6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie

Zusammensetzung: G+C Gehalt Sequenzähnlichkeit: Hybridisierung

Nukleinsäuren

6. BAKTERIENSYSTEMATIK

16S

rRNA

phylogenetische Taxonomie

Sequenzierung ... 6.1 Taxonomie

6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie

6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie

EUBACTERIA

6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische numerische Taxonomie 6.1 Taxonomie

Proteobacteriea

6. BAKTERIENSYSTEMATIK numerische Taxonomie 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen

EUbakterien

Gram-NEGATIV

Lithoautotrophe ( 5.4.1.1)

Phototrophe ( 5.4.3)

6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.1 Pseudomonaden

6.2.1.2 Rhizobien

6.2.1.3 Agrobacterium

6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer

6.2.1.5 Spirillen

6.2.1.6 prosthekate Bakterien

6.2.1.7 Essigsäurebakterien

6.2.1.8 Scheidenbakterien

6.2.2 gleitende Bakterien

6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte)

6.2.4 Anaerobier

6.2.5 Spirochaeten

Gram-POSITIV

6.2.6 einzellige Sporenbildner

6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer

6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘)

6.2.9 Mycoplasmen

ARCHAEbakterien

extrem Halophile

Methanogene

Thermo-acidophile

Thermoplasma

6.2.1.1 Pseudomonas

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Abbau von Aromaten 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 1,3 oder 1,4 di-substituiert

mehrfach substituiert

einfach substituiert

1,2 di-substituiert

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Abbau von Aromaten 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.1 Pseudomonas

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.2 Rhizobium

Wurzelknöllchen

Bradyrhizobium

Azorhizobium

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.2 Rhizobium

Wurzelknöllchen

Bradyrhizobium

Azorhizobium

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Wurzelknöllchen

Leghämoglobin

6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.2 Rhizobium

Bradyrhizobium

Azorhizobium

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Pflanzen-Tumore

A. tumefaciens A. rhizogenes

6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.3 Agrobacterium

Pflanzen-Tumore 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.3 Agrobacterium

6. BAKTERIENSYSTEMATIK

Schleim

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Azotobacter 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer Beijerinckia

Azospirillum

intestinales

Spirillum

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Bdellovibrio

6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.5 Spirillen

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.6 prosthekate Bakterien

Lebenszyklen

Caulobacter

Hyphomicrobium

nicht phosphorylativ

nicht oxidativ

6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.7 Essigsäurebakterien

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Zuckermetabolismus

Unteroxidierer

Überoxidierer

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.8 Scheidenbakterien

Scheiden

Spaerotilus

Leptothrix

Fe-Oxide

Mn-

Oxide

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen

EUbakterien

Gram-NEGATIV

Lithoautotrophe ( 5.4.1.1)

Phototrophe ( 5.4.3)

6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier

6.2.1.1 Pseudomonaden

6.2.1.2 Rhizobien

6.2.1.3 Agrobacterium

6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer

6.2.1.5 Spirillen

6.2.1.6 prosthekate Bakterien

6.2.1.7 Essigsäurebakterien

6.2.1.8 Scheidenbakterien

6.2.2 gleitende Bakterien

6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte)

6.2.4 Anaerobier

6.2.5 Spirochaeten

Gram-POSITIV

6.2.6 einzellige Sporenbildner

6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer

6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘)

6.2.9 Mycoplasmen

6.2.10 ARCHAEbakterien

6.2.10.1 extrem Halophile

6.2.10.2 Methanogene

6.2.10.3 Thermo-acidophile

6.2.10.4 Thermoplasma

6.2.2 gleitende Bakterien

6. BAKTERIENSYSTEMATIK

Myxobakterien

Schwefel-Oxidierer

6.2.2 gleitende Bakterien

6. BAKTERIENSYSTEMATIK

Myxobakterien

Schwefel-Oxidierer

Flavobacterium johnsoniae

Myxococcus xanthus

6.2.2 gleitende Bakterien

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Myxobakterien: Lebenszyklus

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Myxobakterien: Fruchtkörperbildung 6.2.2 gleitende Bakterien

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.3 Enterobakterien + Verwandte Enterobacteriaceae

Coliforme

Escherichia

Shigella

Salmonella

meist freilebend

Enterobacter

Serratia

Proteus

Pflanzen-pathogen

Erwinia

Tier-pathogen

Yersinia

„Verwandte“

Photobacterium

Vibrio

Serratia

Prodigiosin

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.3 Enterobakterien + Verwandte

Proteus

„Schwärmen“

Photobacterium

Biolumineszenz

Enterobacteriaceae

Coliforme

Escherichia

Shigella

Salmonella

meist freilebend

Enterobacter

Serratia

Proteus

Pflanzen-pathogen

Erwinia

Tier-pathogen

Yersinia

„Verwandte“

Photobacterium

Vibrio

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.4 Gram-negative Anaerobier obligate Fermentierer

Sulfat- und Schwefel-Reduzierer

Fusobacterium

Succinivibrio

→ Pyruvat + H2 Lactat

→ → .... CO2 + H2 Acetat

Lactat- Dehydrogenase

CO- Dehydrogenase

6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.4 Gram-negative Anaerobier

dissimilatorische Sulfat-Reduktion

Desulfobacter

Desulfococcus

Desulfomonas

Desulfosarcina ...

6.2.5 Spirochaeten

6. BAKTERIENSYSTEMATIK Axialfilament

Borrelia

Treponema pallidum

Leptospira