UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die...

19
© Fraunhofer UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE DEVTOX DATABASE Rupert Kellner public 1

Transcript of UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die...

Page 1: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE DEVTOX DATABASE

Rupert Kellner

public 1

Page 2: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

OVERVIEW

New images in DevTox

Categorisation of anomalies

Translation of DevTox

public 2

Page 3: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

New Images in DevTox

Visceral anomalies

Images supplied by Dr. Jingying Hu, Shanghai

Selected to represent hitherto unillustrated anomalies

33 new images on anomalies and additional control images

Result: Total of 212 images on visceral anomalies

public 3

Page 4: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Examples for New Images

Eye – Absent

First example in the mouse

public 4

Page 5: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Examples for New Images

Kidney – Absent

First three examples in the rat (see one below)

First example in the mouse

public 5

Page 6: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Examples for New Images

Lung lobe – Supernumerary

First example in any species (rat)

public 6

Page 7: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Categorisation of anomalies

Terminology of developmental anomalies (version 2)

According to Makris et al. 2009

Categorisation in previous terms preserved

Malformation

Grey zone anomalies

Variation

Many terms “not classified”

public 7

Page 8: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Example from DevTox Skeletal Findings: Mandible [Status of 2012]

public

Survey in 2013 to fill the gaps

External: 54

Skeletal: 567

Visceral: 273

Maternal-Fetal: 17

20 questionnaires from experts / expert groups

8

Page 9: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Result of the Survey in 2013

public

Index of Agreement

9

Page 10: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Implementation of the Categorisation in DevTox

Most classifications added according to the Survey: 932 anomalies

Slight modifications of the results of the Survey

Discussion at 8th Berlin Workshop in 2014

Visceral anomalies:

Posterior (caudal) vena cava - Branching variation

Subclavian artery - Branching variation

public 10

Page 11: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Example from DevTox Skeletal Findings: Mandible [Current Status]

public

2012

11

Page 12: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Summary of Current Categorisations in DevTox

public 12

Page 13: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Translation of DevTox

Translation into Chinese version

Proposed at the 8th Berlin Workshop in 2014

Preparation of templates in autumn 2014

Translation in China (Dr. Weihua Li)

Shanghai Institute of Planned Parenthood Research

WHO Collaboration Centre for Research in Human Reproduction

Fudan University

Translated files in several lots from summer 2015 to spring 2016

Implementation in the website

Final checks at BfR (Dr. Wenna Xu)

Release to the public in autumn 2016

public 13

Page 14: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Reduction of the Variety of Text Sources

Original English version

Text files (HTML)

PHP program scripts (Server)

Access database and arrange pages

Database tables

JavaScript programs (Browser)

Build e.g. menus

Button icons with info

public

Modified English version

Text files (PHP)

Database tables

Programs are still active but do not contain any text information displayed on screen

14

Page 15: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Example DevTox General Pages: Background

public

New English version

Technical modifications

Visual appearance unaltered

15

Page 16: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Example DevTox Nomenclature: Skeletal Findings

public 16

Page 17: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Internal Structure of the Database

public

id id

codes

17

Page 18: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Example Rib – Fused

public 18

Page 19: UPDATE OF NEW IMAGES AND CATEGORISATION IN THE · Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig) Translation of DevTox Translation into Chinese version Proposed

© Fraunhofer

R 23 G 156 B 125

R 242 G 148 B 0

R 31 G 130 B 192

R 226 G 0 B 26

R 177 G 200 B 0

R 254 G 239 B 214

R 225 G 227 B 227

Diesen Kasten nicht löschen (ist für die Funktion der Folie wichtig)

Conclusions About the DevTox Translation

Structural rearrangements behind the scenes

Texts separated into a few files and the database tables (one devoted to global character strings)

Switch to different character set (UTF-8)

Programs modified to include the new resources

[Translation of all texts]

Implementation

Additional tables for new language

Programs for filling those new tables

Selection of additional language on the website

Updates need to be considered

public 19