20160418 Auftaktveranstaltung BT v03...Fakultät III Prozesswissenschaften Fachgebiet für...

Tag der Biotechnologie

Der Tag der Biotechnologie findet am 14.7.2015 von 13.00‐20.00 Uhr in der Peter‐Behrens‐Halle, Gustav‐Meyer‐Allee 25, 13355 Berlin statt.

Programm:13.00‐14.30 Uhr: Bachelor‐Kolloquium14.30‐16.00 Uhr: Festvortrag 16.00‐19.00 Uhr: Postershow der PromovendenAb 19.00 Uhr: Geselliger Abend mit Grillen und Getränken

Anmeldung über die Webseite:https://www.biotech.tu‐berlin.de/menue/tag_der_biotechnologie/

Wahlpflichtliste A – BVT VeranstaltungenVL/SE Betriebswirtschaftliche Projektplanung biotechnischer Prozesse (6LP)

Blockveranstaltung vom 26.4.16 bis 18.5.16, Schriftliche Prüfung, 26.‐28.4. 10‐16, 9.5.‐12.5. 10‐13, 13.5.‐18.5. 10‐16Ackerstr. 76, Z20Anmeldung bis 25.4.2016 per e‐mail an stefan.junne@tu‐berlin.de UND auf ISIS2 und Quispos

ODER

PR Projektierung biotechnologischer Prozesse (9LP)Voraussetzung ist gleichzeitige Teilnahme am obigen Modul „Betriebswirtschaftliche Projektplanung biotechnischer Prozesse“Blockveranstaltung vom 26.4.16 bis 18.5.16, Projektierungs / Businessplanprojektarbeit während des SS in Gruppen,Abschlußpräsentation (nach Vereinbarung), Anmeldung bis 25.4.2016 per e‐mail an stefan.junne@tu‐berlin.de UND auf ISIS2 und Quispos

Wahlpflichtliste A – BVT Veranstaltungen

Unifying Concepts of Biomolecular Synthesis (6LP)Zeit: 21.4. bis 23.6.16 jeweils Donnerstags 13‐17 Uhr, 27.6. bis 30.6.16 9‐17 UhrOrt: Ackerstr. 76, ACK Z20Anmeldung: Quispos und auf ISIS2

Day Date Time Subject LecturerThursday 21.4. 13‐15 L1 Concepts of Biocatalysis Neubauer

15‐17 S1 Introductory seminar to projects

Thursday 28.4. 13‐16 L2 The microbial use of sugars: a complex physiology of of simple biochemical reactions Neubauer

16‐17 S2 Project seminar

Thursday 12.5. 13‐16 L3 Stress responses in bioreactors Neubauer16‐17 S3 Project seminar

Thursday 19.5. 13‐16 L4 Algae and DHA production Andri Hutari / Peter Neubauer16‐17 S4 Project seminar

Thursday 26.5. 13‐16 L5 Biocatalysis of modified Nucleosides as bioactive compounds and drugs Sarah Kamel


Thursday 2.6. 13‐16 L6 Synthesis and production of bioactive peptides Neubauer /Elvis Legala


Thursday 9.6. 13‐16 L7 Continuous bioprocessing ‐ from evolution in bioreactors to continuous processes Peter Neubauer /Christian Schipp


Thursday 16.6. 13‐17 L8 Biokatalytische Prozesse und Wertstoffrückgewinnung Thomas Grimm16‐17 S8 Project seminar

Thursday 23.6. 13‐17 L9 Biocatalysis of modified Nucleosides as bioactive compounds and drugs Heba Yehia / Maryke Fehlau16‐17 S9 Project seminar

Monday 27.6. 10‐14 L10 in silico screening approaches for identificationof biocatalysts with desired properties (e.g., substrate specificity)

Prof. Matthias Höhne, Univ. Greifswald


Tuesday 28.6. 9‐12 L11 Industrial scale production of peptide pharamceuticals and antibiotics Dr. Burghard König (Sandoz)

