. Im Rah-men dieser Veranstaltungen sollen auch wei-tere Möglichkeiten gemeinsamer Aktivitätenund Initiativen diskutiert werden. ó
Sprecher VAAM: Andreas Peschel, UniversitätTübingenEmail: [email protected]
Stellvertretende Sprecherin: Petra Dersch, HZI Braun-schweigEmail: [email protected]
Sprecher DGHM: Volker Kempf, Universität Frankfurt; Sven Hammerschmidt, Universität Greifswald;
www.VAAM.deAktuelles über• Wissenschaft im Allgemeinen und Mikrobiologie im Besonderen• Tagungen und Workshops• Institute und Fachgruppenund vieles mehr finden Sie auf der VAAM-Homepage.
Schauen Sie doch mal rein!
18 AUS DEN FACHGRUPPEN DER VAAM
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Fachgruppe: Qualitätssicherung und Diagnostikeine solche gerade angetreten haben, sindeingeladen, an diesem Erfahrungsaustauschteilzuhaben.
Zur Jahrestagung der VAAM 2010 in Han-nover fand eine Fachgruppensitzung gemein-sam mit der entsprechenden Fachgruppe derDGHM statt. Sechs Vorträge aus dem The-menbereich molekularer Diagnostik (PCR)und Fragen der Qualitätssicherung stießenauf ein breites Interesse. Insgesamt nahmenetwa 30 Teilnehmer an dieser Veranstaltungteil. Durch das gemeinsame und offene Dis-kutieren der Themen verlief dieses Treffensehr erfolgreich, da sich zudem die Mitgliederder beiden Fachgruppen einander besser ken-nenlernen konnten.
Im November fand das jährliche und gutbesuchte Treffen der VAAM-FG in Berlin statt.Hier diskutierten 25 Teilnehmer anhand vonacht Vorträgen “Probleme und Erfahrungenmit diagnostischen Systemen”, und die Teil-nehmer knüpften untereinander neue Kon-takte.
Im Rahmen dieses Treffens wurdenauch Fachgruppensprecher und -stellver-treter neu gewählt. So wurden der lang-jährige Fachgruppenleiter Dr. GerhartHeinz und sein Stellvertreter Dr. MichaelRieth verabschiedet und mit Prof. Dr. SteffenProwe (Leitung) und Dr. Andreas Seiffert-Stö-riko (Vertreter) ein neues Sprecherteamgewählt.
ó Die Fachgruppe beschäftigt sich mitaktuellen Fragen und Entwicklungen aus demThemenbereich Qualitätssicherung und Dia-gnostik. Zur mikrobiologischen Qualitätssi-cherung gehören beispielsweise Prüfungenvon Rohstoffen und Medien (z. B. Wasser) fürdie Herstellung von pharmazeutischen Wirk-stoffen oder die Überwachung von Reinräu-men. Wenn es hier zu Grenzwert-Über-schreitungen kommt, müssen aufgrund dermikrobiologischen Analyseergebnisse Lösun-gen für korrigierende und vorbeugende Maß-nahmen gefunden werden. Erfahrungen dazuwerden innerhalb der Fachgruppe diskutiert,und anhand derer können Lösungen erarbei-tet werden.
Die Identifizierung (un)bekannter Kolonienauf einer Agarplatte in möglichst kurzer Zeitist eine ständige Herausforderung nicht nurin der Industrie und daher ein Schwerpunktinnerhalb der Fachgruppe. Die Erfahrungenmit sich ständig weiterentwickelnden dia-gnostischen Systemen tauschen wir ebenfallsaus. Hier ergeben sich auch immer wiederKontakte zur Forschung und Entwicklungsowie zu Unternehmen aus dieser Branche.
Mikrobiologen und andere Fachkollegen,die sich für derartige Fragestellungen inter-essieren, sind als neue Mitglieder in der Fach-gruppe herzlich willkommen. Auch VAAM-Mitglieder, die sich für eine entsprechendePosition in der Industrie interessieren oder
Zukünftig will die Fachgruppe weiterhinmindestens einmal jährlich zusammenkom-men. Hierzu sollen möglichst auch Wissen-schaftler und Kollegen aus der Industrie ange-sprochen werden, die in thematisch ähnlichausgerichteten anderen Fachgruppen aktivsind. Dabei wird an eine Vertiefung der Kon-takte zur DGHM und dem Curriculum derpharmazeutischen Mikrobiologen (CPM) alsauch Kooperationen mit weiteren Fachver-bänden gedacht. Zudem soll hierdurch u. a.die regelmäßige Kommunikation zwischenden Mitgliedern aktiviert werden. Das näch-ste Treffen findet im September 2011 inFrankfurt in den Räumen der Provadis-Hoch-schule statt. ó
Sprecher: Steffen Prowe, Beuth Hoch-schule, BerlinEmail: [email protected]
Stellvertretender Sprecher: Andreas Seiffert-Störiko,Sanofi-Aventis DeutschlandEmail: [email protected]
Fachgruppe: Regulation und Signaltransduktion in Prokaryotenniedermolekulare Verbindungen, die der Sig-nalübertragung innerhalb von Zellen dienen.Dabei beeinflussen Second Messengers eineVielzahl von intrazellulären Signaltrans-duktionsprozessen, was gleichzeitig der Sig-nalverstärkung und –integration dient. ZurThematik der Second Messenger ist es unsgelungen, zwei in diesem Gebiet internatio-nal führende Wissenschaftler zu Über-sichtsvorträgen einzuladen: Urs Jenal, Bio-zentrum Basel, Schweiz, wird über c-di-AMPim Zusammenhang mit Beweglichkeit, Zell-zyklus und Differenzierung sprechen.Andrew Camilli, Tufts University School ofMedicine, Boston, USA, wird über die Bedeu-tung von Second Messengern in Vibrio cho-lerae berichten. Das Programm des Sympo-siums wird mit einem Kurzvortrag von SvenDeCausmacker, Universität Gießen, zum The-
ó Im Rahmen der Fachgruppe fand im Ok-tober des vergangenen Jahres das 28. Sym-posium “Mechanisms of Gene Regulation”statt, das dankenswerter Weise GottfriedUnden, Universität Mainz, organisierte. Auchdieses Mal hatte dieses Symposium einenäußerst großen Zuspruch, was sich in fünfPlenarsprecher/innen und mehr als 100 teil-nehmenden Doktoranden/innen und Post-doktoranden/innen widerspiegelte. Das näch-ste 29. Symposium wird 2012 in Münchenunter der Leitung von Thorsten Mascher,München, organisiert werden.
Während der VAAM-Tagung 2011 in Karls-ruhe findet ein interessantes Symposiumzum Thema “Second Messengers” statt, eineGemeinschaftsveranstaltung unserer Fach-gruppe und der Fachgruppe “MikrobiellePathogenität”. Second Messenger sind
ma c-di-GMP in der Phototaxis von Synecho-cystis komplettiert.
Im Anschluss an dieses Fachgruppensym-posium findet die diesjährige Mitgliederver-sammlung unserer Fachgruppe statt, zu derich Sie herzlich einlade. ó
Sprecherin: Kirsten Jung, Ludwig-Maximilians-Univer-sität MünchenEmail: [email protected]
Stellvertretender Sprecher: Franz Narberhaus, Universität BochumEmail: [email protected]
19
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Fachgruppe: Struktur und MikroskopieMakromolekülkomplexe. Inzwischen eröffnetsich auch die Möglichkeit, die strukturellenDaten in Simulationen (von Teilen) des Cyto-plasmas zu nutzen und seine Dynamik aufmolekularem Niveau zu untersuchen. DreiÜbersichtsvorträge befassen sich mit dergegenwärtigen Forschung zu diesen Aspek-ten:
Julio Ortiz (MPI für Biochemie, Martins-ried) wird über die Bildung von Ribosomen-Clustern in stoffwechselaktiven und hun-gernden Bakterien berichten, die mit Kryo-Elektronentomographie nachgewiesen und inihrer 3D-Struktur untersucht wurden. JohanElf (Universität von Uppsala, Schweden) ver-folgt mit Einzelmolekül-Nachweisen im Fluo-reszenzmikroskop die Diffusion und Reak-tionskinetik markierter Proteine in Zellenund simuliert ihr Verhalten. Zan Luthey-Schulten (University of Illinois, Urbana, USA)gibt einen Einblick in die jüngsten Ergebnisseihrer Simulationen der Dynamik des mikro-
ó Die Fachgruppe widmet sich Themen dermikrobiellen Strukturforschung und Metho-den der Mikroskopie und bietet mit ihrenMinisymposien Einblicke in aktuelle Ent-wicklungen. In diesem Jahr behandelt dasFachgruppen-Symposium “Die Struktur desCytoplasmas”. Das mikrobielle Cytoplasmasteht schon lange im Verdacht, geordneter zusein, als es sich uns vermeintlich darbietet.Die Schwierigkeit besteht darin, die Anord-nung und Interaktion der Makromolekülesichtbar zu machen und ihre dynamische Ent-wicklung zu verfolgen, sodass auch weiträu-mige Strukturen und Muster im Kontext derFülle von Proteinkomplexen in intakten Zel-len erkennbar werden. Fluoreszenzmikros-kopie und ihre hochauflösenden Varianten(STED, PALM, STORM) können Informationenüber die Lokalisation markierter Proteine inMikroorganismen liefern, die Methode derKryo-Elektronentomographie die dreidimen-sionale Verteilung und Struktur größerer
biellen Cytoplasmas, die nur mit fortschritt-licher Rechnerarchitektur zu bewältigen sindund einen faszinierenden Ausblick aufzukünftige Entwicklungen bieten. Die Vor-tragenden sind führende Experten in ihrenForschungsgebieten, die nicht unbedingt imZentrum der Mikrobiologie angesiedelt sind,uns aber Zugang zur inneren Struktur undOrganisation mikrobieller Zellen verschaffen.
Im Anschluss an das Symposium veran-stalten wir ab 19.30 Uhr im gleichen Raumein Mitgliedertreffen der Fachgruppe. ó
Sprecher: Harald Engelhard, MPI für Biochemie,MartinsriedEmail:[email protected]
Fachgruppe: Symbiotische Interaktionender Fachgruppe umfassen beispielsweise dieStoffwechselinteraktionen zwischen mikro-biellen Symbionten und Wirt sowie derMikroorganismen untereinander, die Bedeu-tung des Quorum Sensings für die Bakterien-Wirt-Interaktion und die Aufklärung derInteraktionen im bakteriellen Biofilm desgesunden Wirtes. Dabei stehen die Vorstel-lungen der jeweiligen Modellsysteme, derAbgleich der Symbiose-Systeme untereinan-der und die angewendeten Methoden im Zen-trum der Aktivitäten. Nach dem erstenVAAM-Fachgruppen-Treffen im November2009 in München fand das zweite Meetingim September 2010 in Würzburg statt. Andiesem Treffen nahmen über 90 Teilnehmerteil und präsentierten ihre Arbeiten in 25Vorträgen und 22 Postern. Die Fachgruppepräsentiert sich im Jahr 2011 auf der VAAM-Jahrestagung in Karlsruhe. Die Mitgliederder Fachgruppe sowie Interessenten an der
ó Die derzeit jüngste VAAM-Fachgruppe(gegr. Dezember 2009) umfasst aktuell ca.60 Mitglieder aus Universitäten, For-schungseinrichtungen und der Industrie. Pri-märes Ziel der Fachgruppe ist es, einen regel-mäßigen Kontakt und Austausch zwischendeutschen und internationalen Arbeitsgrup-pen zu fördern, die Arbeiten der Fachgruppeinternational sichtbar zu machen undgemeinsame Fortbildungsveranstaltungenfür den wissenschaftlichen Nachwuchsdurchzuführen. Die Forschungsaktivitätensind, ebenso wie die Fachgruppe selbst, ander sich neben Mikrobiolog/inn/en auchMediziner/innen und Tiermediziner/innenaktiv beteiligen, stark interdisziplinär aus-gerichtet. Im Vordergrund stehen die vielfäl-tigen Interaktionen von Mikroorganismenmit tierischen oder pflanzlichen Wirten, diepathogen, mutualistisch oder kommensalausgeprägt sein können. Die Themenfelder
künftigen Gestaltung der Fachgruppe sinddazu herzlich eingeladen.
Weitere Informationen unter: http://www.helmholtz-muenchen.de/en/symbiotic-inter-actions/home-aims/index.html ó
Sprecher: Ute Hentschel-Humeida, Universität WürzburgEmail: [email protected]
Stellvertretender Sprecher: Andreas Schwiertz, Institut für MikroökologieEmail: [email protected]
20 AUS DEN FACHGRUPPEN DER VAAM
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Fachgruppe: UmweltmikrobiologieIm September 2011 findet das International
Symposium on Subsurface Microbiology(ISSM) in Garmisch-Partenkirchen statt, zudem alle Mitglieder herzlich eingeladen sind(www.issm2011.com). Hier wird mikrobielleÖkologie von marinen Sedimenten über tie-fe terrestrische Habitate bis zu flachenGrundwasserleitern diskutiert. Für 2012 istes geplant, zusätzlich zu einem Fachgrup-pensymposium auf der VAAM-Jahrestagungeine spezielle Fachgruppentagung zu orga-nisieren. Interessierte können sich gerne mitThemenvorschlägen an den Sprecher wen-den.
Bisher wurde die Fachgruppe von Prof.Engesser geleitet, der mit der VAAM-Tagung2011 auf eigenen Wunsch ausscheiden möch-te. Deshalb wird im Anschluss an die Fach-
ó Die Fachgruppe Umweltmikrobiologie bie-tet ein breites Forum, das von der Mikrobiel-len Ökologie bis zu umweltrelevanten Stoff-wechselwegen oder praktischen Anwendun-gen reicht. Ein Ziel der Fachgruppe ist, denintensiven Austausch zwischen diesen Fach-bereichen zu fördern und mit Veranstaltungenzu neuen Themen zu unterstützen.
Umweltmikrobiologie ist bereits bei denPlenarvorträgen ein Schwerpunkt dieserVAAM Tagung. Zusätzlich findet am Montag,04. April, von 17:30 bis 19:30 ein Fachgrup-pensymposium zum Thema “Relevance of eco-logical principles in environmental micro-biology” statt. Mit Christoffer van der Gast,UK, und Alban Ramette, MPI Bremen als ein-geladene Redner sowie weiteren Beiträgenverspricht dieses sehr interessant zu werden.
gruppenveranstaltung ab 19.30 Uhr die Wahldes neuen Sprechers stattfinden, zu der wirherzlich einladen. ó
Sprecher: Karl-Heinz Engesser, Uni StuttgartEmail: [email protected]
Stellvertretender Sprecher: Rainer Meckenstock, Helmholtz-Zentrum MünchenEmail: [email protected]
Der VAAM-DECHEMA-Gemeinschaftsausschuss:Biotransformationen
nisse in Produkte umzusetzen. An biokata-lytischen Verfahren führt dabei kein Weg vor-bei, sie bilden die Grundlage der modernenIndustriellen Biotechnologie. Das sehr inter-disziplinäre Forschungsgebiet der Biotrans-formationen erlebt zurzeit ein rasantesWachstum, dem auch moderne Methoden wieMetagenomanalyse und Protein-Engineeringgroße Impulse verleihen. Durch den Zu-sammenschluss der beiden Gremien der gro-ßen Fachgesellschaften kann dieses Arbeits-gebiet nun wesentlich besser und effektiververtreten werden und es können Forscheraus Universitäten, Forschungseinrichtungenund der chemisch-pharmazeutischen Indus-trie nun noch enger zusammengeführt wer-den, was bereits in einer Reihe von Veran-staltungen gemeinsam mit anderen Aus-schüssen der DECHEMA und Fachgruppender VAAM geschehen ist, über die im Bio-spektrum berichtet wurde. Ziel dabei ist vorallem, durch spezielle Symposien für Dokto-randen, Habilitanden und Juniorprofessorenjunge Forscher zu fördern.
ó Im November 2008 haben die seit 1996bestehende VAAM-Fachgruppe “Biotransfor-mationen” mit zuletzt 130 gemeldeten Mit-gliedern und der DECHEMA-Arbeitsaus-schuss “Grundlagen der biotechnologischenStoffproduktion” in Frankfurt am Maingemeinsam den neuen Gemeinschaftsaus-schuss “Biotransformationen” gegründet.Gewählte Sprecher sind von DECHEMA-Sei-te zurzeit Prof. Dr. Andreas Liese (TU Ham-burg-Harburg) und von VAAM-Seite Prof. Dr.Christoph Syldatk (Karlsruher Institut fürTechnologie KIT). Im gemeinsamen Aus-schuss sind neben Mitgliedern aus der Indus-trie maßgeblich auch Vertreter der Gesell-schaft Deutscher Chemiker (GDCh) und derGesellschaft für Fettwissenschaften (DGF)engagiert. Dieses Zusammengehen ver-schiedener Fachdisziplinen lag nahe: Diewachsende Nachfrage nach ökonomischen,ökoeffizienten und ressourcenschonendenProzessen in der Chemie-, Pharma-, Energie-und Lebensmittelindustrie erfordert ver-stärkte Anstrengungen, Forschungsergeb-
Für 2011 sind die Beteiligung an einerDECHEMA-Vortrags- und Diskussionstagungzum Thema “Bioverfahrenstechnik an Grenz-flächen” vom 30.05. bis 01.06.2011 in Pots-dam geplant, sowie die Durchführung einerinternationalen interdisziplinären Sommer-schule für Promovierende und junge Wissen-schaftler aus der Industrie zum Thema “Bio-katalyse” vom 22. bis 25.08.2011 in BadHerrenalb. ó
Sprecher VAAM: Christoph Syldatk, Universität KarlsruheEmail:[email protected]
Sprecher DECHEMA: Andreas Liese, TU Hamburg-HarburgEmail: [email protected]
Building Insights. Breaking Boundaries. Elsevier.
www.elsevier.de/syapm
ISSN 0723-2020System. Appl. Microbiol.33(2010)5pp. 237–290
Executive Editors:Rudolf Amann,Bremen, Germany
Ramon Rosselló-Móra,Esporles, Spain
Karl-Heinz Schleifer,Freising, Germany
August 2010
33/5
From the Contents Volume 33, Issue 5
p Prediction of whole-genome DNA G + C content within the genus Aeromonas based on housekeeping gene sequences
p Meiothermus granaticius sp. nov., a new slightly thermophilic red-pigmented species from the Azores
p ���������� ���������� ����� ��������������strains Agrobacterium radiobacter K84 and Agrobac-terium tumefaciens AKE10 into the species Rhizobium rhizogenes
Executive Editors:Karl-Heinz Schleifer, MünchenRudolf Amann, BremenRamon Rosselló-Móra, Esporles
Complimentary access to articles published in issue 1 of each volume via SciVerse ScienceDirectwww.sciencedirect.com
Call for PapersYou are invited to submit your manuscripts online tohttp://ees.elsevier.com/syapm/
www.elsevier.com/locate/syapmISSN 0723-2020
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Aims & Scope
Scope of the Journal: Systematic and Applied Microbiology deals with various aspects of microbial diversity and systematics of prokaryotes. It focuses on Bacteria and Archaea; eukaryotic microorganisms will only be considered in rare cases. The journal perceives a broad understanding of microbial diversity and encourages the submission of manuscripts from the following branches of microbiology:
Systematics: Theoretical and practical issues dealing with classifi cation and taxonomy, i.e. (i) new descriptions or revisions of prokaryotic taxa, including descriptions of not-yet cultured taxa in the category Candidatus (ii) innovative methods for the determination of taxonomical and genealogical relationships, (iii) evaluation of intra-taxon diversity through multidisciplinary approaches, (iv) identifi cation methods.
