Let LifeSciences meet you - scieguide.bts-ev.de · Vorwort Liebe Studierende der...

Institute und Forschungseinrichtungenin Jena

ScieGuide Jena2016/2017

Biochemie | Biologie | Biotechnologie | Molecular Medicine | Molecular Life Sciences

Let LifeSciences

meet you

Die TK ist meine Nr. 1: Denn sie achtet darauf, dass ihr auch spter noch fit durchs Leben kommt."

Fit und gesund mit der TK, zum Beispiel durch:

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Vorwort

Liebe Studierende der Naturwissenschaften,

Egal ob Forschung im Grundlagenbereich oder anwendungsorientiert, in Jena gibt es dafr viele Mglichkeiten an der Universitt, externen Forschungsinstituten und der Universittsklinik. Die groe Bandbreite an Forschungsmglichkeiten macht es den meisten Studierenden allerdings auch schwer, sich umfassend ber das vorhandene Angebot zu informieren. Daraus ergibt sich auch das Problem fr Studierende, die passende Arbeitsgruppe fr ihre Abschlussarbeiten aus dem breiten Angebot zu finden. Auch die Forschungsgruppen sind stets auf der Suche nach motivierten Studierenden.

Mit dieser Broschre mchte die btS Jena den Studierenden der Naturwissenschaften einen berblick ber die vielen Forschungseinrichtungen geben und die Suche nach Praktika, Abschlussarbeiten oder einfach Informationen erleichtern. Dabei erhebt der ScieGuide in seiner ersten Auflage keinerlei Anspruch auf Vollstndigkeit.

Wir mchten ebenfalls hier die Chance nutzen um uns nochmals bei den teilnehmenden Instituten und Arbeitsgruppen zu bedanken, dass sie uns so bereitwillig bei diesem Projekt untersttzt und die Informationen zur Verfgung gestellt haben.

Zum Schluss wnschen wir allen Leserinnen viel Spa beim Durchblttern des ScieGuides, und viel Erfolg bei der Suche nach der passenden Forschungsgruppe.

Die btS-Geschftsstelle Jena

3

4

Friedrich-Loeffler-Institut - Institut fr molekulare Pathogenese.. 1 2

AG Chlamydien und Mykoplasmen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 3

AG Genomik der Wirtsanpassung und Virulenz. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 4

AG Infektionsimmunologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 5

AG Infektionsimmunologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 6

Friedrich-Schiller Universitt Jena... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 8

Entomology Group. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 9

Angewandte und kologische Mikrobiologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20

Vertebrate Morphology Group. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21

AG Heinzel (Biochemie). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22

Professur fr Zellbiologie der FSU Jena. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23

AG Kosan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

AG Evolutionre Entwicklungsbiologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25

Molekulare Onkologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26

Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .28

AG Cellerino. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29

AG Englert. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30

AG Ermolaeva. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31

AG Groe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32

AG Haenold. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33

AG Hemmerich. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34

AG Kaether. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35

AG Maltzahn. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37

AG Morrison . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38

AG Platzer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39

AG Ploubidou. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

AG Rudolph. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41

INHALTSANGABE

INHALlSANGABE

AGWang .............................................................................................. 42

Hans Knll lnstltute ..... ................ ..... ................ ..... .............. 44

Applied Systems Biology ...................................................................... 45

Biobricks of Microbial Natural Product Synthesis ................................ .46

Biomolecular Chemistry ....................................................................... 47

Bio Pilot Plant. ...................................................................................... 48

Cell and Molecular Biology .................................................................. .49

Chemical Biology of Microbe-Host lnteractions ................................... 50

Chemistry of Microbial Communication ................................................ 51

Fungal Septomics ................................................................................ 52

lnfection Biology ................................................................................... 53

Jena Microbial Resource Collection (JMRC) ....................................... 54

Microbial lmmunology .......................................................................... 55

Microbial Pathogenicity Mechanisms ................................................... 56

Molecular and Applied Microbiology ..................................................... 57

Secondary Metabolism of Predatory Bacteria ...................................... 58

Systems Biology I Bioinformatics ......................................................... 59

Max-Planck-Institut fr Biogeochemie . ..... ..... ......... ..... ........ 60

Max-Planck-Institut fr Biogeochemie .................................................. 61

Max Planck Institute for chemical ecology .... ..... ..... ......... .... 62

Biosynthesis I NMR .............................................................................. 63

Department of Biochemistry ................................................................. 64

Department of Bioorganic Chemistry ................................................... 65

Department of Entomology ................................................................. 66

Department of Evolutionary Neuroethology ......................................... 67

Department of Molecular Ecology ........................................................ 68

Experimental Ecology and Evolution .................................................... 69

5

6

Mass Spectrometry/Proteomics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70

Olfactory Coding. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71

Sequestration and Detoxification in Insects. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72

Max-Planck-Institut fr Menschheitsgeschichte... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74

Archogenetik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75

Universittsklinikum Jena... . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76

Sepsisforschung. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77

Lehrstuhl fr Biophysik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78

Institut fr Virologie und Antivirale Therapie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79

Host Septomics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80

Institut fr Molekulare Zellbiologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81

Single-Molecule Microscopy Group. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82

Gynkologische Molekularbiologie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

Laboratory for in-vitro research and routine diagnostic. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84

Functional genetics. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85

Institute of Immunology. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86

Placenta-Labor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87

Group of Experimental Nephrology. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88

RG Petersen/Chen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89

Medical Physics Group Jena. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90

Paediatric Oncology. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91

Laboratory for Biomaterials. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92

Cell Biology of the Cytoskeleton. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93

Institute of Biochemistry I . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94

AG Signaltransduktion. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95

AG Huber. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96

AG Mosig. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97

INHALTSANGABE

INHALlSANGABE

Extracellular matrix (ECM) I Myocardial Remodelling .......................... 98

Prenatal Monitoring of Autonomie Maturation .. ... .... ... ... ... 99

AlertsNet. ........................................................................................... 101

Prof. Dr. rer. nat. / med. habil. Michael Hartmann .. ... ... ... ... 102

Experimental Transplantation Surgery .. .... ... ... ... ... ... 103

Prof. Dr. rer. nat. / med. habil. Michael Hartmann .. ... ... ... ... 104

AG Biolmaging ................................................................................... 105

Biomagnetic Center ............................................................................ 106

QUIPS/PAIN OUT Projekte ................................................................ 107

Spektroskopische Diagnostik ............................................................. 108

Center for lnfectious Diseases and lnfection Control .. .... ... .... 109

Fetal Programming of Diseases in Later Life .. ... ... ... ... ... 11 O

Research Group Hippocampal Plasticity ... ... ... .... ... ... .111

AG Wartenberg: Molekulare Kardiologie und Stammzellforschung.112

Nephrology and Rheumatology Research Group .... ... ... ... . 113

7

8

Was macht die btS?

Fr Studierende. Von Studierenden.

Unser Ziel ist es, Euch den Einstieg in das Berufsleben zu erleichtern undEuch einen Einbl ick in die reale Welt der Life Sciences zu geben. Daherorganisieren wir fr Euch aufschlussreiche Workshops, Exkursionen undVortragsreihen. Der Kreativitt der Mitgl ieder sind dabei keine Grenzengesetzt.

Jedes btS-Mitgl ied kann selbst entscheiden, in welchem Bereich und mit wieviel Verantwortung er/sie sich mit einbringen mchte. Durch die Mitwirkungin der lokalen Geschftsstel le werden vor al lem die Soft Skil ls wieKommunikationsfhigkeit, Organisationsgeschick und Teamfhigkeittrainiert. Neben der bundesweiten Vernetzung mit anderen Mitgl iedern undbereits im Beruf stehenden Alumnis, bietet Dir die Mitarbeit in der btS nochweitere Vortei le. Ihr erhaltet ein Abo der Zeitschrift | transkript und dieeinmalige Chance, durch unsere Partner direkt ber Jobangebote informiertzu werden.

Die btS in Jena

Engagier dich und werde selbst kreativ!

Unsere Geschftsstel le in Jena gibt es seit Ende 201 0. In lockererAtmosphre kannst Du direkt in Kontakt mit Studierenden undPromovenden aus anderen Semestern und den verschiedenstenStudienrichtungen der Naturwissenschaften treten. Auch potentiel leArbeitgeber kannst Du bei uns schon whrend des Studiums kennenlernen.

Als aktives btS-Mitgl ied hast Du die Mglichkeit gleich doppelt von unserenvielfltigen Veranstaltungen zu profitieren. Du lernst selbstbewusst aufUnternehmen zuzugehen, kannst viele Erfahrungen im Bereich desProjektmanagements sammeln und hast dabei auch noch Spa.

Du hast eine Idee fr ein Projekt oder wnschst Dir eine bestimmteVeranstaltung? Komm vorbei und bestimme mit was luft!

WIR BER UNS

WIR BER UNS

Scie Dabeil

Wir treffen uns regelmig alle zwei Wochen. Fr den genauen Termin kontaktiere uns einfach via E-mail ([email protected]) oder sprich uns einfach persnlich an. Wenn Du ber unsere Events auf dem laufenden gehalten werden willst, dann besuch doch einfach unsere Homepage (www.jena.bts-ev.de) oder unsere Facebook-Seite (facebook.com/btS.Jena).

