Pemeriksaan LaboratoriumUntuk Penyakit infeksi dan Inflamasi

Ida ParwatiDepartemen /KSM Patologi KlinikRSUP Dr. Hasan SadikinFakultas Kedokteran Universitas Padjadjaran20210611 MUSCAB IDI

Diagnosis Laboratorium penyakit Infeksi

PemeriksaanKlinis

Deteksi respons host(Biomarker);

Imun; antibodi: IgM, IgGHematologi: Diff, NLR, morfologi, IGKimiawi; CRP, PCT

Deteksi PatogenMikrobiologi:MikroskopikKulturAntigenNAAT/PCR

PemeriksaanLaboratorium

Spesimen:

Pengambilansesuai, tepat,

cukup dan benar

Deteksi Patogen

Pewarnaan: ZN, Gram, Albert, KOH

MikroskopikDapat dikerjakan di semua tk Fasyankes

01

ELISA, ECLIA, POCT/RDT

AntigenPOCT/RDT dapat di Fasyankes primer

03

Biakan konvensional, otomatik, chrome agar

Kultur dan uji kepekaanHanya di RS kelas A,B,C mungkin D

02

NAAT/PCRTCM/Xpert MTB/Rif dapat dilakukandi Fasyankes primer

04

•Pemeriksaan Mikroskopik

• Alat tersedia di semua Fasyankes• Tenaga tersedia di semua Fasyankes• Murah• Relatif mudah• Keuntungan:

- membedakan Gram positif dan Gram negatif memberipetunjuk penggunaan antibiotik

- Semikuantifikasi BTA dapat untuk diagnostik, monitoring terapi, prognostik

- Penemuan jamur => penggunaan antijamur- penemuan parasit => antiparasit- dll.

•Pemeriksaan Mikroskopik

Pewarnaan Gram

Dapat diperiksa di semua tingkat fasilitas Kesehatan

PewarnaanTinta India

PewarnaanZiehl Neelsen

PewarnaanAlbert

PewarnaanKOH

Pemeriksaan biakan/Uji kepekaan

Compact, automated ID/AST instrument

RS Kelas A,B, C Fasyankes Primer

POCT;- Deteksi Antigen- Deteksi gen resisten

Deteksi Antigen

Fasyankes Primer

Deteksi patogen menggunakan NAAT/PCR

Fasyankes Primer

TCM MTB/Rif

RS Kelas A,B, C

Blood Culture Identification Panel

27Targets

•19 bacteria•5 yeast•3 antibiotic-resistance genes

RespiratoryPanel2plus

22Targets

•4 bacteria•18 viruses

Gastrointestinal Panel

22Targets

•13 bacteria•5 viruses•4 parasites

Meningitis/Encephalitis Panel

14Targets

•6 bacteria•7 viruses•1 yeast

Trend saat ini: multiplex PCR: Syndromic testing

PNEUMONIA PANEL MENUSAMPLE TYPE:BAL: (including mini-BAL)Sputum: (including ETA)PERFORMANCE:BAL: 96.2% Sens & 98.3% SpecificitySputum: 96.3% Sens & 97.2% Specificity

VIRUSES:● Adenovirus● Coronavirus● Human Metapneumovirus● Human Rhinovirus/Enterovirus● Influenza A● Influenza B● Parainfluenza Virus● Respiratory Syncytial VirusANTIMICROBIAL RESISTANCE GENES:Methicillin resistance:● mecA/C and MREJCarbapenemases:● KPC● NDM● Oxa-48-like● VIM● IMPESBL:● CTX-M

BACTERIA:Semi-Quantitative Bacteria● Acinetobacter calcoaceticus-baumanniicomplex● Enterobacter cloacae complex● Escherichia coli● Haemophilus influenzae● Klebsiella aerogenes● Klebsiella oxytoca● Klebsiella pneumoniae group●Moraxella catarrhalis● Proteus spp.● Pseudomonas aeruginosa● Serratia marcescens● Staphylococcus aureus● Streptococcus agalactiae● Streptococcus pneumoniae● Streptococcus pyogenesATYPICAL BACTERIA:Qualitative Bacteria● Chlamydia pneumoniae● Legionella pneumophila●Mycoplasma pneumoniae

Multiplex PCR: Syndromic testing

Deteksi respons

Host

IgMIgG

Imunologi01

CRPProcalcitonin

Kimiawi03

Leukocytosis, LeukopeniaDiff count, NLRMorfologi

Hematologi02

Host Biomarkers in Infection

Contoh Responsimun terhadapSARS-CoV-2

Respons Antibodi terhadap Infeksi

RS Kelas A,B, C

ELISA, ECLIA,

• Pemeriksaan Antibodi

Di Fasyankes primer

• Pemeriksaan Antibodi

KombinasiAntigen dan antibodi

Biomarker lain untukinfeksi/inflamasi

Sager, BMC Medicine 15(1) 2017

Penggunaan Procalcitonin pada infeksi bakterial

Gurol, J microbiol and biotech (2594), 2014

Perbandingan kadar Procalcitonin dengan NLR pada sepsis

Neutrofil

Neutrophils display a battery of defense mechanisms; the internalization of pathogens for intracellular killing, the release of proteases and ROS that generate a hostile environment and contribute that help trap bacteria to the microbicidal function of these cells, and the formation of NETs composed of chromatin and secretory mediators

Ley et al., Sci. Immunol. 3, eaat4579 (2018) 7 December 2018

• NLR tinggi akibat hitung neutrofil ↑ dan hitunglimfosit ↓.

• Respons inflamasi dapat menstimulasipeningkatan produksi neutrofil dan mempercepat apoptosis of limfosit.

• Interpretasi NLR harus berdasarkan keadaanklinis.

• NLR dapat menggantikan hitung leukosit. • Dalam beberapa situasi NLR sebanding

dengan biomarker lain (e.g. procalcitonin, lactate).

NEUTROPHIL LYMPHOCYTE RATIO (NLR)

A normal NLR is roughly 1-3. An NLR of 6-9 suggests mild stress

(e.g. a patient with uncomplicated appendicitis).

Critically ill patients will often have an NLR of ~9…

Liu, J Infect 81(1) 2020

Penggunaan Nilai NLR pada managemen Covid-19

IMMATURE GRANULOCYTES (IG)

• The IG fraction is a better predictor of infection than total WBC count

• The IG fraction is comparable to the absolute neutrophil count (ANC) for predicting infection

• An IG fraction of greater than three percent is a very specific (greater than 90 percent) predictor of sepsis.

Immature granulocytes precede or are precursors of white blood cells or immune cells like basophils, neutrophils, and eosinophils, present during infection.

Prodjosoewojo S, et al. (2019) PLoS Negl Trop Dis 13(3)

Take home messages

1. Pendekatan laboratorium deteksi penyakit infeksi dapat melaluipatogen penyebab infeksinya maupun respon host

2. Pemeriksaan laboratorium sangat mengikuti perkembangan teknologi3. Biomarker tidak dapat digunakan secara tunggal, selalu pertimbangkan

keadaan klinis.4. Perlu penelitian terus menerus mengembangkan manfaat dari

pemeriksaan konvensional vs canggih supaya dapat diimplementasikandi Fasilitas Kesehatan Primer.

terimakasih