Applied Microbiology: all aspects of agricultural, industrial, and food micro-biology are welcome, including water and wastewater treatment.
Comparative biochemistry and genomics: studies concerning biochemical/metabolic and genomic diversity of cultured as well as yet-uncultured Bacteria and Archaea.
Ecology: descriptions of the microbial diversity in natural and man-made ecosys-tem; studies quantifying the size, dynamics, and function of microbial populations; innovative research on the interaction of micro-organisms with each other and their biotic and abiotic environment.
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BIOspektrum | Tagungsband 2011
Microbiology in Karlsruhe’s technical environmentmicrobiological interests, ranging from basicresearch with bacteria and fungi, pathogenicand symbiotic interactions, to applied aspectsand bioengineering, offer a broad educationfor the students and the possibility to trans-form ideas into products at KIT. We are veryhappy to host the annual VAAM meeting thisyear in Karlsruhe!
Prof. Dr. Reinhard Fischer,
Cell biology of filamentous fungi
Institute for Applied Biosciences, Dept. of
Microbiology, Faculty of Chemistry and
Biosciences; www.iab.kit.edu/microbio/
Filamentous fungi are extremely polarizedeukaryotic cells that continuously elongatetheir hyphal tips. The Aspergillus researchgroup studies the cell biology underlyingpolarized growth, which is driven by the con-certed action of microtubules, actin and thecorresponding motor proteins that deliverenzymes for cell wall biosynthesis to the cor-tex. Recently, it was discovered that at leasttwo different populations of microtubulesexist in the hyphae of Aspergillus nidulans.
A. nidulans is able to initiate different mor-phogenetic programs and develop either asex-ual or sexual spores. One environmental trig-ger for these processes is light. The grouprecently identified phytochrome as one of theimportant photoreceptors in this fungus,which shows that phytochrome also functionsoutside the plant kingdom.
Prof. Dr. Jörg Kämper,
Molecular Phytopathology
Institute for Applied Biosciences, Dept. of
Genetics, Faculty of Chemistry and Bio-
sciences; http://genetics.iab.kit.edu/
The basidiomycete Ustilago maydis is a ubiq-uitous pathogen of maize and a well-estab-lished model organism for the study of plant-microbe interactions. This fungus belongs tothe group of biotrophic parasites that dependon living tissue for proliferation and devel-opment. Pathogenic development in U. maydisis linked to a dimorphic switch from buddingto filamentous growth. The main interest ofthe Molecular Phytopathology group is tounderstand the regulatory networks that linkpathogenic development and the morpholog-ical changes of the fungal cell. Expressionprofiling, in combination with reverse genet-ic approaches, has led to the identification ofvarious novel pathogenicity factors. Anotherfocus of the group is the metabolic repro-
ó The University of Karlsruhe, presentlyknown as the Karlsruhe Institute of Technol-ogy (KIT), was founded in 1825 as a poly-technical school. In 1832, the first biologicaldiscipline, the school of Forest Science, wasincorporated into the Polytechnical School.The chair of Botany, held by Alexander Braun(1833 – 1846), lectured topics in botany andzoology. In 1872, Pharmacy was added, andbefore the end of the 19th century, the Botanyand Zoology departments were split into twoteaching units. In 1890, Walter Migula, a pio-neer in bacterial systematics, habilitated inbotany and served as professor until 1904; hedescribed the important bacterial genusPseudomonas in 1895. Forestry was latermoved to Freiburg and Pharmacy to Heidel-berg. After World War II, teaching startedagain, and in 1956 H. Kühlwein was appoint-ed as the Chair of Botany. Although a profes-sor of botany, Kühlwein became internation-ally recognized for his work on Myxobacte-ria. One of his Ph.D. students, H. Reichen-bach, continued research with these glidingbacteria at the GBF in Braunschweig.Kühlwein also studied the physiology of somewood-degrading fungi.
In 1967, the university was restructuredand renamed University of Karlsruhe, and sev-eral new Chairs were appointed, among thema new Chair of Microbiology, W. Zumft. One ofthe charms of KIT is that within CampusSouth (the former University of Karlsruhe)microbiologists are not only members of theFaculty of Chemistry and Biosciences, butalso of the Faculties of Chemical Engineering(Institute of Life Sciences Engineering), Civ-il Engineering, and Geo- and EnvironmentalSciences (Institute of Biology for Engineersand Biotechnology of Wastewater Treatment).They are also situated at Campus North (for-merly Forschungszentrum Karlsruhe), at theInstitute for Functional Interfaces, and closeto Campus South, at the Max-Rubner Insti-tute (formerly Bundesanstalt für Ernährungund Lebensmittel). Other microbiologyresearch groups are located in the Water Tech-nology Center (TZW) Karlsruhe or at Geil-weiler Hof. Since various groups employmicroorganisms in a range of technicalprocesses, there are many established col-laborations with industry. This is also reflect-ed in the fact that researchers from the BASFSE company are integrated into the teachingprogram of the University and are membersof this organizing committee. These wide
gramming of the maize plant by U. maydis,and the utilization of carbon sources by thefungus during pathogenic development.
Prof. Dr. Natalia Requena.
Molecular biology of plant-fungal
interactions
Botanical Institute, Dept. of Plant-
Microbe Interactions, Faculty of
Chemistry and Biosciences;
http://www.iab.kit.edu/heisenberg/
Microorganisms often live in association withplants either in mutualistic symbioses or asparasites. The focus of the plant-fungal inter-actions group is the arbuscular mycorrhizalsymbiosis that involves the fungi of the Glo-meromycota phylum and most plant roots.The colonization of a root by arbuscular my-corrhizal fungi involves a deep reorganizationof the plant cell to accommodate the symbiontand to provide the fungus with photoassimi-lates. The group of Natalia Requena is inter-ested in unraveling the recognition mecha-nisms and involved molecules that character-ize this symbiosis. How have plants learned todistinguish between pathogenic and mutua-listic fungi? How have some pathogens learnedto escape the defense response of the plant?The group uses as model organisms the arbus-cular mycorrhizal fungus Glomus intraradicesand the hemibiotrophic pathogenic fungusMagnaporthe oryzae.
Prof. Dr. Tilman Lamparter,
Photobiology of plants and bacteria
Botanical Institute, Faculty of Chemistry
and Biosciences; http://www.rz.uni-
karlsruhe.de/∼∼db127/
Agrobacterium tumefaciens is a soil bacteri-um and a plant pathogen that transfers genesinto plants. The photobiology research groupis interested in the photobiology of A. tume-faciens and of related nitrogen-fixing Rhizo-bia. The two phytochromes of A. tumefaciensserve as model proteins for biochemical stud-ies on chromophore protein interaction, pho-toconversion, modulation of histidine-kinaseactivity and tertiary structure. Initial studieshave led to the discovery of the chromophorebinding site of bacterial phytochromes, whichdiffers from that of plant phytochromes.Agrobacterium tumefaciens contains also twophotolyases, flavoproteins that repair UV-dam-aged DNA; these photolyases are also ana-lyzed as recombinant proteins. One of thephotolyases is closely related to plant cryp-
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BIOspektrum | Tagungsband 2011
tochromes, while the other probably providesan evolutionary link between photolyases andother DNA repair enzymes.
Prof. Dr. Christoph Syldatk,
Institute of Engineering in Life Sciences
(IBLT), Dept. of Technical Biology (Section
II); http://tebi.blt.kit.edu/index.php
The Section II – Technical Biology researchgroup is part of the Faculty of Chemical andProcess Engineering, and was founded in2003 as part of the new Institute of Engi-neering in Life Sciences. It is responsible forproviding the fundamentals biology to the“Engineering in Life Sciences” (BIW) students,and trains students of “Applied Biology” inenzyme technology and biochemical engi-neering. The primary research topics foraround 20 researchers in this group areMicrobial Biotechnology and Industrial Bio-catalysis. Here, microorganisms can be culti-vated under S-1- and S-2-conditions, up to 30-liters per day. These facilities include the pos-sibility of downstream processing of micro-bial cultures by centrifugation, filtration, celldisruption and immobilisation of microor-ganisms and enzymes, chromatographicpurification of proteins, and the basic equip-ment for molecular biological and geneticengineering experiments, such as standardHPLC-, TLC- and GC-analytical equipment, aswell as a special laboratory dedicated to stud-ies on the cultivation of marine sponges andassociated microorganisms.
Researchers working in the field of Micro-bial Biotechnology are currently developing aprocess to produce microbial bio-surfactants.They are also investigating aspects of the “in-vitro”-cultivation of marine sponges and therole of associated microorganisms, as well asthe production of special yeast and fungalmetabolites. In the field of Industrial Bio-catalysis, the focus is on production of unnat-ural α- and β-amino acids, the enzymatichydrolysis of linear and cyclic amides, as wellas enzymatic modification and synthesis ofsurface- and interfacial-active compounds,including aspects of enzyme immobilisation,such as to magnetic carriers, and processdevelopment.
Prof. Dr. Josef Winter,
PD Dr. Claudia Gallert,
Institute of Biology for Engineers and
Biotechnology of Wastewater Treatment
(IBA); http://www.iba.kit.edu
The research of IBA, Faculty of Civil Engi-neering, Geo- and Environmental Sciences of
KIT, is directed towards practically and tech-nically relevant aerobic and anaerobicprocesses for water, wastewater and bio-wastetreatment, microbial product recovery andsoil sanitation procedures. In this context,the following topics are currently under inves-tigation: bioremediation of soil that was con-taminated with anti-knocking agents fromleaded fuel production, biogas and bio-hydro-gen production from energy crops, bio- andmarket waste fractions, degradation of aro-matic/phenolic compounds in industrialwastewater, microbial chitin deproteinationand decalcification of shrimp shells of C. cran-gon (North Sea) or P. monodon (from Indone-sia), and nitrification of saline, ammonia-loaded wastewater. In addition, the fate ofarsenic and selenium in the groundwater ofthe Bengal delta and in northern India, andthe fate and the effect of antibiotics in domes-tic wastewater are investigated. Our researchis funded by DFG, BMBF, BMZ, AiF and indus-try.
Prof. Dr.-Ing. Clemens Posten,
Photo- and Particle Biotechnology
Institute of Engineering in Life Sciences
(IBLT), Dept. of Bioprocess Engineering,
Faculty of Chemical Process Engineering;
http://bvt.blt.kit.edu/
Microalgae show enormous potential for theproduction of high value products in the phar-maceutical and cosmetic industries, but areincreasingly discussed with regards to theirproduction of middle and low cost products,such as fine chemicals, food or animal feed.Closed photo-bioreactors are employed to pro-duce light and CO2 in large scale production.
In the research group of Clemens Posten,growth and product formation kinetics arestudied to understand the specific behaviorof microalgae, such as Porphyridium orChlamydomonas, under production condi-tions. Reactor design is optimized based onintra- and extracellular measurements; thus,the reactors are developed “around the cells”.
Prof. Dr. Ursula Obst,
Interface Microbiology
Institute for Functional Interfaces,
Campus North, Faculty for Chemical and
Process Engineering;
http://www.ifg.kit.edu/58_188.php
Biofilms are assemblies of adhesive microor-ganisms on surfaces, and are ubiquitous inthe environment. As biological filters, theyare part of natural and technical large-scaleprocessing systems; however, under certain
circumstances biofilms also represent germreservoirs that cause contamination ashygienically relevant bacteria. In medicine,bacterial biofilms are the causative agents ofimplant infections and chronic wounds thatare difficult to treat. As an extremely flexi-ble life form, resistant to a variety of externalstressors, natural biofilms are characterizedby our research group by focusing on theirstress and survival strategies, with applica-tion fields ranging from environment tobiotechnology and medicine.
Prof. Dr. Rolf Geisen,
Molecular Food Mycology
PD Dr. Charles Franz,
Plant Food Fermentation
Max Rubner Institut;
http://www.mri.bund.de/
The Max Rubner Institut is a governmentalresearch institute whose task is the analysisand assessment of health-promoting con-stituents of foods, as well as food quality andsafety assurance. Within the Department ofSafety and Quality of Fruit and Vegetables,which focuses on metabolomics of nutrition-ally important plant secondary metabolites,as well as microbiological safety of plant-derived products, the group of Prof. Dr. RolfGeisen is working on the regulation of fun-gal mycotoxin production in foods. The roleof food-relevant environmental conditions andtransmittance via signal transduction path-ways to regulate transcription of mycotoxinbiosynthetic genes are being analyzed. Theresearch group of PD Dr. Charles Franzfocuses on plant food fermentation and thedevelopment of starter cultures for malolacticfermentation of wine, to improve the qualityof wines. Other research is centred on theeffect of secondary plant compounds onhuman gut microflora biodiversity, as well asthe metabolism of these compounds by gutbacteria.
Dr. Andreas Tiehm,
Environmental Biotechnology
Dr. Beate Hambsch,
Drinking Water Microbiology
DVGW-Technologiezentrum Wasser
(TZW); www.tzw.de
The TZW is part of the Institute for AppliedWater Research of the DVGW, the GermanGas- and Waterworks Association. TheTZW provides a link between the fundamen-tal research undertaken at universitiesand water treatment companies. It is contactpoint for authorities, ministries and associa-
INSTITUTSPORTRAIT
BIOspektrum | Tagungsband 2011
tions with all questions concerning waterquality, resource protection and water tech-nology.
Current research projects focus onintrinsic and stimulated bioremediation ofchlorinated and tar oil pollutants, biodegra-dation of emerging pollutants, such aspharmaceutical residues, reuse of wastewater and aquifer recharge, detection/iden-tification of pathogens and indicator organ-isms, and development and application ofbio tests and molecular biological identi-fication methods.
Dr. Bernhard Nüßlein
nadicom GmbH; http://www.nadi-
com.com
nadicom is a leading international GMP-certified biotechnology company in thefield of genetic identification of bacteriaand fungi. nadicom specialises in molec-ular-biological identification of pure bac-terial and fungal cultures for the pharma-ceutical, food, and cosmetic industries, aswell as the research sector. We also pre-pare DNA fingerprints from pure cultures,environmental samples and complexmixed cultures to screen for genetic iden-tity. We have special expertise in con-tracted research in environmental andagricultural microbiology, directed at solv-ing client-defined problems.
DFG Research Unit 1341,
http://www.for1334.kit.edu/
This research unit was founded in 2010 byMeritxell Riquelme (Ensenada, Mexico)and Reinhard Fischer (KIT) and is a col-laborative action among five groups fromMexico and nine groups from Germany.The topic of this new alliance is molecular
analysis of the polarized growth of differ-ent filamentous fungi. Filamentous growthis adapted to different growth and devel-opmental conditions, and is highly modu-lated by internal and external signals.These signaling processes are part of ourresearch. Funding for the German groupsis provided by the DFG and by CONACYTfor the Mexican groups.
DFG Research Unit 831 “Dynamic
capillary fringes”
This interdisciplinary research unit wasformed in 2007 to investigate hydrogeo-logical, hydraulic, soil physical, hydrochemical and microbiological interactionsin the capillary fringe (CF). It is a cooper-ation program of KIT, the universities ofTübingen and Heidelberg, and HelmholtzCenter of Environmental Research, Halle.One of the main goals is to elucidate theinfluence of biofilm formation or bio sur-factant excretion by microorganisms onhydraulic, soil water- and geochemicalparameters in the CF, and to develop amathematic model that describes theseinteractions under changing conditions.
Priority research group of the Baden
Württemberg Stiftung;
http://www.iab.kit.edu/
A grant from the Baden WürttembergStiftung was used to create a priority pro-gram on secondary metabolites at the Karl-sruhe Institute of Technology, South Cam-pus. Groups from the Faculty of Chemistryand Biosciences, the Faculty for Bioengi-neering and the MRI collaborate to under-stand the genetics, production and toxi-cology of alternariol, a mycotoxin producedby Alternaria alternata. ó
Max RubnerInstitute
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4.