9

Kategorien

!Biochemie

1 Neurologie

~ Onkologie

1 Pflanzenbiochemie

Pharmazie

lvirologie

11

FRIEDRICH-LOEFFLER-INSTITUT INSTITUT FR MOLEKULARE PATHOGENESE

lnstltutaleltung

Prof. Dr. Christian Menge

Anschrift

Naurnburger Str. 96a

07743Jena

Lage

Friedrich-Loeffltr- lnS1itut Bundesforschungsinstitut fr Tiergesundheit

02015 GeoBasls-OEIBKG (C2009).Google

Webseite

://www.fll.de/de/lnstltute linstitut-fuer-molekulare-

ogenese-imp/

FRIEORICH-LOEFflER-INSTITUT 1

1 E~.t .. . '"' , .. . f

12

Das Institut fr molekulare Pathogenese (IMP) reprsentiert zusammen mit dem Institut fr bakterielle Infektionen und Zoonosen, ebenfalls am Standort Jena, die Kompetenz des Friedrich-Loeffler-lnstituts in der Erforschung bakterieller Infektionserreger.

Das IMP hat die Aufgabe, die Interaktion zwischen bakteriellen Erregern von Tierseuchen und Zoonosen und ihren Wirten auf molekularer Ebene zu charakterisieren, die gewonnenen Erkenntnisse bezglich ihrer Relevanz im Gesamtorganismus zu evaluieren und daraus Verfahren zur Prophylaxe und Bekmpfung von Infektionen bei landwirtschaftlichen Nutztieren zu entwickeln.

Herausragende wissenschaftliche Expertise besitzt das Institut

- In der Aufklrung der Systematik der Chlamydien und der Entwicklung von Strategien zur Bekmpfung von Chlamydiosen bei Tier und Mensch, sowie

- der molekularen Epidemiologie und der Diagnostik von Mykobakterien-Infektionen bei landwirtschaftlichen Nutztieren (Rindertuberkulose und Paratuberkulose).

FRIEDRlett-LOEFFLEF IN[ TUi 1

1 :=:':::::~"::::~~:7~':.:;:::~:: Institut fr molekulare Pathogenese AG Chlamydien und Mykoplasmen

Dr. Christiane Schnee

Friedrich-Loeffler-lnstitut, Institut fr molekulare Pathogenese

AG 210, Naumburger Str. 96a

07743Jena

[email protected]

www.fli.de/de/institute/institut-fuer-molekulare-pathogenese-imp/arbeitsgruppen-forschungsbereiche/ag-chlamydien-und-mykoplasmen/

1 J '.33~1) ~ o JJ'J :ilil~~~Tl~~fJ~sm!;.tJHTl J'JJH3 t f!.1'3I? 3 ""@xr.sr uull~IJil!000iu1'1:9(,0-!..ln~ri-~a Die Arbeitsgruppe Chlamydien und Mykoplasmen am Institut fr molekulare Pathogenese, die auch das Nationale Referenzlabor fr Chlamydiose beherbergt, untersttzt die Untersuchungseinrichtungen der Lnder bei der Chlamydien- und Mykoplasmendiagnostik durch Abklrung unsicherer Befunde, Bearbeitung von Psittakose- und Lungenseuche-Verdachtsfllen, Optimierung labordiagnostischer Methoden, Abgabe von Referenzmaterial und Durchfhrung von Ringversuchen. Die Forschungsschwerpunkte liegen zum einen bei der Entwicklung neuer diagnostischer Verfahren wie z.B. DNA-Mikroarrays zur Speziesdifferenzierung oder Genotypisierung sowie Real-Time-PCR-Assays und serologischen Peptidarrays. Zum anderen werden Fragestellungen zu Pathogenittsmechanismen Chlamydien- und Mykoplasmen-assoziierter Erkrankungen des Rindes, des Schafes und der Vgel bearbeitet. Dabei werden in vitro und Tiermodelle {Kkenembryo, Kalb, Ziege) etabliert und mit molekulargenetischen und zellbiologischen Methoden untersucht.

' '.(@@llQJ,_;,'.f'~ l~@:Jil-Elfi.l Bernhard Kaltenboeck, College of Veterinary Medicine, Aubum University, USA

Nicole Borel, Institut fr Veterinrpathologie, Universitt Zrich, Schweiz

Simone Magnino, lstituto Zooprofilattico Sperimentale, Pavia, Italien

13

FRIEORICH-LOEffF IN[ TI 1

Institut fr molekulare Pathogenese 1 :::.:.::::.:,':'~~:::~~:~:.rz.:;~:~~ AG Genomik der Wirtsanpassung und Virulenz

Dr. Christian Berens


D Naumburger Str. 96a 07743Jena

[email protected]

www.fli.de/de/home/

r 3'3~u~ o JJr ;:r~~~[f~ btru~ii~~uif ~TtJ t'i'JJu03ri!J:Bu~(f' 4 ~@Xr8 r uull~[f~0~ ~-Er[,Q)[J!][f 'tilla Entwicklung genetischer Systeme zur Analyse der Auswirkung bakterieller Effektorproteine aus Chlamydia spp. und Coxiella bumetii auf die Infektiositt und Virulenz

Struktur-/Funktionsanalysen bakterieller Virulenzfaktoren zur Aufklrung ihrer molekularen Wirkmechanismen

Das Reservoir im Reservoir: Geno- und phnotypische Eigenschaften Shigatoxin-bildender Escherichia coli mit Persistenzvermgen in Rinderherden

Escherichia coli als biologischer lndikatororganismus zum Nachweis von Kontakten zwischen Haus- und Wildschweinen

' '.(@@lJQl~'.r'~ l~@:Jil-Elfi.l Prof. Dr. Andreas Klos, Medizinische Hochschule Hannover, Hannover

PD Dr. Anja Lhrmann, Universittsklinikum Erlangen, Erlangen

Prof. Dr. Lothar H. Wieler, RKI Berlin; lnga Eichhorn, Institut fr Mikrobiologie und Tierseuchen, Fachbereich Veterinrmedizin der Freien Universitt Berlin

Hans-Knll-lnstitut, Jena

14

FRIEDRlett-LOEFFLEF IN[ TUi 1

1 :=:':::::~"::::~~:7~':.:;:::~:: Institut fr molekulare Pathogenese AG lnfektionsimmunologie

Prof. Dr. Christian Menge


Naumburger Str. 96a

07743Jena

[email protected]

www.fli.de/de/institute/institut-fuer-molekulare-pathogenese-imp/arbeitsgruppen-forschungsbereiche/ag-infektionsimmunologie/ r '.33~u~ o JJr :iliJ~~~n0dJ~sm!;.t1Hn hJH3 t !!.1'3I? 2 [email protected] r uull~IJil!0001u 1 '1:9 t ]Dll n ~'(i~a Die Arbeitsgruppe beschftigt sich mit der Wirt-Pathogen-Interaktion bei Infektionen des Geflgels und der Wiederkuer mit Salmonellen, Chlamydien, Coxiellen, Mykobakterien und STEC/EHEC.

Methoden - funktionelle und phnotypische Charakterisierung etablierter Zellinien - funktionelle und phnotypische Charakterisierung von Primrzellkulturen

von Geflgel und Wiederkuern - Quantifizierung und funktionelle Analyse Antigen-spezifischer T-Zellen und

yi5T-Zellen von Hhnern, Rindern, Ziegen und Schafen mittels Durchflusszytometrie

- Quantitative real-time RT-PCR zum Nachweis der Zytokinantwort im Wirt - Proteomanalysen (2D-PAGE) - Immunhistologie - Konfokale Laser-scanning Mikroskopie (KLSM)

' '.(@@lJQJ,_;,'.f'~ l~@:Jil-Elfi.l Hans-Knll-lnstitut, Jena

Max-Planck-Institut fr Infektionsbiologie (MPllB), Berlin

Universittsmedizin Greifswald, Institut fr Immunologie und Transfusionsmedizin

15

Institut fr molekulare Pathogenese

AG Mykobakterien

FRIEORICH-LOEffF IN[ TI 1

l '"""'''"""'""'""'""'ra''""'w""h''' f'1!tra1~ilrch lnstotut'fo'A.mm;i1Hrallh

Dr. Heike Khler


Naumburger Str. 96a

07743Jena

heike. koehler@fli. bund .de

www.fli.de/de/institute/institut-fuer-molekulare-pathogenese-imp/arbeitsgruppen-forschungsbereiche/ag-mykobakterien/ r 3'3~u~ o JJr ;:r~~~[f~ btru~ii~~uif ~TtJ t'i'JJu03ri!J:Bu~(f' 3 ~@Xr8 r uull~[f~0~ ~-Er[,Q)[J!][f 'tilla

- Etablierung und Evaluierung bakteriologischer, molekularbiologischer, serologischer und T-Zell-basierter diagnostischer Methoden fr Mykobakterieninfektionen von Nutz- und Wildtieren

- Flchtige organische Substanzen (VOC} von Erreger und Wirt als Biomarker bakterieller Infektionen

- Testung innovativer Impfstoffe gegen Erreger des Mycobacterium tuberculosis - Komplexes (MTC} im Tiermodell

- Vergleichende Untersuchungen von Vertretern des Mycobacterium avium (M.a.}-Komplexes (MAC} auf Genom- und Transkriptomebene zur Identifikation von Virulenzfaktoren.

