Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik
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Transcript of Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik
Dr. Josef Ingenerf
Institut für Medizinische InformatikUniversität zu Lübeck
GMDS-Jahrestagung 2005, FreiburgMittwoch, 14. September 2005
Standardisierte Terminologien in der Medizin Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und zwischen Begriffssemantik und
AnwendungspragmatikAnwendungspragmatik
Ingenerf, Lübeck (2)
Vortragsinhalte
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für
Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren
Zusammenfassung
Ingenerf, Lübeck (3)
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Ingenerf, Lübeck (4)
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
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ISO/TC 215/WG 3 "Semantic content" (vorher "Health concept representation“)
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Ingenerf, Lübeck (6)
Vortragsinhalte
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für
Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren
Zusammenfassung
Ingenerf, Lübeck (7)
Typisierung von Terminologien
Abstract-Band, S.80
Bildungs-prinzipien
System vonBegriffen (Worten)
Präkoordination,Identifikation
System vonKlassen/Themen
Hierarchisierung
EinfachePostkoordination
FormalePostkoordination
Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC
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LOINC-Terminologie (RELMA)
Ingenerf, Lübeck (9)
Alpha-ID (“Entry Terms” der ICD-10)
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Vortragsinhalte
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien i.w.S. Ordnungssystem für
Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren
Zusammenfassung
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Unterscheidung von Begriff, Thema, Klasse
Thema (Deskriptor, Schlagwort, Topic)
Wüster, E (1971). Begriffs- und Themaklassifikation: Unterschiede in ihrem Wesen und in ihrer Anwendung. Nachrichten für Dokumentation 22 (3 & 4): 98-104 & 143-150.
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MeSH-Thesaurus
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MeSH-Thesaurus
Themenhierarchieversus
logische Begriffshierarchie
Soualmia, LF, Golbreich, C, Darmoni, SJ (2004). Representing the MeSH in OWL: Towards a Semi-Automatic Migration. In: Hahn, U (ed.). Proc. of the First Int. Workshop on Formal Biomedical Knowledge Representation (KR-MED 2004) in Whistler (BC), Canada, 1 June, 2004. Online-Publikation (CEUR-Workshop Proceedings), siehe http://CEUR-WS.org/Vol-102/, 81-87.
Ingenerf, Lübeck(14)
MeSH-Thesaurus
Nelson, SJ, Johnston, D, Humphreys, BL (2001). Relationships in Medical Subject Headings (MeSH), chapter 11. In: Bean, CA, Green, R (eds.). Relationships in the Organization of Knowledge. New York: Kluwer Academic Publishers, 171-184.
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MeSH-Thesaurus: Deskriptor- und Konzeptebene
desc2005.dtd
Ingenerf, Lübeck(16)
Typisierung von Terminologien
Abstract-Band, S.80
Bildungs-prinzipien
System vonBegriffen (Worten)
Präkoordination,Identifikation
System vonKlassen/Themen
Hierarchisierung
EinfachePostkoordination
FormalePostkoordination
Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC
- Einfache Themenliste
Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten
Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,
z.B. MeSH, Colon-Klass.
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ICD-Klassifikation: Systematik
Statistische Klassifikation versus
Formales Begriffssystem
Ingenerf, J, Giere, W (1998). Concept oriented Standardization and Statistics oriented Classification: Continuing the Classification versus Nomenclature Controversy. Meth.Inform.Med. 37 (4-5): 527-539.
Ingenerf, Lübeck(18)
Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10
ICD-10 Text der ICD
K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 MagenulkusK25.9 MagengeschwürK25.9 MagenschleimhautdefektK25.9 Ulcus pyloricumK25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculiK25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus… …
Alpha-ID
I5051 I5057 I5052 I19021 I11881 I32930
I85926…
Synonymie?
Ingenerf, Lübeck(19)
Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10
ICD-10 Text der ICD
K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 MagenulkusK25.9 MagengeschwürK25.9 MagenschleimhautdefektK25.9 Ulcus pyloricumK25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculiK25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus… …
Alpha-ID
I5051 I5057 I5052 I19021 I11881 I32930
I85926…
SNOMED-CT
1453200862960062537400079660004556500842666000
53189005…
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Typisierung von Terminologien i.w.S.
Abstract-Band, S.80
Bildungs-prinzipien
System vonBegriffen (Worten)
Präkoordination,Identifikation
System vonKlassen/Themen
Hierarchisierung
EinfachePostkoordination
FormalePostkoordination
Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC
- Einfache Themenliste- Klassierter Wertebereich
Statistische Klassifikation,z.B. ICD-10, NLM-Klass.
Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten
Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,
z.B. MeSH, Colon-Klass.
Ingenerf, Lübeck(21)
Begriffsorientierte Terminologie SNOMED-CT
Smith, B, Ceusters, W, Temmermann, R (2005). Wüsteria. In: Geissbuhler, A, Baud, R, Lovis, C (eds.). Proc. of the MIE 2005 conference, Geneva (Switzerland), 6 pages.
Formales Begriffssystem Deduktion von Begriffswissen Beachtung von ontologischen Prinzipien
Ingenerf, Lübeck(22)
89662003 Helicobacter-assoziiertes pylorisches Ulkus (Störung)Fully defined by ...- ist ein/e - 128070006 infektiöse Krankheiten des Abdomens - 312121001 bakterielle Infektionskrankheit des Magen-Darm-Trakts - 39204006 pylorusnahes Magengeschwür - 6185008 in Verbindung mit Helicobacter stehende Krankheit
- verursachendes Agens 80774000 Helicobacter pylori- Group - assoziierte Morphologie 56208002 Geschwür - Befundlokalisation 280119005 Struktur des Magenpförtners
Begriffsorientierte Terminologie „SNOMED-CT“
Ingenerf, Lübeck(23)
Typisierung von Terminologien
Abstract-Band, S.80
Bildungs-prinzipien
System vonBegriffen (Worten)
Präkoordination,Identifikation
System vonKlassen/Themen
Hierarchisierung
EinfachePostkoordination
FormalePostkoordination
Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC
Monoaxiales Begriffssystem(Taxonomie)
- Einfache Themenliste- Klassierter Wertebereich
Statistische Klassifikation,z.B. ICD-10, NLM-Klass.
Multiaxiales Begriffssystem,z.B. SNOMED II/III
Formales Begriffssystem,z.B. SNOMED CT
Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten
Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,
z.B. MeSH, Colon-Klass.
Ingenerf, Lübeck(24)
Zusammenfassung
Abstract-Band, S.80
Bildungs-prinzipien
System vonBegriffen (Worten)
Präkoordination,Identifikation
System vonKlassen/Themen
Hierarchisierung
EinfachePostkoordination
FormalePostkoordination
Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC
Monoaxiales Begriffssystem(Taxonomie)
- Einfache Themenliste- Klassierter Wertebereich
Statistische Klassifikation,z.B. ICD-10, NLM-Klass.
Multiaxiales Begriffssystem,z.B. SNOMED II/III
Formales Begriffssystem,z.B. SNOMED CT
Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten
Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,
z.B. MeSH, Colon-Klass.