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VAAM 2011 Jahrestagung Karlsruhe (03.04.–06.04.2011)
CONFERENCE PROGRAMME
˘Sunday, 03.04.201114:00–18:30 Registration and mounting of the posters Foyer Stadthalle
Karlsruhe
PUBLIC LECTURE Brahms-Saal
15:30–16:00 Welcome AddressesV. SaileKarlsruhe Institute of Technology (KIT), Institute of Microstructure Technology, Karlsruhe, Germany
R. FischerKarlsruhe Institute of Technology (KIT), Institute of Applied Biosciences – Department of Microbiology, Karlsruhe, Germany
16:00–17:00 ISV01: H.C. FlemmingUniversity Duisburg-Essen, Faculty of Chemistry – Biofilm Centre, Duisburg, Germany“Die letzten Meter bis zum Wasserhahn: Mikrobiologie in der Trinkwasserleitung”
17:00–17:30 Coffee break
PLENARY SESSION: ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY Brahms-SaalChair: Josef Winter
17:30–18:00 ISV02: A. BoetiusMax Planck Institute for Marine Microbiology, Bremen, Germany“Microbial consumption of hydrocarbons in the deep sea: From methane seeps to oil spills”
18:00–18:30 ISV03: D. CowanUniversity of the Western Cape, Department of Biotechnology, Cape Town, South Africa“Metagenomics and Gene Discovery”
19:30 Welcome Reception Rathaus Stadt Welcome Address KarlsruheK. Stapf, City Mayor Karlsruhe
˘Monday, 04.04.2011
08:00–19:30 Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
08:30–10:30 Special Groups Mini Symposia (see page 31) various(followed by General Meeting of the Special Group Functional Genomics)
08:30–10:30 Short lectures (see page 35) various
10:30–11:00 Coffee break/Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
PLENARY SESSION: CELL BIOLOGYChair: Jörg Kämper
11:00–11:45 VAAM Honary Award Session
ISV04: M. Thanbichler Brahms-SaalMax Planck Institute for terrestrial Microbiology, Marburg, Germany“Spatial regulation in Caulobacter crescentus”
11:45–12:15 ISV05: P. Graumann Brahms-SaalAlbert-Ludwigs Universität Freiburg, Faculty of Biology, Freiburg, Germany“Intrinsic properties guide the function of bacterial cytoskeletal elements”
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BIOspektrum | Tagungsband 2011
VAAM 2011 Jahrestagung Karlsruhe (03.04.–06.04.2011)
CONFERENCE PROGRAMME
12:15–12:45 ISV06: S. Osmani Brahms-SaalOhio State University, Department of Molecular Genetics, Columbus, USA“Mitotic restructuring of the nucleus in the filamentous fungus Aspergillus nidulans”
12:45–14:15 Lunch break/Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
PLENARY SESSION: STRESS RESPONSEChair: Tilman Lamparter
14:15–14:45 ISV07: R. Hengge Brahms-SaalFreie Universität Berlin, Faculty of Biology, Berlin, Germany“The general stress response, biofilm formation and c-di-GMP signalling in Escherichia coli”
14:45–15:15 ISV08: E. Bremer Brahms-SaalPhilipps-Universität Marburg, Faculty of Biology, Germany“Driving up the pressure: genetic and cellular responses of Bacillus subtilisto osmotic stress”
15:15–17:30 Coffee break/Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
15:45–17:15 Karrieresymposium (see page 14) ClubraumVielfältige Berufsbilder in den Biowissenschaften – Anregungen und Tipps
15:15–17:30 Poster Session I Ground floor/2nd floor
17:30–19:30 Special Groups Mini Symposia (see page 31) various(followed by the General Meetings of the Special Groups:Fungal Biology, Environmental Microbiology, Structure and Microscopy,Regulation and Signal transduction in Prokaryotes)
17:30–19:30 Short lectures (see page 37) various
˘Tuesday, 05.04.2011
08:00–19:00 Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
08:30–10:30 Short lectures (see page 38) various
10:30–11:00 Coffee break/Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
PLENARY SESSION: WHITE BIOTECHNOLOGYChair: Clemens Posten
11:00–11:30 ISV09: C. Wittmann Brahms-SaalTechnische Universität Braunschweig, Institute of Biochemical Engineering, Braunschweig, Germany“Tailor-made cell factories for a sustainable bio-economy”
11:30–12:00 ISV10: C. Kubicek Brahms-SaalVienna University of Technology, Institute of Chemical Engineering, Vienna, Austria“Genome-wide aspects of cellulase regulation in Trichoderma reesei”
12:00–12:30 ISV11: C. Wilhelm Brahms-SaalUniversität Leipzig, Institute for Biology I, Leipzig, Germany“Energy balances from photon to biomass: lesson for biofuel production”
12:30–14:00 Lunch break/Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
30 CONFERENCE PROGRAMME
BIOspektrum | Tagungsband 2011
VAAM 2011 Jahrestagung Karlsruhe (03.04.–06.04.2011)
CONFERENCE PROGRAMME
PLENARY SESSION: MICROBIAL ECOLOGYChair: Ursula Obst
14:00–14:30 ISV12: S. Wuertz Brahms-SaalUniversity of California, Department of Civil & Environmental Engineering, Davis, USA“Monitoring of human pathogens and source identifiers in discharges across the United States: QMRA from source to bathing site”
14:30–15:00 ISV13: M. Wagner Brahms-SaalUniversity of Vienna, Department of Microbial Ecology, Vienna, Austria“New nitrifiers: Surprising diversity and unexpected physiological properties”
15:00–15:30 ISV14: A. Ulrich Brahms-SaalKarlsruhe Institute of Technology (KIT), Institute of Organic Chemistry – Department of Biochemistry, Karlsruhe, Germany“Biomembrane barriers and their role in survival: case studies on molecular transport and lethal damage”
15:30–17:30 Coffee break/Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
15:30–17:30 Poster Session II
16:00–17:30 Industrial symposium Eurofins MWG Operon (Ebersberg)* (see page 14) Clubraum
17:30 VAAM Annual General Meeting (see page 14) Brahms-Saal
ca. 18:30 PhD Awards Brahms-SaalSponsored by BASF SE, Sanofi Aventis Deutschland GmbH,Bayer Schering Pharma, New England Biolabs GmbH, Evonik Degussa GmbH
20:00 Mixer Friedrich-Wein-brenner-Saal
* Snacks and beverages provided
˘Wednesday, 06.04.2011
08:30–12:00 Industrial exhibition Ground floor/2nd floor
09:00–11:00 Special Groups Mini Symposia & Short Lectures (see page 34; 41) various
11:00–11:30 Coffee break
11:30–11:45 Poster Awards Brahms-SaalSponsored by nadicom GmbH
PLENARY SESSION: MICROBIAL INTERACTIONSChair: Natalia Requena
11:45–12:15 ISV15: J. Boch Brahms-SaalMartin-Luther-University Halle-Wittenberg, Institute for Genetics, Halle, GermanyXanthomonas TALEs – from plant pathogen weapon to biotech hype
12:15–12:45 ISV16: C. Hertweck Brahms-SaalHans-Knöll Institute Jena, Jena, Germany“Toxin producing endofungal bacteria”
12:45–13:15 ISV17: P. Bonfante Brahms-SaalUniversity of Torino, Plant Biology Department, Turin, Italy“Plants and arbuscular mycorrhizal fungi – Born to be friends”
13:15–13:30 Closing remarks Brahms-Saal
Mini-Symposia of the Special Groups: Monday, April 4, 17:30–19:30
31SPECIAL GROUPS
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Mini-Symposia of the Special Groups: Monday, April 4, 08:30–10:30
ACTIVITIES OF THE SPECIAL GROUPS
˘Special Group Funktionelle Genomanalyse
Topic: “Standards for Large Scale (Meta-) Genomics and Metadata”
Organisation: H.P. Klenk, German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), Braunschweig,GermanyRoom 2.08
ISV18 08:30 F.O. Glöckner
School of Engineering & Science (SES), Jacobs University, Bremen, Germany“The genomic standards consortium: Bringing standards to life”
ISV19 09:00 G. Garrity1*, N. Kyrpides2, D. Field3, P. Sterk3,4, H.-P. Klenk5
1 Microbiology & Molecular Genetics, Michigan State University, East Lansing, USA2 DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, USA3 Centre for Ecology & Hydrology, Molecular Evolution and Bioinformatics Group, Oxfordshire, UK4 The Sanger Institute, Welcome Trust Genome Campus, Hinkston Down, UK5 German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), Braunschweig, Germany“Standards in Genomic Sciences: A standards compliant open-access journal for the ‘omics community”
ISV20 09:30 F. Meyer
Institute for Genomics and System Biology National Laboratory Mathematics and Computer SciencesDivision, Argonne, USA“Reversing the paradigm – The genome sequence of Candidatus Sulfuricurvum sp. derived from a complexshort-read metagenome with more than 300 OTUs enables detailed studies of the novel epsilon-proteobacterium”
FGV001 10:00 L. Wöhlbrand1*, J. Jacob2, M. Kube3, A. Beck3, R. Reinhardt4, R. Rabus1,2
1 Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment (ICBM), General and MocelularMicrobiology, Oldenbrug, Germany2 Max Planck Institute for Marine Microbiology, Bremen, Germany3 Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany4 Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Cologne, Germany“Genome and proteome of Desulfobacula toluolica Tol2, a sulfate-reducing aromatic compound degrader”
˘Special Group Experimentelle Mykologie/Fungal Biology and Biotechnology
Topic: “Fungal Development and Pathogenicity Mechanisms”
Organisation: S. Pöggeler, Institute for Microbiology and Genetics, University of Göttingen, Göttingen, Germany;M. Brock, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans-Knöll-Institute, Jena,GermanyBrahms Hall
ISV21 17:30 P. van West*, S. Wawra, S. Grouffaud, C. R. Bruce, N. R. Horner, J. Bain, A. Matena,
C. MM Gachon, I. de Bruijn, K. L. Minor, J. A. Boddey, S. C. Whisson, P. Bayer, P. R.J. Birch,
A. J. Porter, C. J. Secombes
Aberdeen Oomycete Laboratory, University of Aberdeen, Aberdeen, Scotland“Translocation of Oomycete effectors into host cells”
FBV014 18:00 R. Kumar*, S. Sathya, B.P. Venkatesh
Microbial Biotechnology, Bharathiar University, Coimbatore, India“Antifungal and antibacterial activity of marine actinomycetes strains isolated from east and west coastalregions of India”
32 SPECIAL GROUPS
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Mini-Symposia of the Special Groups: Monday, April 4, 17:30–19:30
ACTIVITIES OF THE SPECIAL GROUPS
MPV018 18:15 K. Lapp1,2*, T. Heinekamp1,2, I. Jacobsen2,3, H.-M. Dahse2,4, A.A. Brakhage1,2
1 Leibniz-Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans-Knöll-Institute, Molecular andApplied Microbiology, Jena, Germany2 Friedrich-Schiller-University, Jena, Germany3 Leibniz-Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans-Knöll-Institute, MicrobialPathgenicity Mechanisms, Jena, Germany4 Leibniz-Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans-Knöll-Institute, Infection Biolo-gy, Jena, Germany“Functional characterisation of hemolysins of Aspergillus fumigatus”
MPV019 18:30 M. Vranes1*, T. Langner1, M. Scherer2
1 Institute for Applied Biosciences (IAB), Genetics, Karlsruhe Institute of Technology, Karlsruhe, Germany2 Qiagen, Hilden, Germany“Regulating early infection and in planta development of Ustilago maydis”
SIV002 18:45 S. Kloppholz*, H. Kuhn, N. Requena
Botanical Institute, Plant-Microbial Interactions, Karlsruhe Institute of Technology (KIT), Karlsruhe, Germany“An effector protein from the symbiotic fungus G. intraradices suppresses plant early defense responses”
FBV015 19:00 M. Boenisch*, W. Schäfer
Biocenter Klein Flottbek, Molecular Phytopathology and Genetics, University of Hamburg, Hamburg,Germany“Infection structures and mycotoxin induction of Fusarium graminearum on wheat florets”
FBV016 19:15 O. Voigt*, S. Pöggeler
Institute for Microbiology and Genetics, Genetics of eukaryotic Microorganisms, Göttingen, Germany“The Role of the autophagy related genes Smatg4 and Smatg8 in the sexual development of Sordariamacrospora”
˘Special Group Umweltmikrobiologie
Topic: Relevance of Ecological Principles in Environmental Microbiology
Organisation: T. Lueders and R. Meckenstock, German Research Center for Environmental Health, Helmholz-Centre Munich, Munich, GermanyClubroom
ISV22 17:30 C. van der Gast
Natural Environment Research Council Centre for Ecology & Hydrology Population and Community EcologySection, Oxford, UK“Applying ecological principles to microbial systems: Partitioning core and satellite taxa from withinbacterial communities”
ISV23 18:00 A. Ramette
Max Plank Institute for Marine Microbiology, Bremen, Germany“Effects of space and ecosystem type on the structuring of marine microbial communities at the globalscale”
EMV009 18:30 M. Schloter
Helmholtz-Centre Munich, Terrestrial Ecogenetics, Oberschleissheim, Germany“Dynamics and drivers of ammonia oxidizing microbes in soil”
EMV010 18:45 A. Chatzinotas*, R. Schäwe, M. Saleem, I. Fetzer, H. Harms
Environmental Microbiology, Helmholtz-Centre for Environmental Research – UFZ, Leipzig, Germany“Microbial model systems and ecological theory: How does increasing environmental stress affectmicrobial interactions and ecosystem services?”
EMV011 19:00 G. Pilloni1*, A. Bayer1, B. Anneser1, M. Engel2, C. Griebler1, T. Lueders1
1 Helmholtz-Centre Munich, Groundwater Ecology, Neuherberg, Germany2 Helmholtz-Centre Munich, Terrestrial Ecogenetics, Institute of Soil Ecology, Neuherberg, Germany“Disturbance ecology controls natural attenuation in contaminated aquifers”
33
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Mini-Symposia of the Special Groups: Monday, April 4, 17:30–19:30
ACTIVITIES OF THE SPECIAL GROUPS
EMV012 19:15 D.P.R. Herlemann1*, M. Labrenz1, K. Jürgens1, S. Bertilsson2, J.J. Waniek1, A.F. Andersson3
1 Leibniz Institute for Baltic Sea Research, Warnemünde, Biological Oceanography, Rostock, Germany2 Department of Ecology & Genetics, Limnology, Uppsala University, Uppsala, Sweden3 KTH Royal Institute of Technology, Science for Life Laboratory, Stockholm, Sweden“The Baltic Sea microbiome: bacterial transitions along a 2000 km salinity gradient”
˘Special Group Regulation und Signaltransduktion in Prokaryoten/Mikrobielle Pathogenität
Topic: Second Messengers in Bacteria
Organisation: P. Dersch, Department for Molecular Infection Biology, Helmholtz Centre for Infection Research,Braunschweig, Germany; K. Jung, Biozentrum Department Biologie I, Bereich Mikrobiologie, Ludwig-Maximilians-Universität, Martinsried, GermanyRoom 2.05
ISV24 17:30 U. Jenal
Biozentrum, University of Basel, Basel, Switzerland“Mechanisms of c-di-GMP mediated cell cycle control in Caulobacter crescentus”
ISV25 18:00 A. Camilli
Department of Molecular Biology and Microbiology, Tufts University School of Medicine, Boston, USA“Dynamic cyclic di-GMP signaling in Vibrio cholerae during infection”
RGV001 18:30 S. de Causmaecker*, A. Wilde
Institute of Micro- and Molecular Biology, Justus-Liebig-Universtiy, Gießen, Germany“The role of the c-di-GMP in phototactic motility of Synechocystis sp. PCC 6803 cells”
˘Special Group Struktur und Mikroskopie
Topic: Structure of the Microbial Cytoplasm
Organisation: H. Engelhardt, Max-Planck-Institut für Biochemie, Martinsried, GermanyHebel Hall
ISV26 17:30 J.O. Ortiz*1, F. Brandt1, V. Matias1, S. Etchells2, F.U. Hartl2 and W. Baumeister1
1 Department of Structural Biology, Max-Planck Institute of Biochemistry, Martinsried, Germany2 Department of Cellular Biochemistry, Max-Planck Institute of Biochemistry, Martinsried, Germany“From isolated molecules to intact cells: Structure of ribosomal arrangements in vitro and in situ”
ISV27 18:00 J. Elf
Department for Cell and Molecular Biology Program for Computational and Systems Biology, Uppsala,Sweden“Fast tracking of individual protein in the bacterial cytoplasm”
ISV28 18:30 Z. Luthey-Schulten
Department of Chemistry, University of Illinois, Urbana, USA“Protein and RNA dynamics in living cells”
NTV001 19:00 V. Sourjik
Center for Molecular Biology (ZMBH), University of Heidelberg, Heidelberg, Germany“Protein mobility in bacterial cytoplasm”
NTV002 19:15 H. Cypionka
Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment, University of Oldenburg, Oldenburg, Germany“Hologram stacking with PICOLAY: How to get confocal microscopy for free”
Mini-Symposia of the Special Groups: Wednesday, April 6, 09:00–11:30
34 SPECIAL GROUPS
BIOspektrum | Tagungsband 2011
Mini-Symposia of the Special Groups: Monday, April 4, 17:30–19:30
ACTIVITIES OF THE SPECIAL GROUPS
˘Special Group Identifizierung und Systematik
Topic: Lipids as Part of Cellular Processes
Organisation: B. Tindall, German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), Braunschweig, Ger-many; H.J. Busse, Institute for Bacteriology, Mycology and Hygiene, University of Veterinary Medicine, Vienna,AustriaForum 1 & 2
OTV007 17:30 B. TindallGerman Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), Braunschweig, Germany“Lipids – The fourth cornerstone in biological chemistry”
ISV29 17:45 O. Geiger*, C. Sohlenkamp, I. López-LaraCenter for Genomic Sciences, National Autonomous University of Mexico, Cuernavaca, Morelos, Mexico“Biosynthesis and remodeling of bacterial membrane lipids”
ISV30 18:15 Y.M. ZhangDepartment of Biochemistry & Molecular Biology, Medical University of South Carolina, Charleston, USA“Regulation of membrane homeostasis in Pseudomonas aeruginosa”
ISV31 18:45 M. GriningerDepartment of Membrane Biochemistry, Project Group “Biological Chemistry”, Max Planck Institute of Bio-chemistry, Martinsried, Germany“Fatty acid synthesis in fungal type I protein complexes”
OTV008 19:15 B. TindallGerman Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ), Braunschweig, Germany“Structural analysis of the polar lipids of Sphingobacterium spiritivorum and Pedobacter heparinus”
˘Special Group Biotransformation
Topic: Hydroxylation, Oxygenation and Oxidation Reactions
Organisation: C. Syldatk, Karlsruhe Institute of Technology (KIT), Department of Chemical Engineering, TechnicalBiology, Karlsruhe, Germany, J. Eck, BRAIN AG, Zwingenberg, GermanyClubroom
ISV32 09:00 W. Aehle*, F. NiehausBRAIN AG, Zwingenberg, Germany“Universal high throughput FACS based screening systems for the discovery and optimization of biocata-lysts from enzyme libraries”
GWV017 09:30 D. Scheps*, S. Honda Malca, B. Nestl, B. HauerUniversity of Stuttgart, Institute of Technical Biochemistry, Stuttgart, Germany“Regioselective hydroxylation of medium-chain n-alkanes and primary alcohols by CYP153 enzymes”
GWV018 09:45 A. Meffert*, E.A. GalinskiRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität, Institut für Mikrobiologie und Biotechnologie, Bonn, Germany“Whole-cell biotransformation for the stereospecific hydroxylation of the incompatible solute guanidino-ectoine”
GWV019 10:00 B. Halan*, A. Schmid, K. BuehlerTechnical University Dortmund, Laboratory of Chemical Biotechnology, Department of Biochemical and Che-mical Engineering, Dortmund, Germany“Catalytic biofilms: Real time solvent tolerance analysis of Pseudomonas sp. strain VLB120?C and profilingof EPS matrix”
GWV020 10:15 M. Kluge1*, R. Ullrich1, K. Scheibner2, M. Hofrichter1
1Internationales Hochschulinstitut Zittau (IHI), Bio- and Environmental Sciences, Zittau, Germany2Lausitz University of Applied Sciences, Biology, Chemistry and Process Technology, Senftenberg, Germany“Asymmetric benzylic hydroxylation and epoxidation of alkylbenzenes and styrene derivatives by Agrocybeaegerita aromatic peroxygenase”
BIOspektrum | Tagungsband 2011
SHORT LECTURES 35
Pathogen Metabolism and Physiology
Mombert Hall
Chair: Jörg VogelCo-Chair: Sven Krappmann
MPV00108:30
J. TOLLER*, B. ROSCHITZKI, C. FORTES,M. GIVSKOV, L. EBERL, K. RIEDELA metaproteomics approach to studyhost-pathogen interactions betweenPseudomonas aeruginosa andCaenorhabditis elegans
MPV00208:45
J. GLEICHENHAGEN*, M. WESSEL,M. AKTAS, S. KLÜSENER, S. HACKER,C. FRITZ, F. NARBERHAUSA typical eukaryotic lipid in prokaryoticmembranes: Synthesis and necessity ofphosphatidylcholine in Agrobacteriumtumefaciens
MPV00309:00
C. LANG*, E. RASTEW, B. HERMES,E. SIEGBRECHT, S. BANERJI, A. FLIEGERVirulence properties of Legionella pneu-mophila GDSL lipolytic enzymes: Prote-olytic activation of PlaC acyltransferaseactivity
MPV00409:15
N. GÖHRING*, I. FEDTKE, D. MADER,S. HEINRICH, D. KÜHNER, U. BERTSCHE,A. PESCHELA yjbH-homologue in S. aureus: a newrole of a thioredoxin-like protein in ß-lac-tam resistance
MPV00509:30
P. TIELEN*, N. ROSIN, L. JÄNSCH,M. SCHOBERT, D. JAHNIron-limitation triggers the virulence ofPseudomonas aeruginosa in urinarytract infections
MPV00609:45
A. DJAMEI*, K. SCHIPPER, R. KAHMANNMetabolomic priming by a secreted fun-gal effector
MPV00710:00
M. BISCHOFF*, T. HARTMANN,R. BERTRAM, W. EISENREICH,B. SCHULTHESS, C. WOLZ, M. HERRMANNSACOL0731, a new regulatory link be-tween central carbon metabolism andvirulence determinant production inStaphylococcus aureus
MPV00810:15
A. WESCHE*, S. THOMA, M. HOGARDT,E. JORDAN, D. SCHOMBURG, M. SCHOBERTCharacterization of methionine aux-otrophic clinical Pseudomonas aerugi-nosa isolates
Cellular Systems in Biotechnology
Clubroom
Chair: Ursel KüesCo-Chair: Bernhard Hauer
GWV00108:30
N. STOEVEKEN*, M. PITTELKOW, T. SINNER,J. HEIDER, E. BREMERParalogues aspartokinases fromPseudomonas stutzeri A1501: synthesisof the precursor for the compatiblesolutes ectoine and hydroxyectoine
GWV00208:45
M. OELSCHLÄGEL*, J.A.D. GRÖNING,D. TISCHLER, S.R. KASCHABEK,M. SCHLÖMANNA remarkable stable and active styreneoxide isomerase from Rhodococcus opa-cus 1CP with high biotechnological po-tential
GWV00309:00
V. HAHN*, A. MIKOLASCH, F. SCHAUERThe enzyme laccase as biocatalyst forthe synthesis of various novel organiccompounds with potent bioactive prop-erties
GWV00409:15
V. KALLNIK*, C. SCHULZ, P. SCHWEIGER,U. DEPPENMEIERThe first hyperthermophilic D-arabitoldehydrogenase catalyzes the regiospe-cific oxidation of D-arabitol to D-ribulose
Environmental Microbiology I
Brahms Hall
Chair: Michael FriedrichCo-Chair: Harold Drake
EMV00108:30
S. HUNGER*, O. SCHMIDT, M. HILGARTH,M.A. HORN, S. KOLB, H.L. DRAKEAnaerobic formate- and CO2-assimilatingprokaryotic taxa in a methane-emittingfen soil
EMV00208:45
S. THIELE*, B. FUCHS, V. SMETACEK,K. ALTENDORF, R. AMANNLOHAFEX – Investigation of the bacterialcommunity in an iron fertilization experi-ment
EMV00309:00
S. KLEINDIENST*, F. MUSAT, T. LUEDERS,F. VON NETZER, R. AMANN, K. KNITTELActive hydrocarbon-degrading sulfate-reducing bacteria at marine gas and oilseeps
EMV00409:15
C. ALGORA*, K. WASMUND, C. RIDLEY,J. MÜLLER, T.G. FERDELMAN, L. ADRIANEnrichment of Dehalococcoides-relatedChloroflexi from marine subsurface sed-iments
EMV00509:30
J. DEUTZMANN*, B. SCHINKAnaerobic oxidation of methane in LakeConstance sediments
EMV00609:45
A. REIM*, P. FRENZELHalf a millimeter makes a difference: amicroscale study on distribution andspecific activity of methanotrophs at anoxic-anoxic interface