- Molekulare Genotypisierung von Mykobakterien des MTC und MAC zur Aufklrung von lnfektketten und phylogenetischen Zusammenhngen

' '.(@@lJQl~'.r'~ l~@:Jil-Elfi.l Max-Planck-Institut fr Infektionsbiologie (MPllB), Berlin

Universittsmedizin Greifswald, Institut fr Immunologie und Transfusionsmedizin

Universitt Rostock, Medizinische Fakultt, Klinik und Poliklinik fr Ansthesiologie und lntensivtherapie, Rostock

Thringer Tierseuchenkasse, Tiergesundheitsdienste, Jena

16

10,811 5

r m

162 .... o 66

f 19reic

1 8

Universittsprsident

Prof. Dr. Walter Rosenthal

Anschrift

Frstengraben 1

07743 Jena

Lage

Webseite

www.uni-jena.de

FRIEDRICH-SCHILLER UNIVERSITT

Binnen weniger Jahre seit der politischenWende in Ostdeutschland hat sich die kleinethringische Universittsstadt Jena wieder zueinem Wissenschaftszentrum voninternationalem Rang gemausert. Es herrschtAufbruchstimmung und ein "Denken ohneGrenzen". Doch bei al lem Neuanfang blicktman gern zurck auf die groartigenTraditionen: Goethe, Schil ler, Hegel und Fichteprgten das Geistesleben, Abbe, Zei undSchott legten den Grundstein fr wirtschaftl icheProsperitt.

Die fast 25.000 Universitts- undFachhochschul-Studierenden verleihen der1 00.000 Einwohner-Stadt, die sich traumhaft,von Muschelkalkfelsen umgeben, ins Flusstalder Saale schmiegt, ein immerwhrendjugendliches Flair.

Kurze Wege und ein eng geknpftesForschungsnetzwerk sind das Geheimnis frdie Renaissance der Saalestadt alsWissenschaftsmetropole. "Man kennt sich",viele der Direktoren und Abteilungsleiteraueruniversitrer Institute in Jena habenzugleich eine Professur an der Alma Materinne. Darber hinaus pflegt die Jenaer Unieinen Hochschulverbund mit Halle und Leipzigund gehrt zur "Coimbra Group".

Gemeinsame, vielfach interdiszipl inreProjekte, z. B. in den fnf DFG-Sonderforschungsbereichen und den ber 20Graduiertenkollegs und -schulen, sind dienatrl iche Folge. Das fruchtbareAufbruchsklima stiftet auch eine ganze Reiheungewhnlicher und perspektivenreicherAnstze in der Forschung, die hufiginterdiszipl inr und in Verbundnetzwerkenverfolgt werden, und in der sich inzwischenfnf Schwerpunktbereiche entwickelt haben.

Quelle: www.uni-jena.de

Friedrich-Schiller Universitt

Entomology Group

Prof. Dr. Rolf Georg Beutel

Institut fr Spezielle Zoologie und Entwicklungsbiologie

Erbertstrae 1

07743 Jena

reif. beutel@uni-jena.

http://www.uni-jena.de/szeb.html

:f"' ~L~N5JIJ ~ The Entomology Group investigates the morphology, high level phylogeny and evolution of the megadiverse Hexapoda (insects). One focus is on the development and optimization of innovative morphological techniques (e.g. -computed tomography, 3d reconstruction). Groups of special interest are Zoraptera, other groups of Polyneoptera, Strepsiptera, Coleoptera, and Diptera. Special topics are for instance the head morphology, embryology, the flight apparatus (especially wing reductions, BIG4 project}, attachment structures and effects of miniaturization. The phylogenetic studies are mainly based on morphological data but closely linked to molecular projects, especially 1 KITE. Fossils are also investigated with innovative techniques and in a phylogenetic framework.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@Ji 0 Sugadaira Montane Research Center, Sugadaira, University of Tsukuba, Japan

1 KITE (http://www.1kite.org/); Bonn, Shenzhen, Davis, Jena etc.

Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing

BIG4 (http://big4-project.eu/), Copenhagen

19


D Angewandte und kologische Mikrobiologie Prof. Dr. Gabriele Diekert

Institut fr Mikrobiologie

Philosophenweg 12

07743 Jena

[email protected]

http://www.mikrobiologie.uni-jena.de/cms/index.php/de/angewandte-und-kologische-mikrobiologie-laoem-5

/J0.J 778111~ ~~ 11~~ ~rru~ .hJ[!f! 1@rLrru QJ ll1~112J.& l~r 10

"" r hJ JIJ o ~@Jll ~1'1l'.r'i}D l!.ilf r, l!ZJ Die Arbeitsgruppe beschftigt sich hauptschlich mit dem Energiestoffwechsel strikt anaerober Bakterien. Dabei stehen folgende Themenbereiche im Mittelpunkt: Reduktive Dechlorierung als Atmungsprozess (Organohalid-Respiration: siehe DFG Forschergruppe FOR1530), anaerobe Etherspaltung (B12-abhngige Methyltransferasen), Rolle von Vitamin-B12-Derivaten bei diesen Prozessen, Biosynthese von Norpseudo-B12. Die Physiologie, Biochemie, Energetik, Enzymatik und Molekularbiologie der Organohalid-Respiration und der Etherspaltung wird untersucht. Die Methoden reichen von der Isolierung strikt anaerober Mikroorganismen, deren Charakterisierung bis hin zur Enzymreinigung und -Charakterisierung sowie molekulargenetische Methoden zur Untersuchung der Stoffwechselregulation.

1 0 Q):;,~~ [email protected] ~ J Prof. Dr. Holger Dobbek, Humboldt-Universitt Berlin, Deutschland

Prof. Dr. Jorge Escalante-Semerena, University of Georgia, Athens, USA

Prof. Dr. Fraser Armstrong, University of Oxford, England

Prof. Dr. Fred Hagen, TU-Delft, Holland

20


Vertebrate Morphology Group

Prof. Dr. Martin S. Fischer

Institut fr Spezielle Zoologie und Evolutionsbiologie

Erbertstrae 1

07743 Jena

[email protected]

http://www.uni-jena.de/szeb.html

:f"' ~L~J1r ll ~ The Vertebrate Morphology Group investigates the functional morphology, life history, phylogeny and evolution of vertebrates from "fish to mammal". We use a variety of different methods such as 30-reconstruction of larval series, high-speed real time movies, high-speed fluoroscopy, biomechanics, and sophisticated histological techniques. The different researchers have highly independent topics but all have the common goal of a better understanding of the major transformations in vertebrate evolution. Please take a lock at the webpage and publications of each researcher.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@Ji 0 Roger D. Quinn, Roy Ritzmann, Case Western Reserve University

Prof. Dr. Witte, Hartmut, TU Ilmenau, Fakultt fr Maschinenbau

Dr. Andreas Karguth, TETRA Gesellschaft fr Sensorik, Robotik und Automation

mbH, Gewerbepark "Am Wald" 4- 98693 Ilmenau

Dr. Pearson, Martin, Bristol Robotics Laboratory, Univers. of the West of England,

21


D AG Heinzel (Biochemie) Prof. Dr. Thorsten Heinzel

Zentrum fr Molekulare Biomedizin

Hans-Knll-Str. 2

07745 Jena

[email protected]/[email protected]/[email protected]

"" r hJ JIJ o ~Jll ~1'1l '.r'i}Dl!.ilf r, l!ZJ Ein Forschungsschwerpunkt liegt auf der Untersuchung molekularer Mechanismen der Genregulation, insbesondere der Transkriptionsrepression. Transkriptionsfaktoren interagieren oft mit DNA-und/oder Histon-modifizierenden Enzymen, die das Chromatin sowie nicht-Histon-Proteine durch posttranslationale Modifikationen verndern und somit die Genexpression steuern knnen. Diese epigenetischen Modifikationen sind reversible, knnen aber auch ggf. an Tochterzellen vererbt werden. Mittels epigenetischer Mechanismen kann die Zelle trotz des "statischen" Genoms dynamisch auf wechselnde Umweltbedingungen reagieren. Wir sind daran interessiert, wie dieses komplexe und streng koordinierte Zusammenspiel von genetischen und epigenetischen Mechanismen die zellulre Identitt bei normalen Entwicklungsprozessen (warum differenziert eine multipotente Stammzelle?) beeinflusst und welche Rolle eine fehlerhafte Steuerung dieser Programme bei die Entstehung von Krankheiten (z.B. Krebs) spielt.

:f o QJ:;,~~ ~J@Ji ~ I Prof. Dr. Oliver Krmer, Institut fr Toxikologie, Universittsmedizin Mainz,

Prof. Dr. Axel Brakhage, Leibniz-Institut fr Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie (HKI), Jena

Prof. Dr. Zhao-Qi Wang, Leibniz-Institut fr Altersforschung (FLI), Jena

Prof. Dr. Rdiger Behr, Leibniz-Institut fr Primatenforschung (DPZ), Gttingen

22


Prof. Dr. 8erit Jungnickel

8ioinstrumentezentrum

Winzerlaer Strasse 2 Modul 3/Ebene 4

07745 Jena

[email protected]

http://www.cellbiology.uni-jena.de/cms/

f "" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r' Jij!..JIJ) i 0~:., Schwerpunkte: Immunbiologie, Tumorbiologie, Stammzellbiologie, Neurobiologie. Wir analysieren den Mechanismus der Vernderung von Antikrpergenen in 8-Zellen ber Somatische Hypermutation, und dabei besonders Mechanismen der DNA-Schdigung und DNA-Reparatur sowie den Einfluss von Checkpoint -Signalwegen. Ziel ist, zu verstehen wie eine Zelle genau die Gene sehr stark mutieren kann, die sie gerade am dringendsten braucht, ohne dabei durch Mutation anderer Gene Krebs zu verursachen. Seit einiger Zeit analysieren wir auch den Einfluss eines Reparaturwegs auf die Erhaltung von Stammzellen und das Altern, vor allem im Nervensystem, aber auch in anderen Geweben. Auch wollen wir verstehen wie und ob dieser Weg die Tumorbildung vermeidet. c In unserem jngsten Projekt analysieren wir den Einfluss von 8-Zellen und Antikrpern auf die Interaktion des Menschen mit Candida albicans, einem harmlosen Kommensalen, der bei Immunsuppression des Wirts zu einem tdlichen Pathogen werden kann.