13‐17 L12 Synthetic biology and genome editing Johannes Kabisch

Wednesday 10‐13 L13 Anaerobic biocatalysis of halogen compoundsPhD students of Prof. Lorenz Adrian (UfZ Leipzig)

14‐17Anaerobic biocatalysis of halogen compounds

PhD students of Prof. Lorenz Adrian (UfZ Leipzig) and Peter Neubauer

Thursday 9‐12 P1 Group presentationsThursday 13‐17 P2 Group presentations Friday 1.7. 10‐12 E

29.6.

30.6.

Einführung in die Bioelektronik – SoSe 2016 (Birkholz)

Wie funktionieren Biosensoren?

Was haben Leben und IT gemeinsam?

Wie intelligent können Mikrotiterplatten und Lab‐on‐Chip Systeme noch werden?

Was steht zwischen Dir und dem Einsatz der Bioelektronik?Wie sind Mikrochips für die eigenen Versuche zu nutzen?

Was sind ISFETs und was machen

sie in DNA‐Sequenzierern?

Antworten in der ILV Bioelektronikdonnerstags am FGBVT, Z 20, 17h c. t. Einführung am 21.4. 2016; Details unter ISIS.


Systembiotechnologie

Zeit: Mittwochs, 17 ct – 19 Uhr, Start 27.4.2016Ort: Ackerstr. 76, Seminarraum ACK268Anmeldung und weitere Information: Prof. Dr. Peter Götz (goetz@beuth‐hochschule.de)

IngenieurwissenschaftlicheMethoden zur quantitativenBeschreibung biologischerSysteme


Wahlpflichtliste A – BVT VeranstaltungenIndustrielle anaerobe Bioprozesse – Bioenergie, Biogas, Biosolvents (6LP)Zeit: 29.8. bis 2.9.2016 jeweils 10.00 bis 16.00 UhrOrt: Ackerstr. 76, ACK Z20Anmeldung: Quispos und auf ISIS2 (bis 30.6.2016) Mindestteilnehmerzahl 10Weitere Information: Dr. Ing. Stefan Junne (stefan.junne@tu‐berlin.de)

Fakultät III Prozesswissenschaften Fachgebiet für Mess‐ und Regelungstechnik

Regelungstechnisches Praktikum BiotechnologieProf. R. King / F. Neddermeyer ([email protected])

• 3 LP (7 Tage am Fachgebiet)

• Portfolioprüfung (Protokoll, Aussprache)

• Voraussetzung: Grundlagen der Regelungstechnik für BT und Chemieing. oder GMRT (6 LP ?)

• Freitag 29.4.2016 um 16:00 im ER 103 Vorbesprechung zur Terminfindung

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VorlesungRegulation der Genexpression

Veranstaltungsnummer: 0335 L 123

Block 05.09.-16.09.2016, HS TIB 21c, 12-16h Dozent: Dr. Henry Fechner

Informationen auf ISIS2

INHALTE

• Genexpression und Regulation der Transkription• Prinzipien der Genregulation / Transkriptionsfaktoren• Chromatinstruktur und Transkriptionsregulation• Posttranskriptionale Regulation der Genexpression – RNA Interferenz• Transmembranrezeptoren• Transmembranrezeptoren mit Tyrosinspezifischer Proteinkinase-Aktivität• G-Protein gekoppelte Rezeptoren• Nukleäre Rezeptoren• Second Messenger• Regulation des Zellzyklus• Regulierbare Genexpressionssysteme

1. RNA Interferenz als molekulares Werkzeug Veranstaltungsnummer: 0335 L 120

Block 19.09.-23.09.2016, 9-18hPraktikumsraum 423, 325

2. Gentherapie und Genexpression Veranstaltungsnummer: 0335 L 122

Block 26.09.-30.09.2016, 9-18hPraktikumsraum 423, 325

Praktikumsinhalt:

‐ Zellkultur‐ Transfektion von Zellen mit Plasmiden‐ Anwenden von shRNA und amiRsgegen Phospholamban‐ Anwendung des Tet‐On Genexpressionssystems ‐ Luciferase‐Indikatorgenexpressionssysteme‐ Herstellung und Testung von Adeno‐Assoziierten Virus (AAV)‐Vektoren

PraktikumBetreuer: Dr. Henry Fechner

Ziel: Entwicklung einer Gentherapie für die Behandlung der Herzinsuffizienz

Einschreibung 01.07‐15.7.2015 auf ISIS 2; 16 Teilnehmer je Praktikum.

Prüfungsausschuss Master

• PA‐Vorsitzender: Jens Kurreck (Stellvertreter: Peter Neubauer)– Alle E‐mails an:

• [email protected]‐berlin.de

– Das Sekretariat ist derzeit nicht besetzt und das Fachgebiet hat zur Zeit nur einen Assistenten. Bitte planen Sie etwas Zeit für die Antworten ein.

• Sprechstunden: mittwochs 9.30 bis 10.00 Uhr– Keine Anmeldung– Sprechstunde am 23.4. fällt aus, weitere Abweichungen werden

durch Aushang am Sekretariat (TIB 17A, R. 322) bekanntgegeben

PR Zelldifferenzierung humaner Stammzellen

02.7. bis 07.07.

09.7. bis 14. 07.

SE Vertiefung Med. Biotechnologie

20.06. bis 01. 07.

10:00 bis 17:00

Moderne Techniken in der in in vitro Diagnostik

18.4. ‐ 11. 7. TIB 825

Montags 17‐18:30

PR 14.7. 9:30 ‐ 13:30

Forensische Genetik

15.7. 16:00 Vorbesprechung

18.7. bis 22. 7. 13:30 bis 18:30 in TIB 582

VL SE Membranproteine

DI. 18:00 bis 20:00

Thielalle 63

Prof. Dr.-Ing. Vera Meyer

IBioT, Department Applied and Molecular Microbiology

Applied and Molecular Microbiology

Courses for Master StudentsSoSe 2016

Lehre FG AMM SoSe 2016

VL Angewandte und Molekulare Mikrobiologie (0335 L 058)(2 SWS)

Block: 04.07. bis 08.07.2016

Zeit: 10.00 bis 16.00 Uhr

Ort: Seminarraum 401, (TIB; Geb. 17a)

Vorbesprechung: 27.06.2016 17.00 bis 18.00 TIB 401

Diese Lehrveranstaltung wird von Vera Meyer gehalten.



1) Systems biology in applied microbiology

-> an omics view on microbial fermentation (bacteria, yeast, fil. fungi)

-> genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics

-> complexity of biological networks

-> databases and data evaluation

3,000,000 components

Weight : 560 tSpeed : 900 km/hPassengers : 850

Genes : 3002Proteins : ~ 3000 Metabolites: ~ 800 - 10007,000 components



2) Synthetic biology in applied microbiology

-> minimal genomes, synthetic life, ethical considerations

-> standardization, modularisation, designing biological systems

AND OR NOT

Standardized parts

Logic Gates

Computers

Integrated Circuits

Cells


SE Systembiologie der Mikroorganismen (0335 L056)(2 SWS)

Block: 11.07. bis 22.07.2016


Ort: Seminarraum 401 (TIB, Geb. 17a)

Termin zur Vorbesprechung und Platzverteilung wird über ISIS/per Aushang bekannt gegeben!

Diese Lehrveranstaltung wird von Herrn Dipl.-Ing. Paul Schäpe gehalten.