EMV00710:00
M. HERRMANN*, K. BUROW, A. HÄDRICH,K. KÜSELArchaea dominate the ammonia-oxidiz-ing microbial community in an acidic fen
EMV00810:15
K. GLASER*, J. JOHNKE, H. HARMS,A. CHATZINOTASHow does land use influence bacterivo-rous protists in soils?
Monday, April 4, 08:30–10:30
36 SHORT LECTURES
BIOspektrum | Tagungsband 2011
36
FBV00309:00
E.M. NIEHAUS*, B. TUDZYNSKIMolecular and chemical characterizationof secondary metabolite gene clustersin Fusarium fujikuroi
FBV00409:15
A.L. MARTINEZ-ROCHA*, M. WORIEDH,W. SCHÄFERPreventing fusarium head blight ofwheat and cob rot of maize by inhibitionof fungal deoxyhypusine synthase
FBV00509:30
T. NGUYEN*, J. BORMANN, B. HADELER,C. KRÖGER, W. SCHÄFERThe mitogen-activated protein kinaseHOG1 in Fusarium graminearum is in-volved in osmoregulation, sexual repro-duction and virulence
MPV00909:45
K. HEIMEL*, M. SCHERER, S. HASSINGER,J. KAEMPERConnecting cell cycle to pathogenic de-velopment-regulatory cascades duringpathogenesis of Ustilago maydis
SIV00110:00
C. VOGT*, H. KUHN, N. REQUENAA screen to identify fungal and plant sig-nals during arbuscule formation in AMsymbiosis
OTV00110:15
J. SCHIRRMEISTER*, S. ZEHNER,M. WENZEL, L. FRIEDRICH, M. HOPPE,M. GÖTTFERTThe C-terminal domain DUF1521 of theBradyrhizobium japonicum protein andits functional stability
Fungal Biology and Development
Hebel Hall
Chair: Erika KotheCo-Chair: Matthias Hahn
FBV02508:30
D. FREIHORST*, E. KOTHEOrphan GPCRs in Schizophyllumcommune
FBV00708:45
K. BACKHAUS*, J. HEINISCHCell wall thickness and composition inthe yeasts Saccharomyces cerevisiaeand Kluyveromyces lactis adapt togrowth conditions
FBV006 will be presented as poster withthe ID FBP045
FBV00809:00
E. VOLLMEISTER*, C. HAAG, S. BAUMANN,M. FELDBRÜGGEThe AUACCC-binding protein Khd4 regu-lates cell morphology and pathogenicityin Ustilago maydis
FBV00909:15
A. HERRERA*, U. ESQUIVEL-NARANJO,M. HERNÁNDEZ-OÑATE, E. IBARRA-LACLETTEMolecular basis of photoconidiation inthe filamentous fungus Trichodermaatroviride
FBV01009:30
M. LEROCHUsing codon-improved GFP for imaginggene expression during germination andhost penetration of Botrytis cinereaconidia
FBV01109:45
A. HERRMANN*, B. TILLMANN, M. BÖLKER,P. TUDZYNSKICharacterization of small GTPase com-plexes and their effects on polar growthduring infection of Claviceps purpurea
FBV01210:00
H.W. NÜTZMANN*, V. SCHROECKH,K. SCHERLACH, K. MARTIN, C. HERTWECK,A. BRAKHAGEInteraction between Streptomycetesand Aspergillus nidulans
FBV01310:15
S. PÖGGELER*, C.M. O’GORMAN, B. HOFF,U. KÜCKAnalysis of the mating-type loci from thehomothallic Ascomycete Eupenicilliumcrustaceum
GWV00509:30
L. LAUTERBACH*, Z. IDRIS, J. LIU,K.A. VINCENT, O. LENZCofactor regeneration: understandingthe catalytic properties of the NAD+-re-ducing [NiFe]-hydrogenase from Ralsto-nia eutropha by investigating its sub-complexes
GWV00609:45
J. BECKER*, H. SCHRÖDER, O. ZELDER,S. HAEFNER, A. HEROLD, C. KLOPPROGGE,C. WITTMANNDesign-based construction of a lysinehyper-producing strain by SystemsMetabolic Engineering
GWV00710:00
F. JANKOWITSCH*, M. MACKThe gene rosA encoding N,N-8-amino-8-demethyl-D-riboflavin dimethyltrans-ferase is located within a gene clusterpossibly involved in biosynthesis ofroseoflavin in Streptomyces davawensis
GWV00810:15
S. REICH*, B. M. NESTL, B. HAUEREnzyme Engineering of an Enoate Re-ductase from Zymomonas mobilisAffecting the Enzyme Activity andEnantioselectivity
NTV00510:30
N. MUSTAFI*, M. BOTT, J. FRUNZKEDevelopment of a novel biosensor forthe intracellular detection of L-methio-nine and branched-chain amino acids
Plant-Microbe Interactions
Room 2.05
Chair: Anke BeckerCo-Chair: Philipp Franken
FBV00108:30
C. PLESKENGrey mould isolates from German straw-berry fields reveal a new type of mul-tidrug resistance and evidence for a nov-el taxon next to Botrytis cinerea
FBV00208:45
D. MERNKEMutations and migration of Botrytiscinerea field strains with multidrug re-sistance phenotypes in French and Ger-man vineyards
Monday, April 4, 08:30–10:30
BIOspektrum | Tagungsband 2011
37
Oxidative Stress Responses
Forum 1
Chair: Torsten MascherCo-Chair: Gerhard H. Braus
SRV00108:30
D. ORTIZ DE ORUÉ LUCANA*, M. ROSCHER,H. SCHREMPFMolecular mechanisms governing thethree-component system HbpS-SenS-SenR from Streptomyces reticuli
SRV00208:45
J. GLAESER*, B. BERGHOFF, A. NUSS,M. ZOBAWA, F. LOTTSPREICH, G. KLUGAnoxygenic photosynthesis and pho-tooxidative stress: A particular chal-lenge for Roseobacter
SRV00309:00
F. MARX*, A. EIGENTLER, B. DE CASTROPIMENTEL FIGUEIREDO, T. MAGNANIDINAMARCO, G.H. GOLDMANThe apoptosis inducing factor (AIF)-likemitochondrial oxidoreductase (aifA) me-diates reistance towards the Penicilliumchryosgenum antifungal protein PAF inAspergillus fumigatus
SRV00409:15
I. OBERPICHLER*, J. WESSLOWSKI,R. POKORNY, R. ROSEN, F. ZHANG,O. NEUBAUER, A. BATSCHAUER, E. RON,T. LAMPARTERA novel type of DNA photolyase contain-ing an iron sulfur cluster
SRV00509:30
H. ANTELMANN*, B.K. CHI, G. PALM,K. GRONAU, U. MÄDER, D. BECHER,W. HINRICHS, M. HECKERSpecific control of hypochlorite resist-ance by the redox-sensing MarR/DUF24-type regulator HypR in Bacillus subtilis
SRV00609:45
C. HERNANDEZ*, A. PEREIRA, P. TAVARES,S. ANDRADEStructural studies on the Iron core for-mation in Marinobacter hydrocarbono-clasticus Dps
SRV00710:00
K. MARIN*, C. LANGE, C. TRÖTSCHEL,D. SEIFERLING, I. OCHROMBEL,A. POETSCH, R. KRÄMERCharacterisation of the oxidative stressresponse in C. glutamicum
SRV00810:15
G. STURM*, J. GESCHEROn the multitude of mechanisms thatestablish high-level heavy metal resist-ance in an aggregate forming bacterium
Special Session
Science and Infrastructure
Forum 2
Chair: Dagmar FritzeCo-Chair: Philippe Desmeth
OTV00208:30
D. FRITZECulture collections’ provision of continu-ity for academic and industrial research– meeting the emerging challenges
OTV00308:50
B. TINDALLAuthenticity of microbiological material– the impact in the research environ-ment
OTV00409:10
D. SMITHCapacity building, transnational accessand encouragement for the deposit ofmicrobiological material – the EU proj-ect EMbaRC
OTV00509:30
P. DESMETHThe ABS Protocol
OTV00609:50
P. DESMETHTools to implement the Nagoya Protocolon ABS in microbiology
Enzymatic Systems in Biotechnology
Mombert Hall
Chair: Alexander SteinbüchelCo-Chair: Michael Bott
GWV00917:30
B. BLOMBACH*, T. RIESTER,S. WIESCHALKA, C. ZIERT, J.-W. YOUN,V.F. WENDISCH, B.J. EIKMANNSCorynebacterium glutamicum engi-neered for efficient isobutanol produc-tion
GWV01017:45
S. LINDNER*, G.M. SEIBOLD, A. HENRICH,R. KRÄMER, V.F. WENDISCHPhosphotransferase system (PTS) inde-pendent glucose utilization inCorynebacterium glutamicum by inosi-tol permeases and glucokinases and ap-plication for improved L-lysine produc-tion
GWV01118:00
B. ANDREEßEN*, A. STEINBÜCHELBiotechnological conversion of glycerolto 2-amino-1,3-propanediol (serinol) inrecombinant Escherichia coli
GWV01218:15
S. LÜTTE*, A. POHLMANN, H. HEUMANN,A. STEINBÜCHEL, B. FRIEDRICHAutotrophic Production of Stable Iso-tope-labelled Amino Acids
GWV01318:30
J. HANGEBRAUK*, R. STELLMACHER,R. SCHÄFER, J. BECKER, G. VONABENDROTH, H. SCHRÖDER, S. HAEFNER,C. WITTMANNSystems Metabolic Engineering of Basfiasucciniciproducens for Biobased Pro-duction of Succinic Acid
GWV01418:45
U. ENGEL*, B. BRUCHER, C. SYLDATK,*J. RUDATChemoenzymatic synthesis and micro-bial degradation of enantiopure aromat-ic beta-amino acids
Monday, April 4, 08:30–10:30 17:30–19:30
38 SHORT LECTURES
BIOspektrum | Tagungsband 2011
38
AMV00618:45
W. J. MAALCKE*, C. FEROUSI,T.R. BARENDS, W.J. GEERTS, J.T. KELTJENS,M.S.M. JETTEN, B. KARTALThe biochemistry of anaerobic ammoni-um oxidation
AMV00719:00
C. PINSKE*, S. KRÜGER, M. BÖNN,G. SAWERSThe explanation for the hydrogenase-negative Phenotype of Escherichia coli Bstrain BL21(DE3)
AMV00819:15
G. LAYER*, S. STORBECKStructure and function of the SAM-de-pendent uroporphyrinogen III methyl-transferase NirE involved in heme d1
biosynthesis in Pseudomonas aerugi-nosa
Cell Biology I
Brahms Hall
Chair: Reinhard RachelCo-Chair: Gero Steinberg
CBV00108:30
S. FRIESERDynamic regulation of theCdc24/Rac1/Cla4 signalling moduleduring dimorphic switching of the phy-topathogenic fungus Ustilago maydis
CBV00208:45
A. TREUNER-LANGE*, K. AGUILUZ,L. SOGAARD-ANDERSENThe ParA-like protein PomZ positivelyregulates positioning of the cell divisionsite
CBV00309:00
R. MOURIÑO-PÉREZ*, D.L. CALLEJAS-NEGRETE, R. DELGADO-ALVAREZActin and actin binding proteins duringpolarized growth and septum formationin Neurospora crassa
CBV00409:15
F. DEMPWOLFF*, C. REIMOLD,P.L. GRAUMANNInteraction of bacterial cytoskeletal ele-ments in a heterologous system
CBV00509:30
N. ZEKERT*, C. SEIDEL, R. FISCHERThe Kinesin-3 Motor Protein UncA Re-veals Different Microtubule Populationsin Aspergillus nidulans
CBV00609:45
S. SCHLIMPERT*, A. BRIEGEL, K. BOLTE,U.G. MAIER, J. KAHNT, G.J. JENSEN,M. THANBICHLERPhysical compartmentalization by a pro-tein diffusion barrier in stalked alpha-proteobacteria
CBV00710:00
T. POHLMANN*, S. BAUMANN,M. JUNGBLUTH, M. FELDBRÜGGEMicrotubule-dependent co-transport ofmRNPs and vesicles in Ustilago maydis
GWV01519:00
M. SEITZ, J. KLEBENSBERGER, M. BREUER,B. HAUER*Natural Product Synthesis by Squalene-Hopene Cyclases (SHCs)
GWV01619:15
M.M. MÜLLER*, B. HÖRMANN, C. SYLDATK,R. HAUSMANNRhamnolipids- Green Surfactants Basedon Renewables
Anaerobic Metabolism
Room 2.08
Chair: Matthias BollCo-Chair: Gabriele Diekert
AMV00117:30
A. REINHOLD*, M. WESTERMANN,T. FUTAGAMI, K. FURUKAWA, J. SEIFERT,M. VAN BERGEN, T. SCHUBERT, G. DIEKERTSubcellular localization of pce geneproducts: implications for the biogene-sis of physiologically active tetra-chloroethene (PCE) reductive dehaloge-nase
AMV00217:45
A. M. MOWAFY*, T. KURIHARA, W. BUCKEL,N. ESAKIEvidence for the involvement of oneelectron transfer chemistry in 2-haloacrylate hydratase reaction
AMV00318:00
K. SCHÜHLE*, J. HEIDERAcetophenone carboxylase and Acetonecarboxylase, enzymes employing newbiochemical principles for carboxylationreactions
AMV00418:15
C. LÖFFLER*, J.W. KUNG, T. WEINERT,U. ERMLER, M. BOLLThe W-/Se-containing class II benzoyl-CoA reductase complex in obligatelyanaerobic bacteria
AMV00518:30
J. ZEDELIUS*, R. RABUS, M.M.M. KUYPERS,F. SCHREIBER, F. WIDDELNitrogen oxides involved in anaerobicalkane activation by strain HdN1
Monday, April 4, 17:30–19:30 Tuesday, April 5,08:30–10:30
BIOspektrum | Tagungsband 2011
39
MPV015 will be presented as poster withthe ID MPP066
MPV01610:00
M. KOLBE*, M. LUNELLIStructure/Function Analysis of the Type3 Secretion System from Salmonella ty-phimurium
MPV01710:15
C. WEIDENMAIERThe zwitterionic cell wall teichoic acid ofStaphylococcus aureus provokes skinabscesses in mice by a novel CD4+ T-Cell-dependent mechanism
Food Microbiology
Clubroom
Chair: Christian HertelCo-Chair: Herbert Schmidt
FMV00108:30
E. GRAF*, M. SCHMIDT-HEYDT, R. GEISENInfluence of osmotic and pH stress onthe alternariol biosynthesis in Alternariaalternata
FMV00208:45
S. POLZIN*, I. ELSENHANS, H. SCHMIDTDifferential proteomic expression of en-terohaemorrhagic E. coli O157:H7EDL933 grown in intestinal simulatingmedia
FMV00309:00
M. NOLL*, C. WEILER, A. IFLAND,S. SIGIEL, A. NAUMANNCharacterisation of the incorporation ofListeria monocytogenes in a raw milk-biofilm
FMV00409:15
A. WEISS*, S. WILD, H. SCHMIDTSurvival of Listeria monocytogenes inlubricants applied in the food industry
FMV00509:30
M. SCHUPPLER*, L. AMATO, J. RITSCHARD,E. ROTH, L. MEILEThe impact of vacuum foil packaging onthe quality characteristics of the sur-face smear microflora of semi-hardsmear cheese
FMV00609:45
M. WASSERMANN*, S. WEINHOLZ,C. CORDES, M. PEGLOW, W. PERGANDEGranulation of lactic acid bacteria usingthe fluidized bed technology
FMV00710:00
M. WIESCHEBROCK*, F. SCHILLING,C. HERTELGeneration of new flavours in wheatdoughs supplemented with by-productsand fermented with non-Saccharomycescerevisiae yeasts
FMV00810:15
P. SEBASTIAN*, V. BLÄTTEL, E. GASSER,H. CLAUS, P. PFEIFFER, H. KÖNIGA novel enzymatic approach for growthinhibition of undesired wine related mi-croorganisms
Fungal Biotechnology
Room 2.05
Chair: Paul TudzynskiCo-Chair: Bettina Tudzynski
FBV01708:30
R. LEHNECK*, S. PÖGGELERCharacterization of a putative a-carbonicanhydrase from the filamentous as-comycete Sordaria macrospora
FBV01808:45
A. NEUMANN*, K. BRZONKALIK,C. SYLDATKCharacterization, purification andcloning of the O-Methyltransferase of Al-ternaria alternata
FBV01909:00
S. ALBERMANN*, B. TUDZYNSKIApproaches for directed strain improve-ment targeting enhanced biosynthesisof gibberellic acid in Fusarium fujikuroi
FBV02009:15
J. BORMANN*, P. ILGEN, C. KRÖGER,B. HADELER, W. SCHÄFERNew insights in the regulation of myco-toxin production in the plant pathogenF. graminearum
CBV00810:15
F. D. MÜLLER*, M. MESSERER,K. EMANUEL, C. LANG, J. PLITZKO,D. SCHÜLERFunctional analysis of cytoskeletal pro-teins implicated in magnetosome forma-tion and cell division in Magnetospiril-lum gryphiswaldense
Virulence Factors
Mombert Hall
Chair: Petra DerschCo-Chair: Andreas Peschel
MPV01008:30
Y. ZHAO*, H. GHAREEB, M.T. HABIB,J. SCHIRAWSKIThe molecular basis of symptom forma-tion in Sporisorium reilianum
MPV01108:45
C. HEDDERGOTT*, O. KNIEMEYER,A.A. BRAKHAGESecreted proteins of the dermatophyticfungus Arthroderma benhamiae andtheir contribution to pathogenicity
MPV01209:00
P. KAISER*, D. LINKE, H. SCHWARZ,V. KEMPF*Generation and functional characteriza-tion of truncated Bartonella henselaeBadA mutants
MPV01309:15
T. FUCHSInteraction of Yersinia spp. with inverte-brates
MPV01409:30
J. OVERHAGE*, A. ZIMMERMANN,B. NUORI, A. NEIDIG, S. HÄUSSLER,C. MATZPseudomonas aeruginosa virulence ana-lyzed in a Dictyostelium discoideummodel of infection
MPV02009:45
L. POPPINGA*, A. FÜNFHAUS, E. GARCIA-GONZALEZ, B. JANESCH,C. SCHÄFFER, E. GENERSCHFunctional analysis of the S-layer pro-tein of Paenibacillus larvae
Tuesday, April 5, 08:30–10:30
40 SHORT LECTURES
BIOspektrum | Tagungsband 2011
40
EMV01509:15
H. FREESE*, B. SCHINKThe bacterial community in the diges-tive tract of the small aquatic crus-tacean Daphnia magna
EMV01609:30
S.U. GERBERSDORF*, H.V. LUBARSKY,D.M. PATERSON, S. WIEPRECHT, W. MANZMicrobial engineers control sedimentdynamics in aquatic habitats
EMV01709:45
A. RUSZNYAK*, D.M. AKOB, S. NIETZSCHE,T.R. NEU, K. KÜSELCalcite biomineralization in a karsticcave – bacteria hidden in the dark
EMV01810:00
S. TÖWE*, A. ALBERT, K. KLEINEIDAM,R. BRANKATSCHK, J.C. MUNCH, J. ZEYER,M. SCHLOTERAbundance of microbes involved in ni-trogen transformation in the rhizos-phere of Leucanthemopsis alpina (L.)Heywood grown in soils from differentsites of the Damma glacier forefield
EMV01910:15
C. JOGLER*, G. WANNER, S. KOLINKO,M. NIEBLER, W. LIN, Y. PAN, P. STIEF,A. BECK, D. DE BEER, R. AMANN,N. PETERSEN, M. KUBE, R. REINHARDT,D. SCHÜLERUltrastructural, genomic and ecologicalanalysis of “Candidatus Magnetobacr-terium bavaricum” reveals a mechanismhomologous to proteobacterial magne-tosome formation
Experimental Progress and Molecular Tools
Hebel Hall
Chair: Ulrich Kück
FGV00208:30
D. ZHURINA*, C. RIEDELGenome mining of anti-inflammatory B.bifidum S17 reveals multiple loci poten-tially involved in host-microbe interac-tions
NTV00308:45
I. TEICHERT*, M. NOWROUSIAN, U. KÜCKStudying fungal development: Utilizationof laser capture microdissection andnext-generation sequencing techniques
OTV00909:00
S. RUDEN, R. MIKUT, K. HILPERT*Short cationic antimicrobial peptidesversus multidrug resistant bacteria
OTV01009:15
A. RIEDER*, T. LADNORG, C. WÖLL,U. OBST, R. FISCHER, T. SCHWARTZRecombinant hydrophobin coated sur-faces and their influence on microbialbiofilm formation
EMV02009:30
M. PATEL, S. POLSON, U. HERBER*Comparison of Genotypic, Proteotypicand Phenotypic Methods for the Identifi-cation of Bacteria
OTV01109:45
H. ENGELHARDT*, M. EIBAUER,C. HOFFMANNInvestigating membrane proteins in situby cryo-electron tomography
CBV00910:00
D. DELGADO-ÁLVAREZ*, O. CALLEJAS-NEGRETE, R. MOURIÑO-PÉREZImaging of the Neurospora crassa actincytoskeleton with Lifeact
NTV00410:15
T. GÜNTHER*, J. RAFF, K. POLLMANNA simple method to prepare microorgan-isms for AFM analysis
Archaea
Forum 1 & 2
Chair: Jörg SoppaCo-Chair: Felicitas Pfeifer
ARV00108:30
M. ROTHER*, T. STOCK, S. GOETZReplacing the archaeal path of seleno-cysteine biosynthesis with the bacterial
FBV02109:30
D. SAHA*, R. FISCHERMolecular analysis of polyketide syn-thase genes involved in secondary me-tabolism of Alternaria alternata
FBV02209:45
O. KNIEMEYER*, M. VÖDISCH,K. SCHERLACH, R. WINKLER,C. HERTWECK, H.-P. BRAUN, M. ROTH,H. HAAS, E.R. WERNER, A.A. BRAKHAGEAnalysis of the Aspergillus fumigatusproteome reveals metabolic changesand the activation of the pseurotin Abiosynthesis gene cluster in response tohypoxia
FBV02310:00
M. HOFFMANN*, J. ZIMMERLING,S.R. KASCHABEK, G. SCHÜÜRMANN,M. SCHLÖMANNFungal systems – Tools for the mil-ligram-to gram-scale preparation of anenvironmentally relevant metabolite offenoprofen
FBV02410:15
P. WEIßHAUPT*, W. PRITZKOW, M. NOLLNitrogen metabolism of wood decom-posing basidiomycetes and their interac-tion with diazotrophs as revealed byIRMS
Environmental Microbiology – ISME
Room 2.08
Chair: Meinhard SimonCo-Chair: Jörg Overmann
EMV01308:30
L. RIEMANN*, K. HOLMFELDT, M.MIDDELBOE, D. ODICComplex interactions between marinephages and their Flavobacterium hosts
EMV02909:00
M. BIZIC-IONESCU*, B. FUCHS, R. AMANN,H.-P. GROSSARTAggregate-colonizing microbialcommunities - a comparison of marinevs. freshwater systems
EMV014 will not be presented!