:f o QJ:;,~~Hl@Ji ~ I Christian Kosan, Institut fr Biochemie und Biophysik, Jena

llse Jacobsen, Hans Knll Institut, Jena

Hortense Slevogt, Septimics, Universittsklinikum Jena

Ronny Hnold, Fritz Lipmann Institut Jena

23


D AG Kosan Dr. Christian Kosan

Center for Molecular Biomedicine

Hans-Knll-Str. 2

07745 Jena

[email protected]

http://www.biochemie.uni-jena.de/

/J0.J 778111] ~~ 11~


AG Evolutionre Entwicklungsbiologie

Prof. Dr. Lennart Olsson

Institut fr Spezielle Zoologie und Entwicklungsbiologie

Erbertstrae 1

07743 Jena

[email protected]

/J0.J 778.n1~ ~~ "7l'00~.rE>~hJ~JHJl d1@Ill ~JJfirm~l~r 4 f "" r' hJ .nJ a.0-~ !..:JJ1'f~il!.mr,0~:... Die Arbeitsgruppe evolutionre Entwicklungsbiologie beschftigt sich vorwiegend mit der Entwicklung und Evolution des muskuloskeletalen Systems der Wirbeltiere. Dabei sind Hauptschwerpunkte die Entstehung von evolutionren Neuheiten und die Evolution von abgeleiteten Reproduktionsformen. Hauptobjekte unserer Forschung sind Amphibien und Knochenfische.

f o 0 :;,[email protected] ~ J Peter Konstantinidis, Virginia Institute of Marine Science

Simon Leader, University of Roehampton

Timo Moritz, Deutsches Museum fr Meereskunde, Stralsund

25


D Molekulare Onkologie PD Dr. Birgit Spnkuch

Center for Molecular Biomedicine

Hans-Knll-Strae 2

07745 Jena

[email protected]

http://www.biochemie.uni-jena.de

/J0.J 778.n1~ ~~ "71~~ ~rru~ .hJ[!f! 1rLrru QJ ll1Il11m.&fr 2 f "" r hJ .nJ o ~Jll ~1'1l'.r'i}D l!.llf r, l'2;i Unsere Arbeitsgruppe beschftigt sich mit der Hemmung von Zellzykluskinasen im Rahmen der Entwicklung neuer Anstze in der individualisierten Krebstherapie. Dabei ist unser Haupt-Target die Polo-like Kinase 1 {Plk1 ), die fr die Mitose aller Zellen essentiell ist. Inhibitoren von Plk1 {niedermolekulare Inhibitoren, siRNAs) werden mit Inhibitoren anderer Kinasen oder Zellzyklus-relevanter Enzyme in Zellkultur kombiniert, wobei aktuell insbesondere Chk1 und Topoisomerase llalpha bearbeitet werden. Unser Hauptaugenmerk liegt in allen Studien bei der Untersuchung potentieller Unterschiede zwischen Krebs- und Nicht-Krebszellen, um mechanistische Unterschiede aufzuklren und mgliche therapeutische Fenster zu identifizieren. Diese Unterschiede liegen z.B. in der unterschiedlichen Funktionalitt von Zellzykluskontrollpunkten, wobei hier Unterschiede hufig auf den unterschiedlichen p53-Status zurckzufhren sind oder aber eine unterschiedliche p21-Lokalisation beobachtet werden kann.

PD Dr. Peter Hemmerich (Jena) Prof. Dr. Gisbert Schneider (Zrich, Schweiz)

26

LEIBNIZ INSTITUlE ON GING - FRITZ LIPMANN INSTITUlE

Directors

Prof. Dr. K. Lenhard Rudolph

Dr. Daniele Barthel

Address

Beutenbergstrae 11

07745Jena

Location

l f

2015 GeoBasis-DE/BKG (2009).Google

Website

http://www.leibniz-fli.de/

. . . . . ::f 1 1 Leibniz Institute on Aging-

Fritz Lipmann Institute

28

The Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI} is the first national research institute in Germany focusing on biomedical research on human aging, a multifactorial process controlled by environmental and genetic factors.

The research focus on these two program areas is unique at national and international level. The main aim of the research at FLI is to delineate mechanisms that are relevant for human aging and the development of aging induced dysfunction and diseases. To this end, functional genomic platforms and a pipeline of model organisms spanning from invertebrates over genetic mause and fish models towards humanized models were developed. Translational knowledge transfer in cooperation with international, national and local cooperation partners aims at the development of new therapies to preserve tissue maintenance and to reduce the risk of aging-induced diseases thus facilitating healthy and better aging.

. ::t1 . . . . 1 Leibniz Institute on Aging-Fritz Lipmann Insti tute Fritz Lipmann Institute

AG Cellerino (Biology of Aging)

Dr. Alessandro Cellerino

Leibniz Institute on Aging -Fritz Lipmann Institute

Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/associated-research-groups/cellerino/

~ ~ Q!l[fi)@) :;,r o (( 3 :f"' ~L'.Z1N5 JIJ ~ The main topic of my resarch is investigating the biological aspects of aging using the short-lived fish Nothobranchius furzeri that was developed at the FLI over the last ten years. My specific fields of interest are: - Aging of brain and neuronal stem cells - Role of microRNAs in aging - Molecular evolutionary studies in the context of aging - Pharmacological interventions into aging

We a strong background in Neurobiology and use a variety of techniques ranging from neuroanatomy to transgenesis and analysis of "omics" data. c The group is based on a research agreement with Scuola Normale Superiore, Pisa, ltaly.

c o o 0:;..~ml@J1 0 Alessandro Cellerino, Scuola Normale Superiore, Pisa, ltaly

Martin Reichard, Institute of Vertebrate Biology, Brno, Checz Republic

Dario Valenzano, Max Planck for Biology of Aging, Cologne, Germany

Antonino Cattaneo, European Brain Research Institute, Rome, ltaly

29

D

D

Fritz Lipmann Institute

AG Englert (Molecular Genetics)

Prof. Dr. Christoph Englert


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/englert/

~~[\ ~hJ [J~~&liD Jj~

:f"' ~L8J1'' ll ~ 1b8~

. ::t1 . . . . 1 Leibniz Institute on Aging-Fritz Lipmann Institute

- signaling pathways regulating aging and lifespan in a short-lived vertebrate - molecular basis and age-dependency of regenerative processes - molecular basis of kidney development and homeostasis

- animal models: mause, zebratish, Nothobranchius furzeri {short lived killifish}

c 0 0 Q):;,~~ ~l@Ji 0 Carmen Birchmeier, topic: Wt1 in the CNS; MDC Berlin, Germany

Klas Kullander, topic: Wt1 in the CNS; Uppsala University, Sweden

Britta Qualmann/Michael Kessels, topic: characterization of cytoskeletal components in zebrafish, FSU Jena, Germany

Diethelm Wallwiener, topic: Wt1 in female fertility; University Warnen Hospital Tbingen, Germany

30

. ::::.:flI Fr"1tz L"1pmann lnst"1tute Leibniz Institute on Aging-

Fritz Lipmann Insti tute

AG Ermolaeva (Stress tolerance and ~ homeostasis in aging and disease) L_

Dr. Maria A. Ermolaeva


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

PAVING WAYS TO HEALTHY AGING

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/ermolaeva/

~ ~ Q!l[(i]i)@) ;.r o J 5 :f"' ~L~N5JIJ ~ Our group is interested in finding ways of improving tissue homeostasis during age-related diseases and during normal aging. We combine data obtained in three different model systems (nematode C. elegans, human and mause cells and murine disease models) in order to fulfill this task. Our main areas of interest are (i) stem cell maintenance and (ii) tolerance of tissues to physiological stresses. In the past we already identified treatments which enhance systemic proteostasis and protect nematodes from protein folding stress [Ermolaeva et al, Nature, 2013]. We currently continue by implementing these nematode findings in mause models of colitis and diabetes. In addition our current projects are: (a) studying mechanisms of stem cell quiescence; (b) studying effects of diets and other environmental factors on longevity and organ function; (c) high throughput screens for chemical and natural compounds which promote stress tolerance; (d) molecular basis of trans-generational stress effects.

c 0 0 Q);.~~ ~l@Ji 0 Cologne Cluster of Excellence in Cellular Stress Responses in Aging-associated

Diseases, Cologne, Germany

Research Training Group 1715 on adaptive responses to stress, Jena, Germany

Leibniz-Institut fr Naturstoff-Forschung und lnfektionsbiologie/Hans-Knll-lnstitut (HKI), Jena, Germany

INNOVENT - Technologieentwicklung Jena, Germany

31

Fritz Lipmann Institute .::::: f li c::==========================================-D AGGroe Prof. Dr. Frank Groe


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/grosse/

/J0.J 778.n1~ ~~ "71~~ ~rru~ .hJ[!f! 1rLrru QJ ll1Il11m.& l~r 7 f "" r hJ .nJ o ~Jll ~1'1l'.r'i}D l!.llf r, l'2;i

Leibniz Institute on Aging-Fritz Lipmann Institute

Die Verdopplung der genetischen Information ist ein zentraler Bestandteil aller Lebewesen. Auftretende Fehler whrend der DNA-Replikation knnen Krebs verursachen oder zur vorzeitigen Alterung fhren. Unsere Forschungsgruppe interessiert sich fr die grundlegenden Aspekte der DNA-Replikation, deren Regulation und ihren Umgang mit Fehlern, die dabei auftreten knnen. Wir sehen unsere Forschung als Beitrag zum besseren Verstndnis, wie Zellen Replikationsfehlern vorbeugen und dabei vorzeitiger Alterung und letztlich auch dem Zelltod entgehen. Wir behandeln vor allem folgende Fragestellungen:

- Wie wird die Replikation initiiert und wie wird sie gestoppt, wenn etwas schief luft?

