17-07-05 BSc FM vorstellung.ppt [Kompatibilitätsmodus] · 11.07.2017 3 Seminar & Praktikum: Block...

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11.07.2017 1 „Signalwahrnehmung & weiterleitung: Regulation zellulärer Prozesse“ Protisten (Euglena gracilis) Grünalgen (Chlamydomonas reinhardtii) Moose (Physcomitrella patens) Höhere Pflanzen (Tabak, Arabidopsis) LEHRSTUHL ZELLBIOLOGIE Zell& Molekularbiologie / Biochemie / Genetik Zellbiologie: Arbeitsgruppen AG MICHAEL LEBERT AG GEORG KREIMER AG BENEDIKT KOST > Photo& Graviorientierung von Flagellaten (Euglena gracilis) > Photoorientierung begeißelter Grünalgen (Chlamydomonas reinhardtii) > Polares Zellwachstum: Moose & höhere Pflanzen (Physcomitrella patens, Tabak) > Pathogenabwehr (Arabidopsis)

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11.07.2017

1

„Signalwahrnehmung & ‐weiterleitung:Regulation zellulärer Prozesse“

Protisten                                (Euglena gracilis)

Grünalgen        (Chlamydomonas reinhardtii)

Moose (Physcomitrella patens)

Höhere Pflanzen             (Tabak, Arabidopsis)

LEHRSTUHL ZELLBIOLOGIE

Zell‐ & Molekularbiologie / Biochemie / Genetik

Zellbiologie: Arbeitsgruppen

AG MICHAEL LEBERT

AG GEORG KREIMER

AG BENEDIKT KOST

‐> Photo‐& Graviorientierung von Flagellaten

(Euglena gracilis)

‐> Photoorientierung begeißelter Grünalgen

(Chlamydomonas reinhardtii)

‐> Polares Zellwachstum: Moose & höhere Pflanzen

(Physcomitrella patens, Tabak)

‐> Pathogenabwehr (Arabidopsis)

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Zellbiologie: BSc Arbeiten 17/18

Prof. Benedikt Kost Prof. Georg Kreimer PD Michael Lebert

Lehrstuhl Zellbiologie: Arbeitsgruppen

Slot Zeitraum Anzahl Plätze Semester

1 21.08.17 – 13.10.17 4 Ferien

2 13.11.17 – 15.12.17 4 WS

3 08.01.18 – 16.02.18 4 WS/Ferien

4 26.02.18 – 13.04.18 4 Ferien/SS

5 18.06.18 – 27.07.18 4 SS/Ferien

https://www.zellbio.nat.fau.de/

Zellbiologie: Fachmodul 17/18 > Vorlesung

Vorlesung: nur WS17/18 Di, 8:15 - 10:00

Zelluläre Grundlagen der pflanzlichen Entwicklung

Teil 1: Benedikt Kost > Zytoskelett

> Endomembransystem

> Zellteilung & -wachstum

> zelluläre Grundlagen der Morphogenese

Teil 2: Georg Kreimer > Licht als Umweltfaktor

> Lichtperzeption & -Signaltransduktion

> Lichtgesteuerte Prozesse:in Zellen & Organentwicklung

Teil 3: Michael Lebert > Schwerkraft als Umweltfaktor

> Schwerkraftperzeption & Signaltransduktion

> Schwerkraft gesteuerte Prozesse:in Zellen & Organentwicklung

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Seminar & Praktikum:

Block A WS17/18 16.10. - 10.11. 2017

Block B SS18 07.05. - 01.06. 2018

Block A & B

Woche 1 > Seminar: Literaturvorträge

> jeder Teilnehmer stellt eine aktuelle Veröffentlichung vor

> Themen passend zu Vorlesung und Praktikum

> Ziele: - thematische Vertiefung

- Präsentationstechnik

Woche 2-4 > Praktikum

> je eine Woche: AG Kost / Kreimer / Lebert

Zellbiologie: Fachmodul 17/18 > Übungen

Praktikum AG Kost: Polares Zellwachstum

Tabak Pollenschläuche

Apikale Zellen von Physcomitrella patens (Moos) Filamenten (Protonemata)

Caulonema

Chloronema

Rhizoide

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Transformation: direkter Gen-Transfer Transformation: Expressionsanalyse

Moos Protoplasten

PEG

TabakPollen

“particle gun”

histochemischerGUS assay

GFP Expression:

EpifluoreszenzMikroskopie

Wachstums-

Effekte

Praktikum AG Kost: Polares Zellwachstum

Plasmid Maxi-Prep Protein (Nt-Rac5) Aufreinigung

E. coli Transformation

& Kultur

PlasmidAufreinigung

PlasmidRestriktion

Agarose Gel-Elektrophorese

GST FusionsproteinAufreinigung

SDS PA Gel-Elektrophorese

Western-Blot

ECL-Detektion

Praktikum AG Kost: Polares Zellwachstum

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Experimentelles System: Chlamydomonas reinhardtii

10 µm

Praktikum AG Kreimer: Cytoskelett

Experimentelle Manipulation

der cytosolischen

Ca2+-Konzentration

Geißel-Abwurf & Regeneration

Praktikum AG Kreimer: Cytoskelett

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(Protein) (Antikörper)

Protein-Analyse Indirekte Immun-Fluoreszenz

SDSPAGE

WesternBlot

(akalische Phosphatase-

Detektion)

isolierteCytoskelette

Geißeln: Proteinzusammensetzung

Mutanten-Analyse

phänotypischeAnalysen

Praktikum AG Kreimer: Cytoskelett

Experimentelles System: Euglena gracilis

Praktikum AG Lebert: Schwerkraft-Perzeption

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VektorInsert

MolekulareKlonierung

„polymerasechain

reaction“

PCR

rekombinantesPlasmid

Praktikum AG Lebert: Schwerkraft-Perzeption

RNAi Gen “Knock-down” Digitale Bildverarbeitung

doppelsträngige RNA

Ziel Gen: Komponente derSchwerkraft-Wahrnehmung

270° 90°

180°

r-value: 0.739 theta: 1°NON RANDOM

Gen „knock-down“:Effekte auf dieSchwerkraft-

Wahrnehmung

Praktikum AG Lebert: Schwerkraft-Perzeption

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Praktikum: Systeme & Methoden

Experimentelle Systeme: Höhere Pflanzen: TabakMoose: PhyscomitrellaAlgen: ChlamydomonasProtisten: Euglena

Transformation: PEG, “particle gun”, Elektroporation-> Markergen-Expression (GUS, GFP)-> RNAi Gen “kock-down”

Molekularbiologie: PCRmolekulare Kolonierung: DNA fragmentPlasmid Maxi Prep

Protein-Biochemie: GST Fusionsprotein: AufreinigungProteinextrakteSDS PAGEWestern Blot: ECL, alk. Phosphatase

Mikroskopie GFP Expression, Immunfluoreszenzdigitale Bildverarbeitung

Organisatorisches

Seminar- E-mail: 2 Wochen vor jedem Übungs-Blockvorbereitung > 1 Veröffentlichung / Student

> Anleitung

Klausuren 1x Vorlesung & 1x Übungen > Erster Montag nach Semester Bewertung > Gesamtnote: 50% Vorlesung (Klausur), 50% Übungen

> Übungen: 20% Seminar40% Protokolle & Mitarbeit (je 50%)40% Klausur

Anzahl Plätze Vorlesung: WS: > 28 PlätzePraktikum: WS & SS: je 14 Plätze

Anmeldung zentrale Vergabe: Fachschaft

Stud-ON > Susanne Mohrbach

WWW https://www.zellbio.nat.fau.de/