Tuesday, April 5, 08:30–10:30
BIOspektrum | Tagungsband 2011
41
Environmental Microbiology II
Brahms Hall
Chair: Andreas BruneCo-Chair: Bodo Philipp
EMV02109:00
D. IONESCU*, C. HEIM, M. BIZIC-IONESCU,V. THIEL, J. REITNER, L. POLERECKY, D. DEBEERInsights into the community structureand activity of the iron oxidizing bacte-ria in the Äspö-Hard Rock Laboratory
EMV02209:15
A. MÜLLER, M. FRIEDRICH*Adaptation of the iron-reducing bacterialcommunity to iron oxide availability inanoxic soil
EMV02309:30
K. KUNTZE*, C. VOGT, H.-H. RICHNOW,M. BOLLInsights in microbial communities –Functional marker genes in the anaero-bic degradation of aromatic compound
EMV02409:45
S. SCHELLENBERGER*, H.L. DRAKE,S. KOLBResponse of cellulose- and cellobiose-degrading soil bacteria to different re-dox potentials in an aerated soil
EMV02510:00
B. DAM*, W. LIESACKGenome analysis and transcriptome pro-files of Methylocystis sp. strain SC2grown at different methane concentra-tions
EMV02610:15
H. WEINGART*, A. WENSING, S.D. BRAUN,D. SPITELLER, M.S. ULLRICH, B. VÖLKSCHSuppression mechanisms involved inthe antagonistic activity ofPseudomonas syringae strain 22d/93against the soybean pathogenPseudomonas syringae pv. glycinea
EMV02710:30
S. JECHALKE*, C. KOPMANN, H. HEUER,K. KLEINEDAM, M. SCHLOTER, K. SMALLAEffects of sulfadiazine entering via ma-nure into soil on the abundance of an-tibiotic resistance genes and their trans-ferability
EMV02810:45
T. ENGELHARDT*, M. SAHLBERG,H. CYPIONKA, B. ENGELENViral infections as controlling factor forthe deep biosphere?
Microbial Diversity
Mombert Hall
Chair: Rudolf AmannCo-Chair: Werner Liesack
MDV00109:00
S. KOLINKO*, C. JOGLER, G. WANNER,E. KATZMANN, D. SCHÜLERSingle-cell analysis reveals unexpectedphylogenetic and ultrastructural diversi-ty of uncultivated magnetotactic bacte-ria
MDV00209:15
K. RÖSKE*, I. RÖSKEComplexity of the bacterial communityin the sediment of the drinking waterreservoir Saidenbach obtained by py-rosequencing
MDV00309:30
C. KARWAUTZ*, K. HÖRMANN, T. LUEDERSA close look at the diversity and dynam-ics of ultra-oligotrophic groundwater mi-crobial communities during the restora-tion of a drinking water well
MDV00409:45
A. HO*, C. LÜKE, P. FRENZELRecovery of methanotrophs from distur-bance: population dynamics, evenness,and functioning
MDV00510:00
S. E. RUFF*, J. ARNDS, K. KNITTEL,R. AMANN, G. WEGENER, A. RAMETTE,A. BOETIUSLife in the cold, dark south – Microbialcommunities of marine methane seepsat Hikurangi margin (New Zealand)
MDV00610:15
J. PETERSEN*, H. BRINKMANN,S. PRADELLACompatibility and phylogeny – Plasmidclassification in the genomics era
ARV00208:45
B. MOLITOR*, N. FRANKENBERG-DINKELA heme-based redox sensor in themethanogenic archaeon Methanosarcinaacetivorans
ARV00309:00
B. MEYER*, S.-V. ALBERSElucidation of the N-glycosylation path-way in the thermoacidophilic crenar-chaeon Sulfolobus acidocaldarius
ARV00409:15
L. KREUTER*, U. KÜPER, T. HEIMERL,A. RÖHL, F. MAYER, V. MÜLLER, R. RACHEL,H. HUBERSubcellular organization and energy con-servation of Ignicoccus hospitalis
ARV00509:30
K. LASSAK*, A. GHOSH, R. WIRTH, S.-V. ALBERSFull speed ahead: analysis of the assem-bly of the archaeal flagellum
ARV00609:45
R. WIRTH*, B. HERZOGMicroorganisms, peregrine falcons andcheetahs: Who is the fastest?
ARV00710:00
S. FRÖLS*, F. PFEIFERScreening and characterization ofbiofilm formation in halophilic Archaea
ARV00810:15
M. NIKOLAUSZ*, R.F.H. WALTER,H. STRÄUBER, J. LIEBETRAU, T. SCHMIDT,S. KLEINSTEUBER, F. BRATFISCH,U. GÜNTHER, H.H. RICHNOWAssessment of the predominantmethanogenic pathways in anaerobic di-gesters by the combination of moleculartechniques with the isotopic fingerprint-ing of the produced biogas
Wednesday, April 6, 09:00–11:00Tuesday, April 5,08:30–10:30
42 SHORT LECTURES
BIOspektrum | Tagungsband 2011
42
CBV01610:30
H. STRAHL*, L. HAMOENMembrane potential plays a fundamen-tal role in regulation and maintenance ofbacterial morphology
CBV01710:45
J. PÖHLMANN*, U. FLEIGVip1-like 1/3 inositol polyphosphate ki-nases regulate the dimorphic switch inyeasts
Other Stress Responses
Room 2.08
Chair: Hans-Ulrich MöschCo-Chair: Gottfried Unden
SRV00909:00
M. KOHLSTEDT*, J. BECKER, C. KORNELI,P.K. SAPPA, H. MEYER, S. MAASS, M. LALK,U. MÄDER, E. BREMER, M. HECKER,U. VÖLKER, C. WITTMANNOsmotic stress response in Bacillus sub-tilis – integration of the fluxome withthe regulatory networks
SRV01009:15
K. PAPENFORT*, D. PODKAMINSKI,C.K. VANDERPOOL, J. VOGELPost-transcriptional activation of theSacP phosphatase counteracts phospho-sugar stress in enterobacteria
SRV01109:30
D. WOLF*, M. REINECK, B. VOIGT,T. MASCHERThe phage-shock protein LiaH of Bacillussubtilis
SRV01209:45
D. WARTENBERG*, M. VOEDISCH,O. KNIEMEYER, R. WINKLER,A.A. BRAKHAGECharacterization of the farnesol-inducedstress response in Aspergillus nidulans
SRV01310:00
S. HUNKE*, P. SCHEERER, N. KRAUSSStructural und functional insight intopilus sensing by the Cpx envelope stresssystem
SRV01410:15
C. EYMANN*, S. SCHULZ, K. GRONAU,D. BECHER, M. HECKER, C.W. PRICEIn vivo phosphorylation patterns of keystressosome proteins define a secondfeedback loop that limits activation ofBacillus subtilis sB
SRV01510:30
I. HANEBURGER*, S. BUCHNER,A. EICHINGER, C. KOLLER, A. SKERRA,K. JUNGSignal perception and transduction bythe transcriptional activator CadC of Es-cherichia coli
SRV01610:45
J. KLEBENSBERGER*, B. COLLEY,S. KJELLEBERGSignal transduction and gene regulationin response to surfactant stress inPseudomonas aeruginosa
Symbiotic Interactions
Hebel Hall
Chair: Ute Hentschel
SIV00309:00
H.B. BODEDrugs from bugs that kill bugs: Biosyn-thesis and function of natural productsfrom entompathogenic bacteria
SIV00409:15
C. THOMPSON*, C. SCHAUER, A. BRUNEHost selection shapes microbial commu-nity structure in cockroach guts
SIV00509:30
R. GROSS*, H. FELDHAAR, C. RATZKAImmune response of the ant Campono-tus floridanus against pathogens and itsobligate mutualistic endosymbiont
SIV00609:45
A. WILKENING*, S. DATTAGUPTAThe gut symbionts of Niphargus am-phipods
SIV00710:00
D. FINK*, C. BOROWSKI, N. DUBILIERSymbiont response of deep-sea hy-drothermal vent mussels to energysource removal
MDV00710:30
M. JOGLER*, H. SIEMENS, H. CHEN,J. OVERMANNBacterial speciation – aquatic Alpha-proteobacteria as a model system
MDV00810:45
S. P. GLAESER*, V. STRATMANN, H.-P. GROSSAR2, J. GLAESERSinglet oxygen and hydrogen peroxidehave different effects on Bacterioplank-ton community composition in a humiclake
Cell Biology II
Room 2.05
Chair: Martin ThanbichlerCo-Chair: Michael Feldbrügge
CBV01009:00
R. RACHEL*, H. HUBER, U. KÜPER,C. MEYER, L. KREUTER, T. HEIMERL,R. WIRTHCell biology of Ignicoccus hospitalis – aunique crenarchaeon
CBV01109:15
M. RIQUELME*, R.W. ROBERSON,S. BARTNICKI-GARCIA, M. FREITAGApical growth in Neurospora crassa
CBV01209:30
E. SOMMER*, A. VAKNIN, A. MÜLLER,V. SOURJIKPhysical organization and interactionsbetween sensory histidine kinases in E.coli
CBV01309:45
G. STEINBERG*, N.J. SEVERS, P. ASHWIN,C. LIN, S. KILARU, M. SCHUSTERUnderstanding long-range endosometrafficking: From measuring to modeling
CBV01410:00
C. DONOVAN*, R. KRÄMER, M. BRAMKAMPA synthetic in vivo system identifies achromosome tethering factor inCorynebacterium glutamicum
CBV01510:15
N. KELLNER*, K. HEIMEL, J. KÄMPERThe Num1 protein of Ustilago maydis isrequired for polar and filamentousgrowth
Wednesday, April 6, 09:00–11:00
43
RGV00410:15
T. WACKER*, T. PFLÜGER, S.L.A. ANDRADE,C. HERNÁNDEZ, S. MAIER, S. HELFMANNRegulation of ammonium uptake andcomplex formation between Amt andGlnK proteins
RGV00510:302P. DEGREIF-DÜNNWALD*, G. UNDENThe role of the cytoplasmic PAS domainof the Escherichia coli histidine kinaseDcuS in signal transduction
RGV00610:45
Ö. SARIKAYA BAYRAM*, O. VALERIUS,H.S. PARK, S. IRNIGER, J. GERKE, M. NI, K.-H. HAN, J.-H. YU, G. BRAUSLaeA control of velvet family regulatoryproteins for light-dependent develop-ment and fungal cell-type specificity
PSV00109:00
C. MAYERDo Gram positives recycle their cellwall?
PSV00209:15
T. J. ERB*, J.A. GERLTA RubisCO-like protein links SAM-metab-olism with isoprenoid biosynthesis
PSV00309:30
A. PAULICK*, K. THORMANNFlagellar motor tuning – a novel hybridmotor in Shewanella oneidensis MR-1
RGV00209:45
S. SCHULMEISTER*, V. SOURJIKProtein exchange dynamics and chemo-taxis cluster stability in Escherichia coli
RGV00310:00
C. M. SHARMA*, S. PERNITZSCH,G. GOLFIERIHelicobacter pylori as a new model or-ganism for riboregulation in bacterialacking the RNA chaperone Hfq
SIV00810:15
K. BAYER*, U. HENTSCHEL-HUMEIDANitrogen fluxes in the Mediterraneansponge Aplysina aerophoba and its sym-biotic microbial consortia
SIV00910:30
H.P. GROSSART*, C. DZIALLASInteractions between the ciliate Stentoramethystinus, green algae and prokary-otes in Lake Stechlin
SIV01010:45
P. FRANKEN*, S. KRESSNER, E. NEUMANN,E. GEORGERegulation of nutrient transporter genesin the extraradical mycelium of the ar-buscular mycorrhizal fungus Glomus in-traradices
Physiology and Regulation
Forum 1 & 2
Chair: Volker MüllerCo-Chair: Bernhard Eikmanns, Franz Narberhaus, Ruth Schmitz-Streit
Wednesday, April 6, 09:00–11:00
How dead is dead IIThe ins and outs of bacterial dormancy
16–17 June 2011Chair
Prof. Dr. Friedrich Götz
Dr. Ralph Bertram
Venue
Eberhard Karls Universität Tübingen
Hörsaalzentrum Morgenstelle
Hörsaal N3 und Foyer
Auf der Morgenstelle 16
72076 Tübingen (DE)
Confi rmed Speakers
Anne Camper (Bozeman, MT/US)
Jonathan Dworkin (New York, NY/US)
Peter Heeg (Tübingen/DE)
Charles William Keevil (Southampton/GB)
Kim Lewis (Boston, MA/US)
Ursula Obst (Karlsruhe/DE)
James D. Oliver (Charlotte, NC/US)
Rakefet Schwarz (Ramat-Gan/IL)
Main Topics
Abstract Topics
bacteria
www.hdid2011.de
BIOspektrum | Tagungsband 2011
PERSONALIA AUS DER MIKROBIOLOGIE 2010 275
Personalia aus der Mikrobiologie 2010Wiebke Hansen habilitierte sicham 2. Dezember 2010 an der Uni-versität Duisburg-Essen (Charak-terisierung und Modulation regu-latorischer T-Zellfunktionen).
Rufe
Jörg Overmann von der Ludwig-Maximilians-Universität Münchenübernahm am 1. Februar 2010 diePosition des geschäftsführendenDirektors des Leibnitz-InstitutesDeutsche Sammlung von Mikro-organismen und Zellkulturensowie eine W3-Professur fürMikrobiologie an der TechnischenUniversität Braunschweig.
Heike Brötz-Oesterhelt von derAiCuris GmbH & Co. KG, Wupper-tal übernahm am 1. März 2010 dieW2-Professur für den LehrstuhlPharmazeutische Biologie an derUniversität Düsseldorf.
Heike Krebber von der Univer-sität Marburg übernahm am 1.April 2010 die W2-Professur fürMolekulare Genetik an der Uni-versität Göttingen.
Bernd Kreikemeyer von der Uni-versität Rostock übernahm am 1.April 2010 die W2-Professur fürMolekulare Bakteriologie an derUniversität Rostock, Institut fürmedizinische Mikrobiologie, Viro-logie und Hygiene.
Katharina Riedel von der Uni-versität Zürich übernahm am 1.Juli 2010 die W2-Professur Mikro-bielle Proteomforschung für denLehrstuhl Mikrobiologie an derTechnischen Universität Braun-schweig.
Jörg Simon von der UniversitätFrankfurt übernahm am 1. August2010 die W2-Professur für Mikro-biologie an der Technischen Uni-versität Darmstadt.
Peter Schupp von der UniversitätGuam, USA übernahm am 1. Ok-tober 2010 die W2-ProfessurUmweltbiochemie an der Univer-sität Oldenburg.
