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Medizininformatik für eine datenbasierte Gesundheitsversorgung und Forschung

Dennis Kadioglu25.01.2018CCC-AG-Doku

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Medizininformatik…

... ist „die Wissenschaft der systematischen Erschließung, Verwaltung, Aufbewahrung, Verarbeitung und Bereitstellung von Daten, Informationen und Wissen in der Medizin und im Gesundheitswesen. Sie ist von dem Streben geleitet, damit zur Gestaltung der bestmöglichen Gesundheitsversorgung beizutragen“.

(Definition Medizinische Informatik, Deutsche Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e. V.)

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BMBF-Förderkonzept MI

• Ziel:ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung

• Aufgabe:kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen

• Aufgabe:Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung

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Konsortien

ADMIRE

DIFUTURE*

HD4CR

HiGHmed*

MIRACUM*

share-it

SMITH*

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BMBF-Förderkonzept MI

• Ziel:ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung

• Aufgabe:kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen

• Aufgabe:Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung

6 http://labblog.uofmhealth.org/industry-dx/for-optimizing-patient-data-track-and-share-every-moment

DIC

Search & Compose

Ontologies

Metadata

AE A VE V

SAP LIMS

Research

Data

…

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Verstehen wir uns denn?

I‘m feeling cold. My diagnosis: COLD

I caught a cold.

https://clipartfest.com/

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Zusammenarbeit:Intern, extern und national

• BMBF verpflichtet ALLE geförderten Konsortien zur Mit- und Zusammenarbeit in einem Nationalen Steuerungsgremium

• Drei AGs• (Broad) Consent / Consent Management

• Data Sharing, Use & Access

• Interoperabilität

• Telcos und Workshops -> Eckpunktepapiere

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~200 Beteiligte8 Universitätsklinika,8 Medizinische Fakultäten,2 Hochschulen

Medical Informatics for Research and Care in University Medicine

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Use Cases

1. Alerting in Care - IT Support for Patient Recruitment

2. From Data to Knowledge - Clinico-molecular predictive knowledge tool

3. From Knowledge to Action - support for Molecular Tumor Boards

4. Rare Diseases

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Alerting in Care - IT Support for Patient Recruitment

• Etablierung eines Studienregisters• An jedem Standort

• Standortübergreifend (selektiver Umfang)

• Formalisierung von Ein-/Ausschlusskriterien• MIRACUM-Datenelemente für Probandenrekrutierung im

M-MDR

• Benachrichtigung am klinischen Arbeitsplatz

• IT-unterstütztes Probandenmanagement

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MIRACUM-Auswertungen

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MIRACUM-Auswertungen

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MIRACUM-Auswertungen

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MIRACUM-Auswertungen

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MIRACUM-Auswertungen

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From Data to Knowledge - Clinico-molecular predictive knowledge tool

• Anwendung von Machine Learning zur Mustererkennung und zum Clustering• Componentwise Boosting, Deep Boltzmann Machines

• Inklusion von Daten aus allen Standorten, basierend auf harmonisiertem Datenmodell• OMOP CDM

• Alarmierung am klinischen Arbeitsplatz• SMART-on-FHIR

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SMART-on-FHIR

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SMART-on-FHIR

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SMART-on-FHIR

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From Knowledge to Action - support for Molecular Tumor Boards

• Etablierung einer Infrastruktur für das Teilen und gemeinsame Nutzen von Analyse-Pipelines für Hochdurchsatzdaten (Wissen teilen, Qualität sichern)

• Aufbau einer MIRACUM-Datenbank für genetische Varianten

• IT-Unterstützung für die Auswertung, Interpretation und Dokumentation in Molekularen Tumorboards

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Rare Diseases

• Identifikation von ähnlichen Patienten(-fällen) an den MIRACUM-Standorten zur Diagnosenunterstützung

• Identifikation der passenden Ansprechpartner/Experten im SE-Atlas

• Präsentation am klinischen Arbeitsplatz• SMART-on-FHIR

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Use & Access

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IT-Unterstützung: MIRACOLIX

Primary Data Sources ID-Management Tools Data Anonymization Tools

Metadata Repository Data Harmonisation / Mapping Tool

Consent ManagementSystem

Natural Language Processing Tool

Hospital-/Faculty-/MIRACUM-wide Trial-/Project Registry

Project ProposalManagement Tool

ETL Tools Data Integration and Data Exploration Repositories

IT infrastructure to share and easily deploy software pipelines

Tools for Data QualityAnalysis, Reporting andVisualisation

Modules for innovative user-friendly and efficient patient care process visualization

Connector Component(s)

Long-Term Research Data Archive

Federated Authentication Tools for Development, Deployment and Monitoring of IT SolutionsG

UF

isM

IRA

CU

M c

om

pet

ence

cen

ter

Medical Informatics ReusAble eCosystem of Open source Linkable and Interoperable software tools

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BMBF-Förderkonzept MI

• Ziel:ein vernetztes Gesundheitswesen für eine Verbesserung von Forschungsmöglichkeiten und Patientenversorgung

• Aufgabe:kontextübergreifender Austausch und gemeinsames Nutzen von Daten und Wissen

• Aufgabe:Kompetenzvermittlung für datengetriebene Versorgung und Forschung

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Strengthening Medical Informatics

• Master Programme "Biomedical Informatics and Medical Data Science“

• Fortbildungsprogramm für Mediziner

• Online-Kurse

• Summer Schools

• Training und Hospitation

• in der Konzeptphase und bis heute: 40 Webinare

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„…the culture of data sharing will be levelled up from a project-by-project based approach to daily common practice.”

Learning Health(care) System

Open Data?