- Was geschieht mit Replikationsgabeln, die vor einer geschdigten Stelle blockiert werden?

- Wie werden blockierte Replikationsgabeln wieder aktiviert und gestartet? - Welcher Art sind die Signale, die den Zelltod veranlassen, wenn

geschdigte Stellen sich als irreparabel erweisen?

f o 0:;,[email protected] ~ r Laboratory of Radiobiology and Experimental Radiation Oncology, University

Medical Center Hamburg-Eppendorf, D-20246 Hamburg, Germany.

Faculty of Biochemistry and Molecular Medicine, University of Oulu, Finland.

Institute of Biomedicine, University of Eastern Finland, Kuopio, Finland.

Department of Biochemistry, McGill University, Montreal, Canada.

32



AG Haenold (Neuroimmunology)

Dr. Ronny Hnold


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/associated-research-groups/weihhaenold/

~ ~ Q!l[fi)@) :;,r o (( 5 :f"' ~L'.Z1N5 JIJ ~ Projects: 1. Transcriptional control of neuroplasticity and neurosenescence by NF-KB 2. Microglia-specific activation of NF-KB pathways during neuroinflammation 3. In vivo MRI on small animal scanners for studies of neurodegeneration

and regeneration Tools and Methods: 1. Histological, cellular and molecular studies: lmmunohistochemistry,

fluorescence microscopy, cell imaging; primary neuronal and glial cell cultures; FACS; proteomics and transcriptomics

2. Neurogenesis and neuritogenesis analysis: Axonal de- and regeneration c assays; hippocampal culture

3. Mouse models: Characterization of conditional NF-KB knockout and reporter mice; mause models for acute and chronic neurodegeneration and neuroinflammation; behavioral assays; aging cohorts

4. ln-vivo MR imaging {MRI} of mice: Contrast-enhanced MRI; anatomical T1- and T2 weighted MRI; longitudinal MRI {young postnatal to aged mice}

c o o 0:;..~ml@J1 0 Institute of Biochemistry and Biophysics, FSU Jena, Germany

Institute of General Zoology and Animal Physiology, FSU Jena, Germany

Institute of Diagnostic and lnterventional Radiology, University Hospital Jena, Germany

Hans-Berger Department of Neurology, University Hospital Jena, Germany

33

D

Fritz Lipmann Institute .::::: f li AG Hemmerich (Core Facility lmaging)

PD Dr. Peter Hemmerich


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/core-facilities/

/J0.J 778.n1~ ~~ "71~~ ~rru~ .hJ[!f! 1rLrru QJ ll1Il11m.& l~r 2 f "" r hJ .nJ o ~Jll ~1'1l'.r'i}D l!.llf r, l'2;i -Advanced Live Cell lmaging (ALCI)


Etablierung und Anwednung von Fluoreszenz-Fluktuations-mikroskopischen Methoden zur Erforschung der Arbeitsweise von Protein-Komplexen in lebenden Zellen (FRAP, FCS, FRET, RICS, etc.).

- STED Hchstauflsungs-Mikroskopie Etablierung und Anwendung der Stimulated Emission Depletion (STED)-Mikroskopie zur Ultrastuktur-Analyse bis zu einer Auflsung von 30 nm.

- Funktion von Kernkrpern Analyse der Assemblierung von subnukleren Strukturen in Zellkernen lebender menschlicher Zellen mittels ALCI und STED.

- Telomer-Biologie Analyse der Assemblierungs-Mechanismen von Telomeren in lebenden Zellen mittels ALCI und STED.

f o 0:;,[email protected] ~ r Institut fr umweltmedizinische Forschung, Dsseldorf, Deutschland

Heinrich-Pette-lnstitut, Hamburg, Deutschland

Friedrich-Schiller-Universitt, Jena (versch. AGs), Deutschland

Adcvanced lmaging Microscopy, Carl Zeiss, Jena, Deutschland

34



AG Kaether (Membrantransport) C Dr. Christoph Kaether


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/kaether

/J0.J 778111] ~~ 10

"" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r' Jij!..JIJ) i 0~:., Wir untersuchen den Transport sowie die Lokalisation von Proteinen im Innern von Zellen, hauptschlich von Membranproteinen, die an Alterungsvorgngen beteiligt sind. Dazu nutzen wir eine Vielfalt von Methoden, darunter Video-, Konfokal-, Apotome-Mikroskopie sowie biochemische Methoden (biet, IP, Deglykosylierung, etc.), die Arbeit mit Mausmodellen sowie Hochdurchsatz-Screenings mit automatischer Mikroskopie. Projekte:

-Die Funktion des anti-aging Hormons Klotho -Regulation der Notchsignaltransduktion -Proteinexport an ER-exit sites -Die Funktion des Sortierrezeptors Rer1

1 0 Q) :;,~~ ~l@ .fi ~ J Koret Hirschberg, Universitt Tel Aviv, Israel

Christian Hbner, Humangenetik Universitt Jena, Deutschland

Hans-Dieter Arndt, Organische Chemie Universitt Jena, Deutschland

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Die TK ist meine Nr. 1: Denn sie kmmert sich ganz persnlich um uns Studenten. Gleich hier an der Uni ."

Die TK fr Studierende:

> Betreuung vor Ort Wir sind persnlich fr Sie da

> Bei Anruf Hilfe TK-Mitarbeiter und rzte sind 24 Stunden erre ichbar

> Reiseimpfungen Kostenbernahme bei empfohlenen Impfungen

Nur drei von mehr als 10.000 Leistungen. Ich berate Sie gern ausfhrlich.



AG Maltzahn (Stern cells in regeneration of skeletal muscle)

Dr. Julia von Maltzahn


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

julia. [email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/von-maltzahn/

~ ~ Q!l[fi)@) :;,r o (( 8 :f"' ~L'.Z1N5 JIJ ~ Skeletal muscle serves a multitude of functions in the organism including voluntary locomotion and exhibits a remarkable ability to adapt to physiological demands. Satellite cells are the stem cells of skeletal muscle and are associated with its growth, maintenance and regeneration. Aged skeletal muscle shows a significantly impaired regenerative potential. Our lab investigates the intrinsic differences between adult and aged satellite cells, especially the satellite stem cell subpopulation. This work will provide insights into pathways that are perturbed in aged satellite cells and allow for modification of these pathways thereby rejuvenating aged muscle. To assess the functionality of satellite cells in the aged organism we injure skeletal muscles from adult and aged mice and harvest the muscles at different time points after injury and investigate the muscles regarding regeneration.

c o o 0:;..~ml@J1 0 Florian Bentzinger, Nestle, Lausanne, Switzerland

Said Hashemolhosseini, Erlangen, Germany

K.Lenhard Rudolph, FLI, Jena, Germany

Christoph Kaether, FLI, Jena, Germany

37

D

Fritz Lipmann Institute .::::: f li c::========================================-AG Morrison

Dr. Helen Morrison


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research_groups/morrison

~ ~ Q!][fi)@) :;,f o(( 8~~[1 ~hJ [J~~&J~ ~~

9 :f"' ~L'.ZlM Jlj ~ \.Si'.Zl~


My lab is interested in the nature of cell communication, and the miswiring of signaling pathways in disease and in the aging process. We focus on age dependent signaling impairments underlying nervous system maintenance and regeneration, and in disease mechanisms for disorders of myelinating cells and nervous system tumors. These disease areas represent a great medical need and our work aims to perform translational work in each area. We use a multidisciplinary approach that includes structural, cellular and mause models. PROJECTS: PERIPHERAL NERVE REGENERATION AND AGING - plasticity of the Schwann cell differentiation - Schwann cell and axonal interactions - role of the microenvironment, during cell repair and cancer development BRAIN PLASTICITY AND THE REGENERATING BRAIN - Ras and Ras-like protein activity control in synaptic and structural neuroplasticity - the cellular basis for memory formation. The regulation of synapse efficacy is important for the healthy aging brain.

Co o QJ:;,~:.HlJi 0 http://www.ctf.org/Research/Synodos.html

38


AG Platzer (Genome Analysis)

PD Dr. Matthias Platzer


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/platzer/

~ ~ Q!l[fi)@) :;,r o (( 8 :f"' ~L'.Z1N5 JIJ ~ Using next-generation sequencing (NGS) technologies, the group is working on the functional and comparative analysis of genomes and transcriptomes of short- and long-lived model organisms for aging research. - We aim to identify genetic determinants of lifespan and aging-relevant traits

in the short-lived turquoise killifish (Nothobranchius furzeri). As a prerequisite, we provide key resources such as a reference sequence of the N. furzeri genome and a comprehensive catalog of transcripts and genes.

- We search for molecular networks underlying the exceptionally long-lasting health (healthspan) and longevity of mole-rats.

- In close collaboration with clinical partners, we perform functional genomic analyses aimed at the (epi)genetic dissection of multifactorial and aging-related human diseases like sepsis as well as the influence of prenatal stress on brain aging.

