Abb25.14
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Abb. 25.14 Kristallstruktur mit dem Bindungsmodus von Ro 31-4724 (25.35, IC 50 = 9 nM) an Collagenase. Die Hydroxamsäure bindet chelatartig an das Zinkion. Beide Amidgruppen bilden Wasserstoffbrücken zum Enzym aus. Die Leucin-Seitenkette des Inhibitors in der P 1 '-Position füllt die ins Proteininnere ausgerichtete S 1 '-Tasche aus. Die Alanin-Methylgruppe bindet in der S 3 '-Tasche, wogegen die Leucinseitenkette in Position P 2 ' ins Lösungsmittel ragt, da die S 2 ’-Tasche praktisch nicht ausgebildet ist.
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Abb. 25.14 Kristallstruktur mit dem Bindungsmodus von Ro 31-4724 (25.35, IC50 = 9 nM) an Collagenase. Die Hydroxamsäure bindet chelatartig an das
Zinkion. Beide Amidgruppen bilden Wasserstoffbrücken zum Enzym aus. Die Leucin-Seitenkette des Inhibitors in der P1'-Position füllt die ins
Proteininnere ausgerichtete S1'-Tasche aus. Die Alanin-Methylgruppe bindet in der S3'-Tasche, wogegen die Leucinseitenkette in Position P2' ins
Lösungsmittel ragt, da die S2’-Tasche praktisch nicht ausgebildet ist.
