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6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie Zusammensetzung: G+C Gehalt Sequenzähnlichkeit: Hybridisierung Nukleinsäuren
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6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie
Zusammensetzung: G+C Gehalt Sequenzähnlichkeit: Hybridisierung
Nukleinsäuren
6. BAKTERIENSYSTEMATIK
16S
rRNA
phylogenetische Taxonomie
Sequenzierung ... 6.1 Taxonomie
6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie
6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische Taxonomie 6.1 Taxonomie
EUBACTERIA
6. BAKTERIENSYSTEMATIK phylogenetische numerische Taxonomie 6.1 Taxonomie
Proteobacteriea
6. BAKTERIENSYSTEMATIK numerische Taxonomie 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen
EUbakterien
Gram-NEGATIV
Lithoautotrophe ( 5.4.1.1)
Phototrophe ( 5.4.3)
6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.1 Pseudomonaden
6.2.1.2 Rhizobien
6.2.1.3 Agrobacterium
6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer
6.2.1.5 Spirillen
6.2.1.6 prosthekate Bakterien
6.2.1.7 Essigsäurebakterien
6.2.1.8 Scheidenbakterien
6.2.2 gleitende Bakterien
6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte)
6.2.4 Anaerobier
6.2.5 Spirochaeten
Gram-POSITIV
6.2.6 einzellige Sporenbildner
6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer
6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘)
6.2.9 Mycoplasmen
ARCHAEbakterien
extrem Halophile
Methanogene
Thermo-acidophile
Thermoplasma
6.2.1.1 Pseudomonas
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Abbau von Aromaten 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier 1,3 oder 1,4 di-substituiert
mehrfach substituiert
einfach substituiert
1,2 di-substituiert
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Abbau von Aromaten 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.1 Pseudomonas
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.2 Rhizobium
Wurzelknöllchen
Bradyrhizobium
Azorhizobium
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.2 Rhizobium
Wurzelknöllchen
Bradyrhizobium
Azorhizobium
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Wurzelknöllchen
Leghämoglobin
6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.2 Rhizobium
Bradyrhizobium
Azorhizobium
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Pflanzen-Tumore
A. tumefaciens A. rhizogenes
6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.3 Agrobacterium
Pflanzen-Tumore 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.3 Agrobacterium
6. BAKTERIENSYSTEMATIK
Schleim
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Azotobacter 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer Beijerinckia
Azospirillum
intestinales
Spirillum
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Bdellovibrio
6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.5 Spirillen
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.6 prosthekate Bakterien
Lebenszyklen
Caulobacter
Hyphomicrobium
nicht phosphorylativ
nicht oxidativ
6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.7 Essigsäurebakterien
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Zuckermetabolismus
Unteroxidierer
Überoxidierer
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.8 Scheidenbakterien
Scheiden
Spaerotilus
Leptothrix
Fe-Oxide
Mn-
Oxide
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2 ausgewählte Bakteriengruppen
EUbakterien
Gram-NEGATIV
Lithoautotrophe ( 5.4.1.1)
Phototrophe ( 5.4.3)
6.2.1 chemoheterotrophe Aerobier
6.2.1.1 Pseudomonaden
6.2.1.2 Rhizobien
6.2.1.3 Agrobacterium
6.2.1.4 freilebende N2-Fixierer
6.2.1.5 Spirillen
6.2.1.6 prosthekate Bakterien
6.2.1.7 Essigsäurebakterien
6.2.1.8 Scheidenbakterien
6.2.2 gleitende Bakterien
6.2.3 Enterobakterien (+ Verwandte)
6.2.4 Anaerobier
6.2.5 Spirochaeten
Gram-POSITIV
6.2.6 einzellige Sporenbildner
6.2.7 NICHT-sporenbildende einzellige Gärer
6.2.8 Bakterien mit hohem G+C-Gehalt (‘Actinomyceten‘)
6.2.9 Mycoplasmen
6.2.10 ARCHAEbakterien
6.2.10.1 extrem Halophile
6.2.10.2 Methanogene
6.2.10.3 Thermo-acidophile
6.2.10.4 Thermoplasma
6.2.2 gleitende Bakterien
6. BAKTERIENSYSTEMATIK
Myxobakterien
Schwefel-Oxidierer
6.2.2 gleitende Bakterien
6. BAKTERIENSYSTEMATIK
Myxobakterien
Schwefel-Oxidierer
Flavobacterium johnsoniae
Myxococcus xanthus
6.2.2 gleitende Bakterien
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Myxobakterien: Lebenszyklus
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Myxobakterien: Fruchtkörperbildung 6.2.2 gleitende Bakterien
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.3 Enterobakterien + Verwandte Enterobacteriaceae
Coliforme
Escherichia
Shigella
Salmonella
meist freilebend
Enterobacter
Serratia
Proteus
Pflanzen-pathogen
Erwinia
Tier-pathogen
Yersinia
„Verwandte“
Photobacterium
Vibrio
Serratia
Prodigiosin
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.3 Enterobakterien + Verwandte
Proteus
„Schwärmen“
Photobacterium
Biolumineszenz
Enterobacteriaceae
Coliforme
Escherichia
Shigella
Salmonella
meist freilebend
Enterobacter
Serratia
Proteus
Pflanzen-pathogen
Erwinia
Tier-pathogen
Yersinia
„Verwandte“
Photobacterium
Vibrio
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.4 Gram-negative Anaerobier obligate Fermentierer
Sulfat- und Schwefel-Reduzierer
Fusobacterium
Succinivibrio
→ Pyruvat + H2 Lactat
→ → .... CO2 + H2 Acetat
Lactat- Dehydrogenase
CO- Dehydrogenase
6. BAKTERIENSYSTEMATIK 6.2.4 Gram-negative Anaerobier
dissimilatorische Sulfat-Reduktion
Desulfobacter
Desulfococcus
Desulfomonas
Desulfosarcina ...
6.2.5 Spirochaeten
6. BAKTERIENSYSTEMATIK Axialfilament
Borrelia
Treponema pallidum
Leptospira