SE Systembiologie der Mikroorganismen (0335 L056)(2 SWS)

-> microbial genome databases

-> evaluation of transcriptomic data

-> gene co-expression networks

-> R, Bioconductor, Cytoscape

-> FetGOAT, TFBSF, …

-> focus: Aspergillus niger


PR Praxis der angewandten und molekularen Mikrobiologie (0335L057)(3 SWS)

Block: 25.07. bis 29.07.2016


Ort: Praktikumsraum 494 (TIB, Geb. 17a)

Termin zur Vorbesprechung und Platzverteilung wird über ISIS/per Aushang bekannt gegeben!

Diese Lehrveranstaltung wird von Herrn Dr. Sascha Jung gehalten.


PR Praxis der angewandten und molekularen Mikrobiologie (0335 L057)(3 SWS)

Functional studies

Deletion ofGOI

Overexpressionof GOI

GFP reporter to studylocalisation of GOI

-> topic: functional genomics of Aspergillus niger

-> methods:

-> Gibson cloning, PCR, Southern Blot

-> chemiluminescence detection, fluorescence microscopy


Peer-to-Peer teaching in der Mikrobiologie (10 LP)

Wahlfach für Biotechnologen im Masterstudiengang bzw. Bachelorstudiengang (5./6. Semester).

Anmeldung via E-Mail bis spätestens 22.4.16: [email protected]

Peer-to-Peer teaching II in der Mikrobiologie (6 LP)

Wahlfach für Biotechnologen im Masterstudiengang bzw. Bachelorstudiengang (5./6. Semester).

Anmeldung via E-Mail bis spätestens 22.4.16 : [email protected]


Genetik in der Biotechnologie (0335 L 044)(1 SWS, Wahlfach)

Zeit: Donnerstag: 17.00 bis 18.00 UhrOrt: Hörsaal TIB 21 004 Beginn: 28.04.2016

Diese Lehrveranstaltung wird von Frau Prof. Dr. Christine Lang gehalten.

Anmeldung via E-Mail [email protected]

Synthetic Biology, IGEM Prof. Ned Budisa (Fakultät II)

Other recommended courses

http://igem.biocat.tu-berlin.de/index.php

Astrobiologie (VL) Prof. Schulze-Makuch (Fakultät II)

Other recommended courses

Last but not least: DTG Life-Science-Network

DTG: Deutsche Technion GesellschaftTechnion: Israel Institute of Technology Haifa

• Life Science Network of the DTG offers the possibility for Master or PhD

students to join one of the participating Institutes for a 4 – 6 weeks research stay.

• Each of the German universities accepts up to five Technion students per year,

while each German university can send up to five students to the Technion.

• Each student is supported by a grant of 1000 € by the DTG

German Life—Science Network: TUB, TU Hamburg-Harburg, TU München, TU Dresden, Uni Hanover

Contact TUB: Vera Meyer

DTGMarianne Krüger‐JungnickelTU Hochhaus TEL1515Ernst‐Reuter‐Platz 7D‐10587 [email protected]

FG Bioanalytik

TU Berlin ‐ Fachgebiet Bioanalytik (Juri Rappsilber)

FG Bioanalytik – Angebotene Module

Sommer Semester• Advanced Bioanalytics (max. 18 LP)

• Vorlesung + Seminar: 6 LP• Forschungsemester: 6 LP (ca. 120 h)• Forschungsemester: 12 LP (ca. 240 h)• in Planung: Praktikum NMR (B): 6 LP

Winter Semester• Modern Mass Spectrometry (6 LP)


WS

SS


Advanced Bioanalytics VorlesungSS

Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)

strukturell quantitativfunktionell


Advanced Bioanalytics VorlesungSS

Analyse von Biomolekülen (insb. Proteine)

• Massenspektrometrie• Biostatistik• Next‐Generation‐Sequencing• Kristallstrukturanalyse• Kernspinresonanzsprektroskopie• Elektronenmikroskopie

strukturell quantitativfunktionell


Advanced Bioanalytics SeminarSS

Seminar zur Datenanalyse• Big Data Handling• Graphische Darstellung• Statistik• Methodenspezifisches

t

Schw

ierig

keit/K

omplexitä

t


Advanced Bioanalytics SeminarSS

Seminar zur Datenanalyse• Big Data Handling• Graphische Darstellung• Statistik• Methodenspezifisches Laptop bitte

mitbringen!