- New bioinformatics tools are being developed to facilitate sequence analysis and annotation.

c o o 0:;..~ml@J1 0 Prof. Christoph Englert, Dr. Alessandro Cellerino, FLI, Germany

Prof. Michael Bauer, Prof. Andre Scherag, CSCC, Jena University Hospital, Germany

Prof. Matthias Schwab, Neurology, Jena University Hospital, Germany

Prof. Thomas Hildebrand, Leibniz Institute for Zoo and Wildlife

Research, Berlin, Germany

39

D

D

Fritz Lipmann Institute .::::: f li c::==========================================-AG Ploubidou

Dr. Aspasia Plaubidau

Leibniz Institute an Aging -Fritz Lipmann Institute

Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/assaciated-research-graups/plaubidau/

~~[\ ~hJ [J~~&liD Jj~

i"' , ~L8MJIJ ~ \b8~


Our research tapic is cancer, a majar age-related pathalagy. lt is well established, in different systems, that cytaskeletan deregulatian is assaciated with ancagenic cell grawth. The cytaskeletan fulfills its diverse functians by converting intra- and extra-cellular signals inta structures and structure remadeling.

Our primary aim is ta understand haw cytaskeletal signaling, in particular centrasame activity, cantributes ta cell renewal ar cammitment ta differentiatian and haw is this signaling subverted in cancer.

We use cultured cells and arganatypic systems, which are analyzed via genamic and RNAi-based functianal genamic technalagies ta define malecular mechanisms af cytaskeletal regulatian. In additian, we emplay mause madels that recapitulate distinct malecular aspects af cancer develapment and argan/tissue hameastasis.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@Ji 0 Bode MH Lange, Berlin, Germany Marie-Helene Verlhac, Paris, France Michael Way, London, UK Kurt Zatloukal, Graz, Austria

40


AG Rudolph

Prof. Dr. Karl-Lenhard Rudolph


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

------:::==

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/rudolph/

f "" r' hJ JIJ 0.0-?.J !.;Jjj'f:::J.r' Jij!..JIJ) i 0~:., Die Forschungsgruppe beschftigt sich mit den Ursachen, Prozessen und Folgen der Stammzellalterung. Die Stammzellen des erwachsenen (adulten) Organismus sind fr den lebenslangen Erhalt und die Regeneration der Gewebe und Organe des Krpers unerlsslich. Experimentelle und klinische Daten deuten darauf hin, dass die funktionelle Reserve adulter Stammzellen und damit ihre Regenerationskraft whrend des Alterns abnehmen. Die molekularen Mechanismen, die dem Funktionsverlust der Stammzellen zugrunde liegen, sind derzeit noch weitgehend unbekannt.

Mithilfe genetischer Analysen werden immer mehr Gene und genetische Loci identifiziert, die die Lebensdauer sowie die Geschwindigkeit des Alterns verschiedener Organismen bis hin zum Menschen beeinflussen. Die exakte Funktion, die diese Gene beim Altern von Sugetieren haben, und die mit ihnen verbundenen molekularen Mechanismen sind jedoch bislang ebenfalls nicht ausreichend verstanden. Immer mehr experimentelle Daten lassen vermuten, dass zumindest einige der mit Altern verbundenen Gene auch die funktionelle Reserve adulter Stammzellen beeinflussen.

41

D

Fritz Lipmann Institute .::::: f li c::==========================================-AG Wang

Prof. Dr. Zhao-Qi Wang


Beutenbergstrae 11

07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-fli.de/research/research-groups/wang/

~ ~ Q!][fi)@) :;, f o(( 8~~[1 ~hJ [J~~&J~ ~~ 16 :f"' ~L'.ZlM Jlj ~ \.Si'.Zl~


Our lab uses cellular and molecular tools as well as animal models to dissect how the dysfunction of DNA damage signaling and repair pathways causes pathological changes and aging in humans. Our current specific interests are: 1. The cellular reponse on DNA damage mediated by the key molecules ATR

and Nbs1 and their role on the development of age-related diseases, including neuro(de)generation.

2. The biological processes regulated by Poly(ADP-Ribose) homeostasis and Poly(ADP-Ribosyl)ation, the fastest reaction upon DNA damage.

3. The effects of chromatin remodeling, mediated by the histone acetylation cofactor Trrap, on brain development and neurodegeneration.

c o o 0:;..~mlJ10 Prof. Dr. Yosef Shiloh, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel

Prof. Dr. Wieland B. Huttner, Max-Planck-Institute of Molecular Gell Biology and Genetics, Dresden, Germany

Dr. Axel Behrens, The Francis Crick Institute, London, UK

Prof. Dr. Michael Hottiger, University of Zurich, Zurich, Switzerland

42

44

Institutsleitung

Prof. Dr. Axel A. Brakhage

Anschrift

Beutenbergstrasse 11 a

07745 Jena

Lage

Webseite

http: //www. leibniz-hki.de

LEIBNIZ INSTITUTE FOR NATURAL PRODUCT RESEARCH ANDINFECTION BIOLOGY - HANS KNLL INSTITUTE

Microbial natural products serving as mediatorsof biological communication are essential forour l ives. They do, however, play anambivalent role: on the one hand, theycontribute to the generation of many infectiousdiseases; on the other hand, they belong to themost important sources provided in drugs suchas antibiotics.

We investigate the communication betweenmicro-organisms to be able to make use of theacquired know-how to develop innovativecomponents for the diagnosis and therapy ofdiseases. By means of implementing thoseresearch results and the derived modelsthereof, we make a contribution to thedevelopment of the systems biology of aninfection.

201 5 GeoBasis-DE/BKG(2009).Google

llbk@~ 13 " ) :;, ~ ' /f] fll [l &!~~

Hans Knll Institute

The research group Applied Systems Biology is concerned with the mathematical modelling and computer simulation of infection processes caused by human-pathogenic fungi. The spatio-temporal data basis for these models is acquired by automatizing the data analysis of microscopy images on infection processes for high-throughput scanning. Our aim is to unravel secrets of the dynamical, functional and morphological aspects of the host-pathogen interaction using approaches of image-based systems biology.

45

Hans Knll Institute

Biobricks of Microbial Natural Product ~ynthesis

Dr. Vita Valiante

Hans Knll Institute


07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-hki.de/en/biobricks-of-microbial-natural-product-syntheses.html

j ~ QI.llfi1U .0~r o J 1'$.iliil "" fil iil$.il.fu@&jif11k$.il 3 ") :;, ~ ' /f] fll [l @:)[1$.il

ll

Hans Knll Institute

Bio Pilot Plant

Dr. Uwe Horn

Hans Knll Institute


07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-hki.de/en/biotechnikum.html

j ~ QI.llfi1U .0~r o J 1'$.iliil "" fil iil$.il.fu@&jif11k$.il 28 ") :;, ~ ' /f] fll [l @:)[1$.il

ll

llbk@~ 20 " ) :;, ~ ' /f] fll [l &!~~ Research in the Department of Gell and Molecular Biology is devoted to the flow of molecular information during hast-pathogen interactions. As model hosts, we use human cell lines, mice and chicken embryos in ovo. Our main interest lies in the the pathogens of Chlamydiales and pathogenic fungi. Within this framework, we aim at the elucidation of how infections proceed in living organisms (imaging) and how infected organs react on a molecular level (e.g. comparative genomics, transcriptomics and interactomics). lmaging is performed by means of our latest generation positron emission tomography-computed tomography (PET-CT) instrument that provides co-registered images, i.e. it combines the high spatial resolution and anatomical detail of the CT with the molecular, quantifiable images obtained by the PET. Furthermore, we are focussing on comparative genomics, transcriptomics, interactomics and novel technologies like multicolor hyperspectral imaging of biomolecules.

Hyperspectral imaging, GMBU, Jena, Germany

Microbiome-host interactions, Research Ministry of Marine Affairs and Fisheries, Jakarta, lndonesia

MS-lmaging, Max Planck Institute for Chemical Ecology, Jena, Germany

49

Hans Knll Institute

Dr. Christine Beemelmanns

Hans Knll Institute


07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-hki.de/en/chemical-biology-of-microbe-host-interactions.html

j ~ QI.llfi1U .0~r o J 1'$.iliil "" fil iil$.il.fu@&jif11k$.il 4 " ) :;, ~ ' /f] fll [l @:)[1$.il

ll

Hans Knll Institute

Fungal Septomics

Prof. Dr. Oliver Kurzai

Hans Knll Institute


Jena 07745

[email protected]

www.septomics.de

~~QI.l[fi1[).0~[f' @1 J'$ij@[l -;-:. fil [l$ij.fu@&j[Jft@$ij 12 ") :;, ~ @@ fll [l @:l[l

ll

llbt@~ 25 " ) :;, ~ ' /f] fll [l &!~~ The Department of lnfection Biology studies how the human pathogenic yeast Candida albicans evades hast complement attack and consequently causes infections.