Habilitationen
Ute Warnecke-Eberz habilitiertesich am 4. Mai 2009 an der Uni-versität zu Köln (Responseprä-diktion der neoadjuvanten Thera-pie beim Ösophaguskarzinom:Evaluierung molekularer Markerund Nachweisverfahren für denklinischen Einsatz).
Lars Blank habilitierte sich am13. Januar 2010 an der Techni-schen Universität Dortmund (Sys-tems Biotechnology & Biocataly-sis).
Ralf Heermann habilitierte sicham 20. Januar 2010 an der Lud-wig-Maximilians-Universität Mün-chen (Molekulare Mechanismender bakteriellen Signaltransduk-tion an Beispielen der Enterobak-terien Escherichia coli undPhotorhabdus luminescens).
Kürsad Turgay habilitierte sicham 19. Mai 2010 an der FreienUniversität Berlin in Mikrobiolo-gie (Regulatorische und Generel-le Proteolyse in Bacillus subtilis).
Ingo Schmidt habilitierte sich am31. Mai 2010 an der UniversitätBayreuth (Metabolism of inorga-nic and organic substrates by thefacultative chemolithoautotrophicammonia oxidizer Nitrosomonaseuropaea as basis of its energyconservation).
Bernhard M. Fuchs vom Max-Planck-Institut für Marine Mikro-biologie in Bremen habilitiertesich am 22. Juni 2010 an der Uni-versität Bremen (Cytometric Ana-lyses of Marine PicoplanktonPopulations).
Matthias Brock habilitierte sicham 16. August 2010 an der Uni-versität Jena (Metabolismus alsGrundlage der Virulenz: Stoff-wechselphysiologie pathogenerPilze).
Simone Bergmann habilitiertesich am 15. November 2010 ander Technischen UniversitätBraunschweig (Vom Kommensa-len zum Pathogen: Aufklärung vonInteraktionen zwischen Strepto-coccus pneumoniae und Wirts-faktoren der Blutgerinnung undder extrazellulären Matrix).
Emeritierungen/Pensionierungen
Arnold Geis vom Institut fürMikrobiologie und Biotechnologieam Max-Rubner-Institut in Karls-ruhe wurde am 28. Februar 2010pensioniert.
Kurt Mendgen vom Institut fürPhytopathologie an der Univer-sität Konstanz wurde im Mai 2010emeritiert.
Georg Auling vom Institut fürMikrobiologie an der UniversitätHannover wurde am 30. Septem-ber 2010 pensioniert.
Ulrich Fischer vom Institut fürMarine Mikrobiologie an der Uni-versität Bremen wurde am 1. Ok-tober 2010 pensioniert.
Wolfgang Schumann vom Insti-tut für Genetik an der UniversitätBayreuth wurde am 1. Oktober2010 pensioniert.
Rainer Borriss vom Institut fürBiologie an der Humboldt-Univer-sität zu Berlin wurde am 1. Ok-tober 2010 emeritiert.
Jürgen Kreft vom Institut fürMikrobiologie an der UniversitätWürzburg wurde am 1. Oktober2010 pensioniert.
Wissenschaftliche Preise2010
Roland Lill vom Max-Planck-Insti-tut für Terrestrische Mikrobiolo-gie in Marburg erhielt 2010 vonder Feldberg Foundation forAnglo-German Scientific Exchan-ge den Feldberg Foundation Preisfür seine Arbeiten über die Bio-synthese von Eisen-Schwefel-Pro-teinen in Eukaryoten.
Katrin Breitinger von der Uni-versität Ulm erhielt am 5. Febru-ar 2010 den Frauenförderpreis fürihre Arbeiten über VergleichendeFunktionsanalyse von RamB ausCorynebacterium glutamicumund Rv0465c aus Mycobacteriumtuberculosis.
Markus Bröcker von der Techni-schen Universität Braunschweigerhielt am 8. Februar 2010 denPreis der Vereinten Stiftung derTechnischen Universität Braun-schweig für Studierende und Dok-toranden für seine Promotionsar-beit zum Thema Function andStructure of the Light-Indepen-dent Protochlorophyllide Oxido-reductase.
Bärbel Friedrich von der Hum-boldt-Universität zu Berlin erhieltam 12. Februar 2010 den Fron-tiers in Biological ChemistryAward der Max-Planck-Gesell-schaft für ihre Arbeiten über Sau-erstoff-tolerante Hydrogenasenund deren Anwendungspotenzialauf dem Weg zur biosolaren Was-serstoffproduktion.
Garabed Antranikian neuer Präsidentder TU Hamburg-Harburg
Der Mikrobiologe Prof. Dr. rer. nat. Dr. h.c.Garabed Antranikian wird neuer Präsidentder TUHH. Der 59-jährige Wissenschaftlerwurde einstimmig vom Hochschulrat gewähltund vom akademischen Senat bestätigt.Antranikian übernimmt das Amt am 1. April2011 für die Dauer von sechs Jahren. Antra-nikian studierte Biologie in Beirut und pro-movierte 1980 an der Universität Göttingen,wo er sich 1988 auch habilitierte. 1989 folg-te er dem Ruf an die TU Hamburg-Harburg
und lehrte dort zunächst als Professor für Technische Mikobiolo-gie und seit 2003 als Leiter des gleichnamigen Instituts auf demGebiet der Mikrobiologie und Biotechnologie.
276 PERSONALIA AUS DER MIKROBIOLOGIE 2010
BIOspektrum | Tagungsband 2011
276
Iris Chaberny von der Medizini-schen Hochschule Hannover,Institut für Medizinische Mikro-biologie und Krankenhaushygie-ne, erhielt am 17. März 2010 denHufeland-Preis für Präventivme-dizin für ihre Arbeiten über Methi-cillin-resistente Staphylococcusaureus (MRSA) im Krankenhaus:Surveillance, Management undIntervention im Sinne der Patien-tensicherheit.
Andreas Peschel von der Uni-versität Tübingen erhielt am 28.März 2010 den Hauptpreis derDeutschen Gesellschaft für Hygie-ne und Mikrobiologie (DGHM) fürseine Arbeiten über Staphylococ-cus aureus.
Karolin Graf von der Medizini-schen Hochschule Hannover,Institut für Medizinische Mikro-biologie und Krankenhaushygie-ne, erhielt am 18. April 2010 denProjektpreis 2010 der DeutschenGesellschaft für Krankenhaushy-giene e.V. (DGKH) für ihre Arbei-ten über Analyse und Reduktiontiefer sternaler Wundinfektionenin der Herzchirurgie mit Hilfeumfangreicher Infektionspräven-tionsmaßnahmen.
Ralf Conrad vom Max-Planck-Institut für Terrestrische Mikro-biologie in Marburg erhielt am 18.Mai 2010 den Einstein-Profes-sorship-Preis der Chinese Acade-my of Sciences für seine Arbeitenüber den biogeochemischenKreislauf von atmosphärischenSpurengasen.
Regine Hengge von der Freie Uni-versität Berlin erhielt am 1. Juni2010 den Advanced ResearcherGrant vom European ResearchCouncil für ihre Arbeiten überCyclic-di-GMP: New Concepts inSecond Messenger Signaling andBacterial Biofilm Formation.
Marco Kai von der UniversitätRostock erhielt am 2. Juli 2010den Joachim-Jungius-Preis derUniversität Rostock für seineArbeiten über Analyse und Wir-kungen flüchtiger Metabolite vonSerratia odorifera Rx13.
Ingrid Waege von der UniversitätRegensburg erhielt am 8. Juli2010 den GBM-Diplom-/Master-preis 2010 für ihre Arbeiten überGenetische Transformationsex-perimente in Pyrococcus furiosusund Thermococcus kodakaraen-sis.
Christian Riedel von der Univer-sität Ulm erhielt am 19. Juli 2010den Wissenschaftspreis der StadtUlm für seine Arbeiten über Mole-kulare Mechanismen der Interak-tion von Bifidobakterien und Epi-thelzellen im menschlichen Darm.
Bo Barker Jørgensen vom Max-Planck-Institut für Marine Mikro-biologie in Bremen erhielt am 27.August 2010 den Jim Tiedje Awardfür sein herausragendes Lebens-werk auf dem Gebiet der mikro-biellen Ökologie.
Marc Strous vom Max-Planck-Institut für Marine Mikrobiologiein Bremen erhielt am 27. August2010 den ISME Young Investiga-tors Award für seine bedeutendenArbeiten zur mikrobiellen Ökolo-gie.
Kurt Mendgen von der Univer-sität Konstanz erhielt im Sep-tember 2010 die Anton de Bary-Medaille der Deutschen Phyto-medizinischen Gesellschaft fürseine herausragenden wissen-schaftlichen Leistungen bei dermolekularbiologischen und im-munhistologischen Erforschungder Wirt-Parasit-Interaktionen vonRostpilzen.
Thomas Opfermann vom Leib-niz-Institut für Naturstoff-For-schung und Infektionsbiologie –Hans-Knöll-Institut in Jena –erhielt von der Firma Siemens am8. September 2010 den SiemensAward Excellence in PreclinicalImaging at WMIC für seine Arbei-ten über molekulare Bildgebungdurch PT/CT.
Lubos Polerecky vom Max-Planck-Institut für Marine Mikro-biologie in Bremen erhielt am 11.September 2010 den Biomaris-Forschungspreis für die Entwick-lung neuer Techniken für die Mee-resforschung.
Hauke Harms und Mona Wellsvom Helmholtz-Zentrum fürUmweltforschung UFZ und JanRoelof van der Meer von der Uni-versität Lausanne, Schweiz,erhielten am 16. September 2010den Erwin-Schrödinger-Preis 2010für ihre Arbeiten über Biorepor-terbakterien – Einfachanalyse vonArsen und anderen Umwelt-schadstoffen.
Hendrik Kortmann von der TUDortmund erhielt am 14. Oktober2010 den Klaus-Goerttler-Preis,Deutsche Gesellschaft für Zyto-metrie (DGFZ) für seine Arbeitenüber Einzelzellanalyse.
Tobias J. Erb, VAAM-Promotions-preisträger 2010, von der Univer-sity of Illinois, Urbana, USA erhieltam 20. Oktober 2010 den Hans-Grisebach-Preis für seine Arbei-ten über The Ethylmalonyl-CoAPathway: A Novel Acetyl-CoAAssimilation Strategy.
Ein Team Bielefelder Studenten(Simon Unthan, FriederHänisch, Eva Brombacher,Jonas Aretz, Timo Wolf, NikolasKessler, Armin Neshat, Frede-rik Walter, Nils-Christian Lübkeund Jonas Marschall) erhielt imNovember 2010 bei der Interna-tional Genetically EngineeredMachine competition (iGEM),einem Wettbewerb zu Syntheti-scher Biologie in Boston, Massa-chuetts, USA, einen Gold Awardfür ihr Modulated Acetosyringo-ne Receptor Sensor System(MARSS).
Munisch-Kumar Wadwa erhieltam 09. November 2010 von derUniversität Duisburg-Essen denPreis für Absolventen mit Migra-tionshintergrund für seinen Mas-terabschluss (M. Sc. MedizinischeBiologie) in der Fakultät Biolo-gie/Geographie.
Tanja Schneider von der Univer-sität Bonn erhielt am 12. Novem-ber 2010 den Robert-Koch-Post-doktoranden-Preis für Mikrobio-logie für ihre Arbeiten über dieEntwicklung neuer Antibiotika.
Sandra Bruns, Olaf Kniemeyerund Andreas Thywißen vomLeibniz-Institut für Naturstoff-For-schung und Infektionsbiologie –Hans-Knöll-Institut in Jena –erhielten von der Firma medac am13. Dezember 2010 den medac-Forschungspreis für ihre Arbeitenüber die Immunantwort gegenAspergillus fumigatus-Infektio-nen.
Thorger Lincke, Swantje Behn-ken, Keishi Ishida und MartinRoth vom Leibniz-Institut fürNaturstoff-Forschung und Infek-tionsbiologie – Hans-Knöll-Insti-tut in Jena – erhielten von der Fir-ma medac am 13. Dezember2010 den medac-Forschungspreisfür ihre Arbeiten über das ersteAntibiotikum aus Clostridium.
Gerald Lackner vom Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschungund Infektionsbiologie – Hans-Knöll-Institut in Jena – erhielt vonder Firma medac am 13. Dezem-ber 2010 den medac-Forschungs-preis für seine Arbeiten über dieStruktur und Funktion von Lipo-polysacchariden endofungalerBakterien.
BIOspektrum | Tagungsband 2011
PROMOTIONEN 2010 277
Promotionen 2010
Ghazaleh Nematollahi: Zelltyp-spezifisch exprimierte Gene in derGrünalge Volvox carteriBetreuer: Armin Hallmann
Anja Doebbe: Biosolar hydrogenas a CO2-free renewable energysource: optimization of protonand electron supply to increasethe H2-production rates in greenalgaeBetreuer: Olaf Kruse
Universität Bochum
Lena Gaubig: Regulation desEscherichia coli ibpAB-Operonsunter Hitzestress-BedingungenBetreuer: Franz Narberhaus
Sonja Klüsener: Charakterisie-rung und physiologische Relevanzdes Membranlipids Phosphati-dylcholin für das pflanzenpatho-gene Bakterium AgrobacteriumtumefaciensBetreuer: Franz Narberhaus
Juan Carlos Lorenzo Fajardo:Funktionelle Charakterisierungeines potenziellen Regulators derHäm-Homöostase in Pseudomo-nas aeruginosaBetreuerin: Nicole Frankenberg-Dinkel
Björn Gisk: Biochemische undbiophysikalische Untersuchungenan pflanzlichen und bakteriellenHämoxygenasenBetreuerin: Nicole Frankenberg-Dinkel
Jens Kortmann: Structure andfunction of novel RNA thermo-metersBetreuer: Franz Narberhaus
Sandra Bloemendal: Moleculargenetics of fruiting body forma-tion in the filamentous fungusSordaria macrospora: Identifica-tion of interaction partners ofdevelopmental proteins in vitroand in vivoBetreuer: Ulrich Kück
David Löper: DNA-bindende Pro-teine des Antibiotika-Produzen-ten Acremonium chrysogenum:Biochemische Charakterisierungund molekulargenetische Funk-tionsanalysenBetreuer: Ulrich Kück
Universität Bayreuth
Stefan Gilch: Ammonium-Mono-oxygenase aus Nitrosomonaseuropaea: Charakterisierung undIsolierung des nativen EnzymsBetreuer: Ortwin Meyer
Freie Universität Berlin
Britta Kraushaar: Ein konjugati-ves Typ IV-Sekretionssystem inder Gattung Yersinia: Verbreitungund VariabilitätBetreuer: Bernd Appel (Bundesin-stitut für Risikobewertung), RupertMutzel
Sascha Brunke: Molekularbiolo-gische Untersuchungen zur Pig-mentsynthese von humanpatho-genen HefenBetreuer: Bernhard Hube (HansKnöll-Institut Jena), Rupert Mutzel
Susan Busse: UnorthodoxeMechanismen der Regulationinnerhalb von Zweikomponenten-system in Escherichia coliBetreuer: Regine Hengge, KürsadTurgay
Humboldt-Universität zuBerlin
Alexander Schwarze: Light-dri-ven H2 production by connectingO2-tolerant [NiFe]-hydrogenasesfrom Ralstonia eutropha H16 withthe cyanobacterial photosystem IBetreuerin: Bärbel Friedrich
Anke Licht: Charakterisierungvon zwei ABC-Importsystemen imAcarbose-Metabolismus vonActionomycetenBetreuer: Erwin Schneider
Universität Bielefeld
Christoph Hellweg: Untersu-chung der Antwort des symbion-tischen Bodenbakteriums Sinor-hizobium meliloti 1021 auf azidi-schen pH-StressBetreuer: Alfred Pühler
Monika Flügel: Transkriptom-analysen zur Interaktion von Cla-vibacter michiganensis subsp.michiganensis mit seiner Wirts-pflanzeBetreuer: Rudolf Eichenlaub
Universität Bonn
Bettina Franz: Untersuchungenzum Sox-Multienzymkomplex inAllochromatium vinosum und zurVerwertung von Elementar-schwefel in phototrophen Schwe-feloxidierernBetreuerin: Christiane Dahl
Ute Selan: Biochemische Unter-suchungen zum DsrC Protein undzum DsrEFH Heterohexamer vonAllochromatium vinosumBetreuerin: Christiane Dahl
Fabian Grein: Biochemical, bio-physical and functional analysisof the DsrMKJOP transmembra-ne complex from AllochromtatiumvinosumBetreuerin: Christiane Dahl
Technische UniversitätBraunschweig
Katja Böhme: Identification andcharacterization of regulatory fac-tors and regulatory RNA elementscontrolling the expression of theprimary invasion factors invasinand YadA in Yersinia pseudotu-berculosisBetreuerin: Petra Dersch
Markus Bröcker: Function andStructure of the Light-Indepen-dent Protochlorophyllide Oxido-reductaseBetreuer: Dieter Jahn
Boyke Bunk: Comparative andFunctional Genomics of Bacillusmegaterium DSM319Betreuer: Dieter Jahn
Julia Garbe: Isolation of Pseudo-monas aeruginosa phages andtheir application for the analysisof lipopolysaccharidesBetreuer: Dieter Jahn
Ines Gruner: Die funktionelleCharakterisierung des anaerobenRegulators Fnr und die Regulationder anaeroben Genexpression inBacillus subtilisBetreuer: Dieter Jahn
Johannes Klein: Bioinformaticsof gene regulatory networks inpathogenic bacteriaBetreuer: Dieter Jahn
Anika March: Die Regulation derAcetoinbiosynthese in Bacillussubtilis durch den transkriptio-nellen Regulator AlsRBetreuer: Dieter Jahn
Andreas Roth: Vektorsystem fürdie Produktion und Reinigung vonrekombinanten Proteinen inAspergillus nigerBetreuerin: Petra Dersch
Claudia Schulz: Characterisationof Enzymes involved in Tetrapyr-role BiosynthesisBetreuer: Dieter Jahn
Simon Stammen: Genetic toolsfor high yield protein productionwith Bacillus megateriumBetreuer: Dieter Jahn
Universität Bremen/MPIfür Marine Mikrobiologie
Christina Liliana Moraru: Fluo-rescence in situ hybridization ofgenes in environmental micro-biologyBetreuer: Rudolf Amann
Caroline Verna: Phylogeny anddiversity of symbionts from wha-le fall invertebratesBetreuerin: Nicole Dubilier
Paola Gomez: Marine Bacteroi-detes: distribution patterns androle in the degradation of organicmatterBetreuer: Rudolf Amann
Regina Schauer: Diversity andfunction of microbial communi-ties in sediments from differentdeep-sea habitatsBetreuer: Rudolf Amann
Stefanie Grünke: Diversity ofMat-forming Sulfide-oxidizingBacteria at Continental MarginsBetreuer: Rudolf Amann
Karina Stucken: Physiogenomicsof Cylindrospermopsis racibors-kii and Raphidiopsis brookii(Cyanobacteria) with Emphasis onEvolution, Nitrogen Control andToxin BiosynthesisBetreuer: Rudolf Amann
Caroline Rühland: Characteriza-tion of bacterial endo- and ecto-symbionts of oligochaete wormsfrom marine sediments: Phyloge-ny and metabolic potentialBetreuer: Rudolf Amann
278 PROMOTIONEN 2010
BIOspektrum | Tagungsband 2011
278
Lars Schreiber: Assessing theGenetic Potential of UncultivatedSulfate Reducing BacteriaBetreuer: Rudolf Amann
Luciana Raggi: Bacterial-bivalveassociations, from an asphalt coldseep to shallow watersBetreuerin: Nicole Dubilier