t

Schw

ierig

keit/K

omplexitä

t

Advanced Bioanalytics VL + Se


SS

Mo Di Mi Do Fr08‐10 Uhr Vorlesung Seminar10‐12 Uhr12‐14 Uhr14‐16 Uhr16‐18 Uhr

Advanced Bioanalytics VL + Se


SS

Mo Di Mi Do Fr08‐10 Uhr Vorlesung Seminar10‐12 Uhr12‐14 Uhr14‐16 Uhr16‐18 Uhr

Ausnahme:1. Vorlesung am Do 21.04. ‐‐ 8.30 Uhr

Advanced Bioanalytics ‐ RegistrierungSS

Registrierung via ISISPasswort: HSA‐BS3

Wichtig:Fragebogen ausfüllen + Foto


Advanced Bioanalytics ‐ ForschungssemesterSS


• Mitarbeit in einem aktuellen Forschungsprojekt• kein Skript ‐‐> Versuchsplanung im Team• Leider nur sehr begrenzte Teilnehmerzahl

• Wir wollen:• Engagement und Zuverlässigkeit• Lust auf wissenschaftliches Arbeiten

Wir bieten:• Team‐ und Laborerfahrung• 6 LP (ca. 120 h)• 12 LP (ca. 240 h)


E. Coli E. Coli



E. Coli E. Coli

Zellaufschluss / Probenvorbereitung

other methods...



E. Coli E. Coli




E. Coli E. Coli


x 100

x 100



E. Coli E. Coli


+ Maschinenlernenx 100

x 100


Modern Mass Spectrometry

• MMS will take place in WiSe• Advanced Bioanalytics required• Two blocks:

• soft skills• mass spectrometry

Our goal:• Give you practical skills that will prepare you for your thesis and beyond• Make you a (budding) expert in mass spectrometry


WS


Soft skills:

Presentations:

• How to read a paper?• How to write a paper (thesis)?• How to give a talk?

• Each student needs to give a talk about a recently published paper from the mass spectrometry field

• prepare a written summary (extended abstract) of the paper


WS


Topics for the mass spectrometry part:

• Peptide and protein identification• Quantitative proteomics ‐ disease vs. healthy proteomes• Advanced acquisition techniques:

• Selected reaction monitoring• Data independent acquisition

• 3D proteomics ‐ gain information about 3D structure of proteins• …. Many more!


WS

Functional Genomics in Environmental Biotechnology

Bakterien und Archaeenrelevant für die Umwelt- und GeomikrobiologieGenomik, Physiologie, Biochemie und Metabolismus

Themen• Umweltbiotechnologie (Bodensanierung, Plastik,

Chemikalienabschätzung, Methanbildung, …)• Geomikrobiologie (Biomining, Aquifere, Böden,

Meeressedimente)• Evolution

Methoden• Bioinformatische Tools & Datenbanken• Sequenzierung und Annotation mikrobieller Genome• Proteomik• Verwendung stabiler Isotope (13C, 15N, 2H)• Single-Cell Methoden

Functional Genomics in Environmental Biotechnology

Vorlesung mit SeminarFachlicher Ergänzungsbereich - 0335 L 146 (freie Wahl)

Dozent: PD Dr. Lorenz AdrianKontakt: [email protected]

Termine: ab 25.04.2016Montags 8:15 – 9:45 Uhr (n.V.)

Raum: Gustav-Meyer-Allee, TIB21-004Abschluss: Portfolioprüfung; Vortrag eines eigenen ProjektesLPs: 3, Liste AInfo: ISIS2 (ohne Passwort einschreiben)

Kurs unter Fachgebiet Angewandte Biochemie

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