Complement and innate immunity Immune evasion of Candida albicans Complement evasion of human pathogenic microbes Pathology of complement mediated human diseases New diagnostics and therapies of kidney and retinal diseases

In addition we analyse how genetic modifications such as mutations, sequence and copy number variations in complement genes cause human disorders that manifest in different organs. The identification of disease-related genetic variants and novel autoantibodies contribute to the better understanding of the pathology of the complement mediated kidney disorders and lead to new diagnostics and new therapeutic approaches.

r 0 @ p _:;, [j\-;: f] r flr Prof. Thorsten Wiech, Universittsklinikum Hamburg-Eppendorf, Hamburg,

Germany

Prof. Sven Hammerschmidt, University Greifswald, Germany

Prof. Michael Wiesener, University Erlangen-Nrnberg, Germany

Prof. Giuseppe Remuzzi, Dr. Marina Noris, Bergamo, ltaly

53

Hans Knll Institute

Jena Microbial Resource Collection

Dr. Kerstin Voigt

Hans Knll Institute


07745 Jena

kerstin. [email protected]

www.jmrc.hki-jena.de

~~ (!I.J[fi]i) )~f 0 J 1'$.il[l .,.. fil [l$.ij.fu@&j[l1k@$.il 8 ") :;, ~ ' /f] fll [l @:)[1$.il

ll

llbk@~ 13 " ) :;, ~ ' /f] fll [l &!~~ The Research Group Microbial lmmunology investigates the interactions between Candida and the hast, aiming at a better understanding of the interactions that lead to pathophysiological alterations. We furthermore strive to understand which process in pathogenesis lead to the development of clinical symptoms and lethal disease. In this regard, we focus on the following aspects:

The role of fungal morphology in pathogenesis Molecular mechanisms contributing to Candida sepsis Gastrointestinal colonisation and translocation

To address these questions we use microbiological and immunological methods as well as molecular biology in combination with various infection models. We aim to contribute to a better understanding of the processes during infection. This knowledge is indispensable to develop novel strategies for preventing and treating life-threatening Candida infections.

Prof. Michael Bauer, Jena University Hospital, Germany

Dr. Andreas Beilhack, University Hospital of Wrzburg, Germany

Prof. Berit Jungnickel, Friedrich Schiller University Jena, Germany

55

Hans Knll Institute

Microbial Pathogenicity Mechanisms

Prof. Dr. Bernhard Hube

Hans Knll Institute


07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-hki.de/en/microbial-pathogenicity-mechanisms.html

~~QI.l[fi1[).0~[f' @1 J'$ij@[l -;-:. fil [l$ij.fu@&j[l{t@$ij 17 ") :;, ~ @@ fll [l @:l[l

ll

llbk@~

36 " ) :;, ~ @@ fll [l &JI) ij The Department carries out research in the following areas:

lnfection biology of human-pathogenic fungi Molecular/synthetic biotechnology of natural products Microbial communication and natural products Eukaryotic transcription factors and signal transduction Stress- and immunoproteomics

Aspergillus fumigatus is the most important airborne fungal pathogen of humans. For elucidation of hast-pathogen interactions and of virulence determinants state-of-the-art functional genomics tools and cell biological methods are applied. Fungi produce numerous secondary metabolites including antibiotics. We uncover regulatory mechanisms of natural product biosyntheses as well as mechanisms of microbial interactions influencing natural product production. This research represents a new avenue of drug discovery.

Institut Pasteur, Paris, France

Innsbruck Medical University, Innsbruck, Austria

Charite, Berlin

57

Hans Knll Institute

Secondary Metabolism of Predatory Bacteria

Priv.-Doz. Dr. Markus Nett

Hans Knll Institute


07745 Jena

[email protected]

www.leibniz-hki.de/en/sekundaermetabolismus-raeuberischer-bakterien.html

j ~ (!I.J[fi]i) )~f 0 J 1'$.il[l .,.. fil [1$.ij.fu@&j[J @$.il 6 ") :;, ~ ' /f] fll [l ~[1$.ij Our research focuses on antimicrobial natural products. We are particularly interested in

The identification of novel antibiotics from predatory bacteria The development of genomics-inspired strategies for drug discovery Antibiotic biosynthesis The engineering of bacterial pathways for the generation of customized

drugs Biotechnological methods for the production of natural products

Prof. Rolf Mller, Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research, Germany

Prof. Manuela Tosin, University of Warwick, UK

Prof. Oliver Werz, Friedrich-Schiller-University Jena, Germany

58

ll

llbt@~ 15 " ) :;, ~ ' /f] fll [l &!~~ The Research Group Systems Biology/Bioinformatics is dedicated to the integrated computational analysis of genome, transcriptome, proteome and metabolome as weil as microbiological and clinical data. A central task is the gene expression analysis of fungi producing secondary metabolites as weil as of the pathogenic fungi Candida albicans and Aspergillus fumigatus and their interaction with the human immune system by microarray and RNA-Seq data.

The data analysis comprises the management of heterogeneous large-scale experimental data, pre-processing, discovery of the main features and patterns by data mining techniques and - finally - prediction of experimentally testable hypotheses. Hypotheses of interest concern molecular interactions between host and pathogen, or between transcription factors and their target genes within the host or the pathogen or the fungus that produces an natural product.

Wrzburg University Hospital, Wrzburg, Germany

Gebze Technical University, Gebze-Kocaeli, Turkey

BioControl Jena GmbH, Jena, Germany

59

60

Institutsleitung

Prof. Dr. Martin Heimann

Prof. Susan E. Trumbore

Prof. Dr. Markus Reichstein

Anschrift

Hans-Knll-Str. 1 0

07745 Jena

Lage

Webseite

www.bgc-jena.mpg.de

MAX-PLANCK-INSTITUT FR BIOGEOCHEMIE

Die Erde im Blickpunkt

Wir erforschen, wie lebende Organismen -inklusive der Mensch - grundlegende Stoffe wieWasser, Kohlenstoff, Stickstoff sowie Energiemit ihrer Umwelt austauschen. Wir wollenbesser verstehen, wie dieser Austausch undder globale Wandel des Klimas und derUmwelt sich gegenseitig beeinflussen.Dadurch wollen wir zu einem verbessertenVerstndnis des Erdsystems und denkologischen Auswirkungen seinerVernderungen auf globaler Ebene beitragen.

Unsere Forschungsziele beinhalten:

- die quantitative Analyse, wie dieseInteraktionen das Klima der Erde beeinfluen,in Zeiten zunehmender Einflsse desMenschen

- das Entwickeln eins verbessertenVerstndnisses der Regulation vonkosystem-Prozessen und der darangekoppelten biogeochemischen Kreislufe, imZusammenhang mit dem Klimawandel

- die Erforschung von Rckkopplungs-mechanismen auf der Erdoberflche, die dieVegetation, die Zusammensetzung derAtmosphre und das Klima betreffen


Max-Planck-Institut fr Biogeochemie Max Planck Institut

Max-Planck Institute for Biogeochemistry

Markus Reichstein (managing director)

Hans-Knll-Str. 10

07745 Jena

[email protected]

http://www.bgc-jena.mpg.de/

:f"' ~L~J1 r ll ~

1!/ >i "' 1 i 1

Our mission is to understand the role of living organisms in the Earth System. We aim to learn - how organisms exchange fundamental resources like energy, water, carbon

and nitrogen with their environment, - how these exchanges act to influence climate across a range of scales, and - how these exchanges regulate the response of vegetation and soils to changes in climate and land use.

Current biologiocal research focusses an the carbon cycle (see picture), soil biogeochemistry, biosphere-atmosphere interactions, biosphere modelling, plant carbon allocation, soil organic matter, biodiversity, landscape processes, functional biogeography, ecosystem ecology.

c 0 0 Q):;,~~ ~l@Ji 0 iDiv (German Centre for Integrative Biodiversity Research), Leipzig, Halle, Jena

AquaDiva (DFG Collaborative Research Centre), FSU Jena

61

62

Institutsleitung

Prof. Dr. David G. Heckel

Anschrift

Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

Lage

Webseite

http: //www.ice.mpg.de

MAX PLANCK INSTITUTE FOR CHEMICAL ECOLOGY

The Max Planck Institute for Chemical Ecologywas founded by the Max Planck Society inMarch 1 996. The Thuringian town of Jena wasselected because it is home to the Friedrich-Schil ler-University and many other researchcenters, making it an attractive scientificlocation. The establishment of the new institutebuilding on the Beutenberg Campus withimmediate proximity to other biological andchemical institutes offers excellent potential forscientific co-operations and the establishmentof networks.

The institute attracts researchers from all overthe world. At the moment it hosts scientistsfrom 34 different countries. Besides the fivedirectors who are heads of their departments,around 1 95 scientists including 1 08 PhD androughly 25 graduate students do their researchwork here. Altogether, almost 400 persons areaffi l iated with the institute (updated: March201 3).

An important task of the institute is trainingyoung researchers in modern techniques ofchemical ecology. In 2005 a special graduateprogram, the International Max PlanckResearch School, was established that offersthe possibi l ity for highly qualified youngresearchers to conduct their research in aninternational atmosphere.


Max-Planck-1 nstitut fr chemische kologie Max Planck Institute

Biosynthesis I NMR

Dr. Bernd Schneider

Max Planck Institute for Chemical Ecology

Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUbiosynthesis.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~l;.J The research group Biosynthesis/NMR focuses an structure elucidation of ecologically relevant low-molecular secondary metabolites from plants and other organisms, investigations an the tissue- and cell-specific occurrence of natural products, and an stable isotope labeling studies of biosynthetic and metabolic pathways. In particular, we are interested in the detection of biosynthetic intermediates by cryogenic NMR spectroscopy or HPLC-NMR coupling. Major projects encompass the following classes of plant secondary metabolites: Phenylphenalenones, a group of unusual phenylpropanoid-derived phytoalexins and plant pigments occurring in the Haemodoraceae, Musacea, and the Pontederiaceae families; salicinoids from Populus species; nudicaulins, a group of indole-phenylpropanoid hybrid alkaloids from Island poppy (Papaver nudicaule ).

