FiF Projektposter Serious Games for Bioinformatics A4 ·...
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Serious Games for Bioinformatics Interdisziplinäres Forschungsprojekt der Fachbereiche Informatik, Biologie und Humanwissenschaften Kontakt: Martin Heß, GCC - Graphics, Capture and Massively-Parallel Computing Email: [email protected] Website zum Spiel: www.bionigma.de Motivation Der Vergleich von Proteinsequenzen verschiedener Organismen mittels Multiple Sequence Alignments (MSA) ist in der Biologie von entscheidender Bedeutung. Ähnlichkeiten oder Unterschiede weisen beispielsweise auf ähnliche Funktion, Verwandtschaft oder evolutionäre Prozesse wie Koevolution hin. Hierbei werden ähnliche Teilbereiche so miteinander angeordnet, dass die Anzahl an Übereinstimmungen maximiert wird. Die Berechnung optimaler MSAs ist jedoch extrem rechenintensiv. Daher liefern computerbasierte Ansätze nur näherungsweise Lösungen, deren Qualität stark variiert. Die natürliche Mustererkennung des Menschen kann an dieser Stelle wesentlich zur Verbesserung der Qualität der MSAs beitragen. Aufgaben und Ziele Das Projekt Serious Games for Bioinformatics hat das Ziel, die natürliche Mustererkennung des Menschen auf spielerische Art und Weise zu nutzen, um die Qualität von MSAs zu verbessern. Hierzu wird in den drei Projektphasen das Serious Game Bionigma entwickelt, evaluiert und kontinuierlich verbessert. Bionigma abstrahiert dabei das MSA-Problem in Form eines Puzzlespiels. Durch das Verschieben und Ordnen ähnlicher Spielsteine erhalten die Spieler Punkte, wodurch die Qualität der MSAs spielerisch verbessert wird. Biologische Vorkenntnisse sind dank dieser Repräsentation nicht erforderlich. Bionigma ist unter www.bionigma.de frei verfügbar. Projektpartner • Prof. Dr. Michael Goesele, GCC - Graphics, Capture and Massively-Parallel Computing • Prof. Dr. Kay Hamacher, CBS - Computational Biology and Simulation • Prof. Dr. Josef Wiemeyer, IFS - Institut für Sportwissenschaft
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Serious Games for BioinformaticsInterdisziplinäres Forschungsprojekt der Fachbereiche Informatik, Biologie und Humanwissenschaften
Kontakt:Martin Heß, GCC - Graphics, Capture and Massively-Parallel Computing Email: [email protected] zum Spiel: www.bionigma.de
MotivationDer Vergleich von Proteinsequenzen verschiedener Organismen mittels MultipleSequence Alignments (MSA) ist in der Biologie von entscheidender Bedeutung.Ähnlichkeiten oder Unterschiede weisen beispielsweise auf ähnliche Funktion,Verwandtschaft oder evolutionäre Prozesse wie Koevolution hin.
Hierbei werden ähnliche Teilbereiche so miteinander angeordnet, dass die Anzahlan Übereinstimmungen maximiert wird. Die Berechnung optimaler MSAs istjedoch extrem rechenintensiv. Daher liefern computerbasierte Ansätze nurnäherungsweise Lösungen, deren Qualität stark variiert. Die natürlicheMustererkennung des Menschen kann an dieser Stelle wesentlich zurVerbesserung der Qualität der MSAs beitragen.
Aufgaben und ZieleDas Projekt Serious Games for Bioinformatics hat das Ziel, die natürliche Mustererkennung des Menschen auf spielerische Artund Weise zu nutzen, um die Qualität von MSAs zu verbessern. Hierzu wird in den drei Projektphasen das Serious GameBionigma entwickelt, evaluiert und kontinuierlich verbessert. Bionigma abstrahiert dabei das MSA-Problem in Form einesPuzzlespiels. Durch das Verschieben und Ordnen ähnlicher Spielsteine erhalten die Spieler Punkte, wodurch die Qualität derMSAs spielerisch verbessert wird. Biologische Vorkenntnisse sind dank dieser Repräsentation nicht erforderlich. Bionigma istunter www.bionigma.de frei verfügbar.
Projektpartner• Prof. Dr. Michael Goesele, GCC - Graphics, Capture and Massively-Parallel Computing • Prof. Dr. Kay Hamacher, CBS - Computational Biology and Simulation• Prof. Dr. Josef Wiemeyer, IFS - Institut für Sportwissenschaft