Mohammad Al-Najjar: Flow oflight energy in benthic photosyn-thetic microbial matsBetreuer: Bo Barker Jørgensen
Laura Wehrmann: Biogeochemi-cal processes in sediments asso-ciated to cold-water coral eco-systems – From living reefs toancient moundsBetreuer: Bo Barker Jørgensen
Katharina Kohls: Diversity, sali-nity adaptation, and role in car-bon cycling of microbial commu-nities inhabiting the oxic layer ofintertidal hypersaline microbialmatsBetreuer: Friedrich Widdel
Thomas Holler: MikrobiologischeStudien zur anaeroben Oxidationvon Methan (AOM)Betreuer: Friedrich Widdel
Ilaria Pizzetti: Abundance, dis-tribution and diversity of plank-tonic Planctomycetes in coastalzonesBetreuer: Rudolf Amann
Rita Dunker: Motility of the giantsulfur bacterium BeggiatoaBetreuer: Bo Barker Jørgensen
International JacobsUniversity Bremen/MPI fürMarine Mikrobiologie
Angélique Gobet: Microbial Com-munity Ecology of TemperateCoastal SandsBetreuerin: Antje Boetius
Sandra Schöttner: BacterialHabitat Differentiation in Cold-and Warm-water Coral Reef Eco-systemsBetreuerin: Antje Boetius
Melissa Beth Duhaime: Explo-ring the Marine VirosphereBetreuer: Frank-Oliver Glöckner
Technische UniversitätDortmund
Rainer Gross: Catalytic Biofilmsin Membrane Reactors: Continu-ous Asymmetric Epoxidation ofStyrene and RegioselectiveHydroxylation of AlkanesBetreuer: Katja Bühler, AndreasSchmid
Technische UniversitätDresden
Anne Kretzschmar: Die Beein-flussung der Succinatproduktiondurch die veränderte Aktivität derSuccinyl-CoA-Synthetase und derPyruvat-Carboxylase in YarrowialipolyticaBetreuer: Gerold Barth
Johannes Wollbold: AttributeExploration of Discrete TemporalTransitionsBetreuer: Reinhard Guthke, Bern-hard Ganter
Universität Duisburg-Essen
Nina Schmidt: The serine prote-ase HtrA1 is a novel regulator ofcell division and plays an impor-tant role in the malignant trans-formationBetreuer: Michael Ehrmann
Linda Trübestein: Structural andbiochemical characterization ofthe human serine protease HtrA1Betreuer: Michael Ehrmann
Juliane Weski: The network ofthe periplasmic protein qualitycontrol in Escherichia coliBetreuer: Michael Ehrmann
Christiane Lütticke: Characteri-zation of the putative periplasmicmetalloproteases YfgC and YggGof E. coliBetreuer: Michael Ehrmann
Andre Plagens: Characterisationof the CRISPR/Cas system of thehyperthermophilic ArchaeumThermoproteus tenaxBetreuer: Reinhard Hensel
Britta Huber: Mikrobielle Deriva-tisierung von Bismut im Maus-Modell und in vitro-Analysen derBiogenese von TrimethylbismutBetreuer: Reinhard Hensel
Universität Düsseldorf
Tanja Hanke: Studies on centralcarbon metabolism and respira-tion of Gluconobacter oxydans621HBetreuer: Hermann Sahm
Jens Nickel: Identifizierung undCharakterisierung von Regulato-ren der Acyl-CoA-Carboxylasen inCorynebacterium glutamicumBetreuer: Hermann Sahm
Jan van Ooyen: Systemische Ana-lyse des Zitratzyklus in Coryne-bacterium glutamicumBetreuer: Michael Bott
Han Min Woo: Characterizationof the phosphate starvation re-sponse of Corynebacterium glu-tamicum using matabolomicsBetreuer: Michael Bott
Meike Baumgart: Novel insightsinto characteristics, relevanceand regulation of corynebacterialaconitaseBetreuer: Michael Bott
Norma Stäbler: Untersuchungenzur Bildung von D-Aminosäurenmit Corynebacterium glutamicumBetreuer: Michael Bott
Universität Erlangen-Nürnberg
Marcus Krüger: Informations-übertragung im Tetrazyklin-Repressor als Grundlage für denallosterischen Induktionsmecha-nismusBetreuer: Wolfgang Hillen
Dagmar Goeke: Novel oligopep-tides controlling TetR repressor-based gene regulationBetreuer: Wolfgang Hillen
Britta Beyerlein: Konstruktionvon Reporter-Regulator-Kompo-nenten mit dem Transkriptions-induzierenden Peptid TIP in Sal-monella entericaBetreuer: Wolfgang Hillen
Christina Danke: A novel regula-tory system for tightly controlledand long-term inducible transge-ne expression in human cell linesBetreuer: Wolfgang Hillen
Johannes Amon: Mining thegenomes of actinomycetes: Iden-tification of metabolic pathwaysand regulatory networksBetreuer: Andreas Burkovski
Kristin Hasselt: Biochemischeund molekularbiologische Unter-suchungen zu AmtR, dem Stick-stoffregulator in CorynebacteriumglutamicumBetreuer: Andreas Burkovski
Nadine Rehm: Biochemische undmolekularbiologische Untersu-chungen zur Verstoffwechselungvon Ammonium und Glutamin inCorynebacterium glutamicumBetreuer: Andreas Burkovski
Xandra Grünz: Generierung vonMauslinien zur Doxyzyklin-regu-lierbaren Expression von Transge-nen in B-lymphoiden ZellenBetreuer: Wolfgang Hillen
Universität Frankfurt amMain
Michael Fritz: Identifizierung undCharakterisierung eines VO-FO-Hybridmotors in der Na+-F1FO-ATP-Synthase aus Acetobacte-rium woodiiBetreuer: Volker Müller
Michael Dambeck: Regulationder Genexpression in halophilenArchaeaBetreuer: Jörg Soppa
Britta Meyer: Struktur und Funk-tion des Ribosomenbiogenese-Faktors Nep1Betreuer: Karl-Dieter Entian
Universität Freiburg
Christine Kaimer: Two BacterialDNA translocases coordinatechromosome segregation and celldivisionBetreuer: Peter Graumann
Walter Hugo Ramos Vera: Auf-klärung und Regulation des auto-trophen CO2-Fixierungsweges inThermoprotealesBetreuer: Georg Fuchs
Hana Smejkalova: MethanolAssimilation in Methylobacteriumextorquens AM1Betreuer: Georg Fuchs
Liv Rather: Structure and mecha-nism of benzoyl-CoA epoxidaseBoxAB from Azoarcus evansiiBetreuer: Georg Fuchs
BIOspektrum | Tagungsband 2011
279
Jan Zarzycki: The 3-Hydroxypro-pionate Bi-Cycle: Missing Enzy-mes, Distribution, and VariousFunctionsBetreuer: Georg Fuchs
Universität Gießen
Jasmin Weisel: RNA prozessie-rende Enzyme und ein BoxS/D-sRNA enthaltender Ribonukleo-protein-Komplex in Halobacte-rium salinarum NRC-1Betreuerin: Gabriele Klug
Sebastian Metz: Blaulichtabhän-gige Genregulation in Rhodobac-ter sphaeroides: Untersuchungenzur physiologischen Funktion derBlaulichtrezeptoren AppA, CryBund LOVBetreuerin: Gabriele Klug
Sobha Rani Basineni: Processingand turn-over of the small non-coding RNA OxyS and post-tran-scriptional regulation of RpoSlevels by the sRNAs OxyS andDsrR and the Hfq protein in E. coliBetreuerin: Gabriele Klug
Aaron Nuss: Alternative sigmafactors in the photooxidativestress response of RhodobactersphaeroidesBetreuerin: Gabriele Klug
Universität Göttingen
Florian Schulze: The role of Pcl5pand Pcl7p in the Gcn4 stabilityregulation of SaccharomycescerevisiaeBetreuer: Gerhard Braus
Nicole Rachfall: Translationalcontrol of the ribosomal proteinAsc1p7Cpc2p in SaccharomycescerevisiaeBetreuer: Gerhard Braus
Yasmine Bernhards: Untersu-chung der Fruchtkörperentwick-lung bei dem Hyphenpilz Sorda-ria macrosporaBetreuerin: Stefanie Pöggeler
Lope Florez Weidinger: Systemsbiology in Bacillus subtilis: data-bases for gene function and soft-ware tools for pathway discoveryBetreuer: Jörg Stülke
Britta Herzog: Metabolic anddevelopmental function of thetranscription factor Gcn4p of Sac-charomyces cerevisiaeBetreuer: Gerhard Braus
Daniela Justa-Schuch: Regula-tion of septum formation byRHO4 GTPase signalling in Neu-rospora crassaBetreuer: Gerhard Braus
Volker Klix: Analyse des Kreu-zungstyp-Locus des filamentösenAscomyceten Sordaria macro-sporaBetreuerin: Stefanie Pöggeler
Nico Pietack: Investigation of gly-colysis in Bacillus subtilisBetreuer: Jörg Stülke
Michael Rachinger: Stammde-sign in Bacillus licheniformisBetreuer: Rolf Daniel
Haitham Saad Eddin: Investiga-tion of molybdenum iron proteinexpression and activity in Wolli-nella succinogenesBetreuer: Oliver Einsle
Sebastian Schmidl: Pathogeni-city of a minimal organism: Roleof protein phosphorylation inMycoplasma pneumoniaeBetreuer: Jörg Stülke
Marco Schwarzer: Physiologi-sche Untersuchungen zur Regu-lation des Aminosäure-Stoff-wechsels von Bacillus lichenifor-mis DSM 13Betreuer: Wolfgang Liebl
Antje Wollherr: KomparativeGenomanalyse zur Stammopti-mierung produktionsnaher Bacil-lus-StämmeBetreuer: Wolfgang Liebl
Universität Greifswald
Jessica Rehdorf: Discovery ofnovel Baeyer-Villiger monooxyge-nases and their application inorganic synthesisBetreuer: Uwe Bornscheuer
Helge Jochens: Entwicklung neu-er Konzepte für das Protein-Engi-neering am Beispiel von Enzymenmit a/ß-HydrolasefaltungBetreuer: Uwe Bornscheuer
Matthias Höhne: Syntheseoptisch aktiver Amine mit Trans-aminasenBetreuer: Uwe Bornscheuer
Kristian Geitner: Untersuchun-gen zur Vergrößerung des Reak-tionsmaßstabes am Beispiel einerenantioselektiven enzymatischenBaeyer-Villiger-OxidationBetreuer: Uwe Bornscheuer
Sebastian Bartsch: Proteinde-sign einer Phenylalanin-Ammoni-ak-Lyase: Veränderung des Sub-stratspektrums und Untersu-chungen zum MechanismusBetreuer: Uwe Bornscheuer
Anna Schließmann: Protein engi-neering of a Pseudomonas fluo-rescens esterase: Alteration ofsubstrate specificity and stereo-selectivityBetreuer: Uwe Bornscheuer
Kristina Hempel: Entwicklungund Anwendung von Massen-spektrometrie-basierten Metho-den zur Identifizierung und Quan-tifizierung von Zelloberflächen-assoziierten Proteinen deshumanpathogenen BakteriumsStaphylococcus aureusBetreuer: Michel Hecker
Stephan Fuchs: Physiologischeund molekularbiologische Unter-suchungen zur Adaptation vonStaphylococcus aureus an anae-robe BedingungenBetreuer: Michel Hecker
Universität Halle-Witten-berg
Simone Hahn: Analyse des mole-kularen Mechanismus der Akti-vität des Typ-III-Effektors AvrBs3aus Xanthomonas campestris pv.VesicatoriaBetreuer: Dietrich Nies
Felix Berthelmann: Untersu-chungen zur intrazellulären Ver-teilung der Komponenten des Tat-Systems in Escherichia coliBetreuer: Thomas Brüser
Daniel Thieme: Alte Faktoren mitneuen Funktionen – Kupferent-giftung in Escherichia coliBetreuer: Dietrich Nies
Annegret Boch: FunktionelleCharakterisierung von ZIP-Trans-portproteinen aus Schizosaccha-romyces pombe und ArabidopsisBetreuer: Dietrich Nies
Nadine Taudte: Eisen und Man-gan: Wechselwirkungen undHomöostase in Escherichia colimit dem Schwerpunkt ZupTBetreuer: Gregor Grass
Universität Hamburg
Catur Sriherwanto: Studies onthe Solid State Fermentation ofCassava Bagasse for Animal FeedBetreuer: Bernward Bisping
Tri Erny Dyahningtyas: Potencyof Chitosan as a Bioactive EdibleCoating for Preservation of Meatof Common Shrimps (Crangoncrangon)Betreuer: Bernward Bisping
Universität Hannover
Patrick Stolle: Nachweis einesneuartigen Tyrosyl-MnIIIMnIII
gekoppelten Spinsystems in derMn-Ribonucleotid-Reduktase vonCorynebacterium ammoniagenesund Corynebacterium glutami-cumBetreuer: Georg Auling
Medizinische HochschuleHannover
Claudia Dürr: Negative regulato-ry mechanisms of intestinal epi-thelial innate immune activationBetreuer: Mathias Hornef
Katrin Janik: Functional charact-erization of the chlamydial effec-tor protein CT166 and studiesrevealing the influence of in vitroculture conditions onto in vivovirulence of Chlamydophila pneu-moniae in a mouse infectionmodelBetreuer: Andreas Klos
Anna Leybo: Interaction of Heli-cobacter flagellins with humanand murine cells: TLR5-indepen-dent signalling and role of alter-native innate immune receptorsBetreuerin: Christine Josenhans
Claudia Moccia: Mechanisms ofHelicobacter pylori to generategenetic variability during chronicinfectionBetreuer: Sebastian Suerbaum
280 PROMOTIONEN 2010
BIOspektrum | Tagungsband 2011
280
Universität Jena
Sandra Kreher: Anaerobe O-Demethylierung in Acetobacte-rium dehalogenans: Untersu-chungen zu den etherspaltendenMethyltransferasen I – Zinkbin-dung und SubstratspezifitätBetreuerin: Gabriele Diekert
Lidan Ye: Studies on the micro-bial halogen cycle: Reactions offungal peroxidases and bacterialreductive dehalogenasesBetreuerin: Gabriele Diekert
Theodore Asiimwe: Molecularcharacterization of a fungal alde-hyde dehydrogenase in the Tri-choloma vaccinum-spruce ecto-mycorrhizaBetreuerin: Erika Kothe
Daniela Siegel: Black slate – sur-face alteration due to fungal acti-vityBetreuerin: Erika Kothe
Judith Behnsen: Interaktion vonAspergillus fumigatus mit demImmunsystem unter besondererBerücksichtigung des Komple-mentsystemsBetreuer: Axel Brakhage
Christian Fleck: Untersuchungenzur Redundanz im Pilzmetabo-lismus am Beispiel von Aspergil-lus nidulans, Aspergillus fumiga-tus und Saccharomyces cerevisi-aeBetreuer: Axel Brakhage, MatthiasBrock
Marcel Thön: Redoxregulierungdes CCAAT-bindenden Komplexes(AnCF) von Aspergillus nidulansBetreuer: Axel Brakhage
Sebastian Bergmann: Regulationvon Sekundärmetabolit-Genclus-tern in Aspergillus nidulansBetreuer: Axel Brakhage
Martin Richter: BiochemischeCharakterisierung multifunktio-neller Oxygenasen aus mikrobiel-len Sekundärmetabolit-Biosyn-thesewegenBetreuer: Christian Hertweck
Daniela Albrecht: Integration vonTranskriptom- und Proteomdatenhuman-pathogener PilzeBetreuer: Reinhard Guthke, Axel Brakhage
Benjamin Busch: Functional ana-lysis of the non-canonical bio-synthetic pathways of aureothinand rhizoxinBetreuer: Christian Hertweck
Michelle Unger: Molekularbiolo-gische Grundlage der Cervimycin-BiosyntheseBetreuer: Christian Hertweck
André Schmidt: Die Stressant-wort von Aspergillus fumigatusauf Eisenmangel: VergleichendeProteomanalysen und die Cha-rakterisierung Eisen-regulierterProteineBetreuer: Axel Brakhage
Katharina Gropp: Auseinander-setzung zwischen der humanpa-thogenen Hefe Candida albicansund dem angeborenen Immun-system des WirtsBetreuer: Peter Zipfel
Mirko Ludwig: Funktionelle Cha-rakterisierung des Faktor H ver-wandten Proteins CFHR3Betreuer: Peter Zipfel
Technische UniversitätKaiserslautern
Ilka Zerfaß: PBP2x-Mutationen inStreptococcus pneumoniae: Aus-wirkung auf β-Laktam-Resistenzund ZellphysiologieBetreuerinnen: Regine Hakenbeck,Dalia Denapaite
Yvonne Schähle: GenomischeDiversität und Evolution von Viru-lenzdeterminanten in Strepto-coccus spp.Betreuerinnen: Regine Hakenbeck,Dalia Denapaite
Katja Todorova: β-Lactam-Resis-tenz in Streptococcus spp.: Eineneue Resistenzderminante murEBetreuer: Regine Hakenbeck,Patrick Maurer
Universität Karlsruhe, KIT
Christian Kastner: Regulationder Sporenkeimung und desSekundärmetabolismus durchLicht in Aspergillus nidulansBetreuer: Reinhard Fischer
Uta Deiting: Klonierung undheterologe Expression der Nitril-hydratase aus Rhodococcus spec.Betreuer: Reinhard Fischer
Sylvia Müller: Untersuchung desLichtregulatorkomplexes inAspergillus nidulansBetreuer: Reinhard Fischer
Nicole Helber: Analysis of thesugar transport and metabolismin the arbuscular mycorrhizalsymbiosisBetreuerin: Natalia Requena
Gyu-Sung Cho: Determinationand expression analysis of func-tional genes in Lactobacillus plan-tarumBetreuer: Charles Franz
Universität Kiel
Nancy Weiland: Screening forquorum sensing interfering com-pounds using a metagenomicapproach: A novel strategy to pre-vent biofilm formationBetreuerin: Ruth Schmitz-Streit
Anja Büttner: Transcriptional res-ponses upon oxygen exposure inthe methanogenic archaeonMethanosarcina mazei strain Gö1Betreuerin: Ruth Schmitz-Streit
Leibniz-Institut für Meeres-wissenschaften IFM-GEO-MAR, Kiel
Marcus Tank: Ecological and phy-logenetic studies on purple sul-fur bacteria based on their pufLMgenes of the photosynthetic reac-tion centerBetreuer: Johannes F. Imhoff
Universität Köln
Tina Radespiel: Transport vonorganischen Säuren als Vorstu-fen der Aminosäurebiosynthesein Corynebacterium glutamicumBetreuer: Reinhard Krämer
Tobias Mohrbach: Untersuchun-gen zum Export von Tryptophanin Escherichia coliBetreuer: Reinhard Krämer
Jens Novak: Regulation der Glu-cosylglycerol-Phosphat-Synthaseaus dem Cyanobacterium Syn-echocystis sp. PCC 6803Betreuer: Reinhard Krämer
Inga Wadenpohl: The cell divi-sion protein FtsL of Bacillus sub-tilis and its proteolysisBetreuer: Reinhard Krämer
Universität Konstanz
Nicolai Müller: Reversed electrontransport in syntrophic degrada-tion of glucose, butyrate, andethanolBetreuer: Bernhard Schink
Julia Roeder: Syntrophe Oxida-tion der Fettsäure Acetat und denbiogenen Amins Cadaverin (1,5-Diaminopentan) durch definiertemethanogene KokulturenBetreuer: Bernhard Schink
Felix ten Brink: Acetylene hydra-tase from Pelobacter acetyleni-cus – functional studies on a gas-processing tungsten, iron-sulfurenzyme by site directed mutage-nesis and crystallographyBetreuer: Peter M. H. Kroneck
Sonja Weinitschke: New inter-mediates, pathways, enzymes andgenes in the microbial metabo-lism of organosulfonatesBetreuer: Alasdair M. Cook