~ ~~-:;, rJr National University of Colombia, Medellin, Colombia

National Academy of Sciences of Belarus; Institute of Bioorganic Chemistry,

Minsk, Belarus

University of Yaounde 1, Yaounde, Cameroon

63

Max-Planck-1 nstitut Max Planck Institute fr chemische kologie

D Department of Biochemistry

D

Prof. Dr. Jonathan Gershenzon


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUbiochemistry.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~F In the Department of Biochemistry, we study the biosynthesis of putative plant defense compounds as a means to explore their ecological roles, especially in trees and other woody plants. By isolating and characterizing the genes and enzymes involved in plant defense biosynthesis, we develop tools to manipulate defensive phenotypes in order to help understand their costs and benefits. At the same time, detailed knowledge of plant defense pathways gives us important insights into the control and evolution of defense. To gain new perspectives on the ecology and evolution of plant defense, we have also begun to study how herbivores and pathogens metabolize plant defense compounds. Knowledge of the metabolic fates of defenses in plant enemies sheds light on their effectiveness and mode of action, and will help understand enemy hast ranges.

r ~~ ~ rJr: Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology, Aachen

Fundamental and Applied Research in Chemical Ecology, Universite de

Neuchtel, Switzerland

Department of Plant and Environmental Sciences, University of Copenhagen,

Denmark

Boyce Thompson Institute for Plant Research, lthaca, New York, USA

64


Department of Bioorganic Chemistry

Prof. Dr. Wilhelm Boland


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUbioorganic-chemistry.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~l;.J In the Department of Bioorganic Chemistry we study defense mechanisms of plants and insects. Modem analytical and molecular methods are employed to identify signals from herbivores and microorganisms related to stress recognition by the plant. Novel methods of Isotope Ratio Mass Spectrometry are used to study the induction of pathways during infection and herbivore damage. The production of defensive secretions of leaf beetles is analyzed to gain information on the biosynthesis, regulation and evolution of these defensive strategies. We focus on the analysis of the molecular basis of the uptake of plant-derived precursors and their transformation into compounds for the insects' communication and defense. The biosynthetic potential of insects is probably strongly enhanced by their commensal gut bacteria or endosymbionts. Therefore we study the biosynthesis of plant-defense elicitors or the detoxification of plant toxins in insects with an emphasis on the participation of gut bacteria.

~ ~~-:;, rJr Universite Libre de Bruxelles, Brussels. Belgium

Pontifical Catholic University of Peru, Lima, Peru

Department of Biology, University of La Serena, Chile

Computerchemie, Leibniz-Institut fr Pflanzenbiochemie, Halle/Saale

65

Max Planck Institute

Department of Entomology

Prof. Dr. David G. Heckei


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUentomology.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~F

Max-Planck-1 nstitut fr chemische kologie

The overall goal of the Department of Entomology is to study evolutionary adaptations in insects which are mediated by chemical signals. The concept of coevolution forms the theoretical framework, in which insect-plant, insect-microbe, and insect-insect interactions are examined. Strategies of plants to avoid being chosen for food and to interfere with the process of herbivory are countered by detoxification mechanisms by the insects. Adaptations by microbial pathogens to use insects as a food source are met by a complex insect innate immune response. And chemical signals by which insects communicate with each other are influenced by interspecific and intraspecific selection pressures. Since all evolutionary change has a genetic basis, knowledge of how genes control these phenotypes is fundamental to an understanding of the mechanism of coevolution and the nature of the coevolutionary equilibrium attained at the present time.

~~ ~ rJr: The University of Queensland, Brisbane, Australia

Fraunhofer Institute for Molecular Biology and Applied Ecology (IME), Gieen

Julius Khn Institute, Federal Research Centre for Cultivated Plants, Darmstadt

Department of Entomology, University of Arizona, Tucson, Arizon, USA

66


Department of Evolutionary Neuroethology

Prof. Dr. Bill S. Hansson


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUevolutionary-neuroethology.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~l;.J In the Department of Evolutionary Neuroethology we study odor-directed behavior and its underlying neurobiological substrate from a functional and evolutionary perspective. In drosophilid flies our main objective is to understand the evolution of olfactory functions. By studying related species living under different ecological conditions it is possible to understand how habitat and food-choice affect the sense of smell. We look at transduction mechanisms, coding and connectivity at different neural levels, as well as the behavioral outcome of olfactory processing. In sphingid moths we want to understand how hast plant associations have affected olfactory function and behavior. We aim to study the complete neuroethological chain of events, from single molecules and genes, to neurons and whole organism responses, and make use of modern neurobiological and molecular ~ techniques and bioinformatics. Behavioral responses are studied in the field, L_ in wind tunnels, andin laboratory bioassays.

~ ~~-:;, rJr Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel

International Centre of lnsect Physiology and Ecology, Nairobi, Kenya

Swedish University of Agricultural Sciences, Alnarp, Sweden

Rothamsted Research, Harpenden, Hertfordshire, United Kingdom

67


D Department of Molecular Ecology

D

Prof. Dr. lan T. Baldwin


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUmolecular-ecology.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~F The overarching research goal of the Department of Molecular Ecology is to manipulate ecological interactions in nature to identify traits that are important for an organism's Darwinian fitness. We focus on plant-mediated interactions and have developed an ecological expression system with a native plant species that has a rich suite of ecological interactions, the wild tobacco Nicotiana attenuata, as well as the herbivores that feed on it, the fungi and bacteria that interact with its roots, and its floral visitors. We have developed molecular (transformation systems, VIGs silencing, cDNA and sequences genomes, UPLC qTOF microarrays, real time RT-PCR, microsatellites, RNA seq), analytical (high throughput HPLC and UPLC-MS, GC-MS (quad,ion trap) and GCxGC-TOF, z-Nose) and ecological (a field station in Utah, insect cultures, and natural history expertise) tools to rigorously manipulate the genetic basis for ecological sophistication in this plant system.

r ~~ ~ rJr: Bean Museum in Lytle Preserve, Utah, USA

Max Planck Partner Group at the Institute of Science Education and Research,

Kolkata, lndia

Max Planck Partner Group at the Kunming Institute of Botany, Chinese Academy

of Sciences

Global Research Laboratory Program South Korea

68


Experimental Ecology and Evolution

Dr. Christian Kost


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUexperimental-evolution.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~l;.J The main goal of the Experimental Ecology and Evolution Research Group is to answer the question: Why do organisms cooperate with each other? For this, we use the cooperative exchange of essential metabolites amongst two or more bacterial strains as an experimentally tractable model. By rigorously and systematically studying the molecular and ecological causes as well as the physiological and evolutionary consequences of a cooperative lifestyle, we aim at contributing to the development of a solid, empirically-based framework that allows to mechanistically predict the evolution of cooperative behaviors within microbial communities. We address this fascinating research question by combining the methodological power of laboratory-based experiments with recent advances in the fields of molecular microbiology and synthetic biology.

~ ~~-:;, rJr Quantitative Analysis of Molecular and Cellular Biosystems, University of

Heidelberg

Institute for Experimental Medicine, Christian-Albrechts-University Kiel

Ecology and Biodiversity, Department of Biology, University of Utrecht,

Netherlands

New Zealand Institute for Advanced Study, Auckland, New Zealand

69


D Mass Spectrometry/Proteomics

D

Dr. Ales Svatos


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUmass-spectrometry.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~F The primary objective of the Mass Spectrometry/Proteomics research group is to measure mass spectra (MS) for structural elucidation and new compound characterization (molecular composition) in cooperation with the scientific departments of the institute. In addition to service, which is aimed especially at structure confirmation of synthetic compounds, projects an structure elucidation of natural products and the elucidation of biosynthetic pathways are carried out. New analytical methods are also developed with a focus an new MALDI matrices and small molecule in situ distribution visualization/imaging. Strang attention is put an teaching and training our users, and we have been organizing summer schools with topics in mass spectrometry an small molecules and proteomics.

r ~~ ~ rJr: Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Cologne, Germany

Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, Prague, Czech Republic

Rothamsted Research, Harpenden, United Kingdom

Center for Research and Advanced Studies of the National Polytechnic Institute

CINVESTAV, lrapuato, Mexico

70

Max-Planck-1 nstitut fr chemische kologie

Olfactory Coding

Dr. Silke Sachse


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUolfactory-coding.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~l;.J

Max Planck Institute

Most organisms rely an their olfactory system to detect and analyze chemical cues in the environment, cues which are subsequently utilized in the context of behavior. The central question of this group is to investigate how odors are coded and processed in the brain to lead to a specific odor perception. The basic layout of the first olfactory processing centers, the olfactory bulb in vertebrates and the antennal lobe in insects, is remarkably similar. Odors are encoded by specific ensembles of activated glomeruli (the structural and functional units of the bulb-lobe) in a combinatorial manner. The vinegar fly Drosophila melanogaster provides an attractive model organism for studying olfaction, as it allows genetic, molecular and physiological analyses. The key method in our group is optical recording of the Drosophila brain, which allows ~ visualizing spatial as weil as temporal components of neuronal activity. L_

~ ~~-:;, rJr Gttingen University, Germany

Halle University, Germany

Swedish University of Agricultural Sciences, Alnarp, Sweden

University of Arizona, USA

71


D Sequestration and Detoxification in lnsects

D

Dr. Franziska Beran


Hans-Knll-Str. 8

07745 Jena

[email protected]

http://www.ice.mpg.de/exUdetoxification.html

::; ;_ ~.:-. !rS 1

1l J!r ~F In the Research Group Sequestration and Detoxification in lnsects we investigate the adaptations of crucifer-feeding leaf beetles to defense compounds present in their hast plants. The crucifer plant family includes many important crops, such as mustard, cabbage, and rapeseed, and is characterized by an activated defense system known as the "mustard-oil bomb"". Tissue damage initiates enzymatic degradation of mustard-oil glucosides yielding highly reactive defense compounds. The herbivores we study are able to avoi

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