Universität Leipzig
Anke Kuppardt: Improvement ofbioreporter bacteria-based testsystems for the analysis of arse-nic in drinking water and the rhi-zosphereBetreuer: Hauke Harms
Simon Wischgoll: Membranpro-teine und Glutaryl-CoA Dehydro-genasen im Aromatenstoffwech-sel obligat anaerober BakterienBetreuer: Matthias Boll
Universität Mainz
Burkhard Knopf: Methylierungvon anorganischem Quecksilberim Intestinaltrakt des Kompost-wurms Eisenia foetidaBetreuer: Helmut König
Melanie Larisika: BiochemischeCharakterisierung des Expoly-saccharids von Pediococcus par-vulus B399, sowie dessen Hydro-lyse durch eine neue β-1,3 Glu-canase aus Delftia sp. MV01Betreuer: Helmut König
Julia Bauer: The C4-Dicarboxyla-te Carriers DcuB and DctA ofEscherichia coli : Function asCosensors and TopologyBetreuer: Gottfried Unden
BIOspektrum | Tagungsband 2011
281
Florian Reinhart: The OxygenSensors FNR from Escherichiacoli and NreABC from Staphylo-coccus carnosusBetreuer: Gottfried Unden
Universität Marburg/MPIfür Terrestrische Mikrobio-logie
Ivana Djurdjevic: Production ofglutaconic acid in recombinantEscherichia coliBetreuer: Wolfgang Buckel
Jin Zhang: On the enzymaticmechanism of 4-hydroxybutyryl-CoA dehydratase and 4-hydroxy-butyrate CoA-transferase fromClostridium aminobutyricumBetreuer: Wolfgang Buckel
Iryna Bulyha: Regulation of moti-lity of Myxococcus xanthusBetreuerin: Lotte Søgaard-Ander-sen
Claudia Lüke: Molecular ecologyand biogeography of methano-trophic bacteria in wetland ricefieldsBetreuer: Peter Frenzel
Sascha Krause: Ökologie metha-notropher Bakterien: RäumlicheVerteilung und Funktion metha-notropher Bakterien in Feuchtge-bietenBetreuer: Peter Frenzel
Yuliya Khrunyk: Die Rolle sekre-tierter Proteine während der bio-trophen Entwicklung von Ustila-go maydisBetreuerin: Regine Kahmann
Steffi Treitschke: Zellbiologischeund biochemische Charakterisie-rung des Ustilago maydis Viru-lenzfaktors Mcs1 (Myosin-Chitin-synthase 1)Betreuer: Gero Steinberg
Juliane Kühn: Eine Frage derForm: Mechanismen morphologi-scher Differenzierung in Bakte-rienBetreuer: Martin Thanbichler
Technische UniversitätMünchen/Helmholtz-Zentrum München
Franz Bergmann: Physiologicalpotential of the anaerobic naph-thalene-degrading enrichmentculture N47: Genomic, proteomicand stable isotope studiesBetreuer: Rainer Meckenstock
Abu Laban Nidal: Anaerobic ben-zene degradation by iron- and sul-fate-reducing enrichment cultu-resBetreuer: Rainer Meckenstock
Armin Meyer: Reaktionswegabhängige Isotopenfraktionierungbeim Abbau von TriazinenBetreuer: Martin Elsner
Julian Bosch: Thermodynamicand kinetic constraints on micro-bial iron reductionBetreuer: Rainer Meckenstock
Giovanni Pilloni: Verteilung vonSchadstoffabbauern und respira-torischen Gilden und die Expres-sion von Abbaugenen in statio-nären und nicht stationärenSchadstofffahnenBetreuer: Tillmann Lüders
Carsten Kröger: Molekulare Cha-rakterisierung des myo-InositolMetabolismus von Salmonellaenterica serovar Typhimurium:Genetik, Transport und Regula-tionBetreuer: Thilo Fuchs
Kristina Schauer: Identifizierungund Charakterisierung metaboli-scher und struktureller Targetsfür antimikrobielle Substanzen inListeria monocytogenesBetreuer: Siegfried Scherer
Anne Bleicher: Antagonistic acti-vity of complex cheese surfacemicrobial consortia against food-borne pathogensBetreuer: Siegfried Scherer
LMU München/Helmholtz-Zentrum München
Daniel Hilger: Electron para-magnetic resonance spectrosco-pic analyses of membrane trans-port proteinsBetreuer: Heinrich Jung
Roland Wenter: Molecular basisof inter- and intraspecific multi-cellularity in prokaryotesBetreuer: Jörg Overmann
Tatiana Binder: Das N-(3-Oxodo-decanoyl)-L-Homoserinlacton vonPseudomonas aeruginosa inhi-biert Funktionen humaner den-dritischer ZellenBetreuer: Anton Hartmann
Dan Li: Phenotypic variation andmolecular signalling in the inter-action of the rhizosphere bacteriaAcidovorax sp. N35 and Rhizo-bium radiobacter F4 with rootsBetreuer: Anton Hartmann
Chen Xiao: Development andcharacterization of an immuno-chemical test system for thedetermination of bacterial signalmolecules (N-acylated homoseri-ne lactones)Betreuer: Anton Hartmann
Doreen Fischer: Molekulare Ana-lyse diazotropher Bakterien inZuckerrohr (Saccharum officina-rum)Betreuer: Anton Hartmann
Max-Planck-Institut für Bio-chemie München
Christian Hoffmann: Strategiesfor cryo-electron tomography ofthe mycobacterial cell envelopeand its pore proteins and func-tional studies of porin MspA fromMycobacterium smegmatisBetreuer: Wolfgang Baumeister
Rubén Fernandez-Busnadiego:Structural analysis of presynap-tic architecture by cryo-electrontomographyBetreuer: Wolfgang Baumeister
Andreas Korinek: High through-put approaches for 2D and 3Dsingle particle investigationsBetreuer: Wolfgang Baumeister
Universität Münster
Irma Carbajal-Rodrigues: Bio-synthesis and biotechnologicalproduction of polythioestersBetreuer: Alexander Steinbüchel
Jan Hendrik Wübbeler: Studieson the microbial catabolism of3,3’-dithiodipropionic acidBetreuer: Alexander Steinbüchel
Steffen Lindner: Characteriza-tion of carbon catabolism and itsconnection to polyphosphatemetabolism in CorynebacteriumglutamicumBetreuer: Volker F. Wendisch
Alvin Brian Lange: Studies on thebiosynthesis and export of neu-tral lipids in Alcanivorax spp.Betreuer: Alexander Steinbüchel
Jens Kroll: Bacterial plasmidaddiction systems for biotechno-logyBetreuer: Alexander Steinbüchel
Martin Wagenknecht: Actino-bacterial linear plasmids – occur-rence, characterization of novelelements, and replication studiesof pAL1Betreuer: Friedhelm Meinhardt
Yasser Mohamed Hafez Abd-El-Karem: Studies on Cyanophycinmetabolism in recombinant rhi-zobia and its impact on alfalfasymbiosisBetreuer: Alexander Steinbüchel
Katja Peplinski: Genome-widetranscriptome analyses of Rals-tonia eutropha H16Betreuer: Alexander Steinbüchel
Universität Oldenburg
Helge-Ansgar Giebel: The Roseo-bacter Clade Affiliated (RCA)Cluster: Its occurrence and abun-dance in the Southern Ocean andNorth Sea and physiologicalinvestigations of isolated strainsBetreuer: Meinhard Simon
Universität Regensburg
Melanie Surma: Charakterisie-rung von TrmB und TrmBL1, zweiTranskriptionsregulatoren im Zen-trum des Zuckerstoffwechselsvon Pyrococcus furiosusBetreuer: Michael Thomm
Mirijam Zeller: Die Funktion vonTranskriptionsfaktor (II)B undMechanismus der Transkrip-tionsinitiationBetreuer: Michael Thomm
282 PROMOTIONEN 2010
BIOspektrum | Tagungsband 2011
282
Universität Rostock
Holger Janssen: Das Proteomund Transkriptom von Clostridiumacetobutylicum bei unterschied-lichen pH-Werten im Chemosta-tenBetreuer: Hubert Bahl
Marco Kai: Analyse und Wirkun-gen flüchtiger Metabolite von Ser-ratia odorifera Rx13Betreuerin: Birgit Piechulla
Stephan Klän: Die osmoprotek-tiven Heteroside Glucosylglycerolund Glucosylglycerat und derenRollen bei der Salzakklimation vonCyanobakterien – Aspekte derRegulation, der ökologischenFunktion und der biotechnologi-schen AnwendungBetreuer: Martin Hagemann
Cordula Lembcke: MolekulareAnalyse der S. pyogenes-Biofilm-bildungBetreuer: Bernd Kreikemeyer
Kerstin Standar: In vitro-Model-le oraler BiofilmeBetreuer: Andreas Podbielski
Juliane Völkel: Genetische Vari-abilität und molekulare Popula-tionsstruktur von Bartonella hen-selaeBetreuer: Andreas Podbielski
Sabine Glaubitz: Distribution anddiversity of chemolithoautotro-phic microorganisms in Balticpelagic redoxclinesBetreuer: Matthias Labrenz
Universität des Saarlandes
Mareike Kelkel: Untersuchungenzum zellulären Mechanismus derER/Cytosol-Retrotranslokationeiner cytotoxischen a-Variantedes viralen A/B-Toxins K28 derHefeBetreuer: Manfred Schmitt
Tina Schnöder: Untersuchungenzum intrazellulären Transportwegund der in vivo-Toxizität von RicinA (RTA) in HefeBetreuer: Manfred Schmitt
Barbara Walch: “Delivery” funk-tioneller Nukleinsäuren in Anti-gen-präsentierende Säugerzellenmittels rekombinanter HefenBetreuer: Manfred Schmitt
Universität Stuttgart
Michael Lienemann: Character-isation and engineering of pro-tein-carbohydrate interactionsBetreuer: Georg Sprenger
Katrin Gottlieb: Nutzung von Gly-cerin und Rohglycerin als C-Quel-le für die Produktion von L-Phe-nylalanin mit rekombinantenEscherichia coli-StämmenBetreuer: Georg Sprenger
Universität Tübingen
Klaus Schad: Die Rolle der Aco-nitase AcnA in der Abwehr vonoxidativem Stress und in der mor-phologischen Differenzierung vonStreptomyces viridochromogenesTü494Betreuer: Wolfgang Wohlleben
Jutta Vogelmann: Biochemischeund biophysikalische Analyse desDNA-Translokator Proteins TraBdes Streptomyces venezuelaePlasmids pSVH1Betreuer: Wolfgang Wohlleben
Bettina Schreier: Design of Pro-tein Binding Pockets. Evaluationof computationally designed bin-ding pockets in the periplasmicbinding protein fold. Engineeringthe enolase magnesium II bindingsiteBetreuer: Wolfgang Wohlleben
Anne-Kathrin Gleske: Identifica-tion and characterization of novelStaphylococcus pathogen-asso-ciated molecular patterns(PAMPs) and their interaction withleukocyte receptorsBetreuer: Andreas Peschel
Dorothee Kretschmer: Phenol-soluble modulins and the activa-tion of human formyl-peptidereceptor 2 – small peptides of sta-phylococci with great propertiesBetreuer: Andreas Peschel
Diana Mader: The bacterial trans-lation initiation: role of formyla-ted peptides in Staphylococcusaureus physiology and host inter-actionBetreuer: Andreas Peschel
Universität Ulm
Simone Lederle: Heterofermen-tative AcetonproduktionBetreuer: Peter Dürre
Dominik Meisohle: Entwicklungrekombinanter Clostridium spo-rogenes-Sporen als neuer Thera-pieansatz für die Behandlungnekrotisierender TumoreBetreuer: Peter Dürre
Stefanie Schuster: Expressionvon identifizierten clostridiellenButanol-Synthese-Genen imZwischenwirt Escherichia coliBetreuer: Peter Dürre
Simon Klaffl: Oxalacetat-decar-boxylierende Reaktionen in Cory-nebakterium glutamicum Oxala-cetat-Decarboxylase und PEP-CarboxykinaseBetreuer: Bernhard Eikmanns
Universität Würzburg
Linda Böhme: Cellular responseto double-stranded RNA in Chla-mydia trachomatis-infectedhuman host cellsBetreuer: Thomas Rudel
Andreas Götz: Replication ofenteroinvasive Escherichia coliand Salmonella enterica serovarTyphimurium trains in epithelialcells with particular examinationof the carbon metabolismBetreuer: Werner Goebel
Martin Heisig: Development ofnovel Listeria monocytogenesstrains as therapeutic agents fortarged tumor therapy Betreuer: Werner Goebel
Nico Ondrusch: Der Thiol:Disul-fi-Redox-Metabolismus und derBlaulichtrezeptor Lmo0799 vonListeria monocytogenesBetreuer: Jürgen Kreft
Karin Schmitt: Charakterisierungdes BvgAS1,2-Regulons von Bor-detella petriiBetreuer: Roy Gross
Katharina Lütkenhaus: Tumourdevelopment in Raf-driven cancermouse modelsBetreuer: Ulf Rapp
Andreas Fischer: The Role of Pro-tein-Protein Interactions in theActivation Cycle of RAF KinasesBetreuer: Ulf Rapp
Johannes Putze: Studien zur Ver-breitung und genetischen Struk-tur des Colibactin-Genclusters inEnterobacteriaceaeBetreuer: Tobias Oelschlaeger
IMPRESSUM
Verantwortlich für den Inhalt:
Prof. Dr. Reinhard FischerKarlsruhe Institute of Tehcnology (KIT)Institute for Applied Biosciences –Department of MicrobiologyHertzstraße 16D-76187 KarlsruheTel.: +49 (9)721-60844630Fax: +49 (0)[email protected]
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Idan Ben-BarakKleine Wunderwerke
Idan Ben-Barak führt uns in die Lebens- und Wirkzusammenhänge von Genen, Proteinen, Bakterien und Viren ein und schildert die vielfältigen Wechselwir-kungen, mit denen sie das Leben auf der Erde gestalten. Auf der Reise lernen wir mikrobielle Superhelden kennen, erfahren etwas über die Ursprünge von Krank-heiten und der Resistenz gegen Antibio-tika. „Beste populärwissenschaftliche Lektüre. Ben-Baraks Zuneigung zu un-seren unsichtbaren Mitbewohnern ist ansteckend und verschafft dem Leser ein vergnügliches und facettenreiches Leseerlebnis.“ wissenschaft-online
Die unsichtbare Macht der Mikroben
Die Bakterien erzählen ihre eigene Geschichte!
1.Aufl. 2010, 256 S., kart.u (D) 12,95 / u (A) 13,31 / CHF 17,50ISBN 978-3-8274-2671-0
1. Aufl. 2008, 330 S., geb. m. SUu (D) 26,– / u (A) 26,73 / CHF 38,–ISBN 978-3-8274-1978-1
1. Aufl. 2010, 284 S., kart.u (D) 14,95 / u (A) 15,37 / CHF 20,50ISBN 978-3-8274-2465-5
Jetzt alsTaschenbuch
Elmer W. KonemanAm anderen Ende des Mikroskops
Dieses unterhaltsame Buch bietet einen ungewöhnlichen und faszinierenden Blick auf die Beziehung zwischen Menschen und Bakterien. „Möge Dr. Koneman für das, was er für Euch, die Bakterien ge-tan hat, glücklich und zufrieden leben, ohne sich je eine Infektion einzufangen. Für uns, seine Mitmenschen, hat er das wahrscheinlich witzigste und unterhalt-samste Buch verfasst, das je über die faszinierende Welt der Mikroorganis-men geschrieben wurde.“ Trends in Microbiology
Marlene ZukWas wäre das Leben ohne Parasiten?
Wir empfinden Krankheit als unseren Feind, Keime und Infektionen als etwas, das es zu bekämpfen gilt. Aber tun wir ihnen damit vielleicht Unrecht? Mit ihrem unterhaltsamen und fesselnden Buch bringt uns die Evolutionsbiologin Marlene Zuk dazu, unsere instinktiven Gefühle zu überdenken. Anhand neues-ter Forschungsergebnisse und Studien beschreibt sie die Bedeutung von Krank-heit und bringt unser Bild vom „bösen Parasiten“ gehörig ins Wanken. „Eine unterhaltsame Abendlektüre!“ Spektrum der Wissenschaft
Alle Preise zzgl. Versandkosten (D: u 3,50 / A: u 3,90 / CH: SFR 6,20, jeweils pro Lieferung). Sämtliche Preise inkl. Mehrwertsteuer. Preise unter Vorbehalt.Der u (A)-Preis ist uns vom dortigen Importeur als Mindestpreis genannt worden. Der sFr-Preis ist eine unverbindliche Preisempfehlung.
Erhältlich in jeder Buchhandlung oder direkt beim Verlag: unter www.spektrum-verlag.de per E-Mail: [email protected]
telefonisch: + 49 6221 345-0 per Fax: + 49 6221 345-4229
per Post: Springer Verlag Heidelberg
S a c h b u c h
Spektrum SachbücherBildungsfutter und Lesespaß in einem!
ND 2009, 352 S., kart.u (D) 14,95 / u (A) 15,37 / CHF 20,50ISBN 978-3-8274-2402-0
Bernard DixonDer Pilz, der John F. Kennedy zum Präsidenten machte
Wer Lust auf Wissenschaftssachbücher mit hohem Unterhaltungswert hat, der wird dieses Buch (...) genießen.“ „Dem renommierten britischen Wissenschafts-journalisten ist es durch hervorragende Recherche und mit vielen Details und Anekdoten gelungen, anschaulich die Geschichte der Menschheit mit den Geschichten der Mikroorganismen zu verknüpfen.“ „Man kann jedoch be-ruhigt sein: „Der Pilz....“ trifft vor allem den Geschmack des Lesers.“ Pharmazeutische Zeitung
Robert KochSeuchenjäger und Nobelpreisträger
Johannes W. Grüntzig / Heinz Mehlhorn
Robert KochJohannes W. Grüntzig und Heinz Mehlhorn, zwei erfolgreiche Sachbuchautoren, schlagen in dieser profunden Biografie den Bogen von den Pest-Epidemien des 14. Jh. bis hin zum Zeitalter der deutschen Kolonien, in dem Robert Koch die wis-senschaftliche Weltbühne betritt. Seine bahnbrechenden Forschungen und seine gefahrvollen Expeditionen nach Ägypten, Indien, Neuguinea und Afrika werden mit erstmals veröffentlichten Quellen, Auszügen aus Privatbriefen und zahlreichen farbigen Bildern dokumentiert. So entsteht ein lebendiges Zeitzeugnis zum Leben von Robert Koch, das auch die Reaktionen des bigotten gesellschaftlichen Milieus Berlins auf Kochs zweite Ehe mit einer deutlich jüngeren Frau nicht ausblendet. Erstmals wird hier auch die Biografie von Hedwig Koch-Freiberg geschrieben, einer starken, emanzipierten Frau an der Seite Robert Kochs, die ihn forderte und förderte. Eine überaus spannende Biografie eines der bedeutends-ten deutschen Wissenschaftler!
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1.Aufl. 2010, 1096 S., 500 Abb., geb. m. SUu (D) 99,95 / u (A) 102,75 / CHF 134,–ISBN 978-3-8274-2710-6
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![Molekulare Biotechnologie, BSc · Studiengang Molekulare Biotechnologie Universität Heidelberg, Fakultät für Biowissenschaften [1] MODULHANDBUCH Molekulare Biotechnologie, BSc](https://static.fdokument.com/doc/165x107/5e1dc9b208ba112f8f2362ad/molekulare-biotechnologie-studiengang-molekulare-biotechnologie-universitt-heidelberg.jpg)
