Dr. Josef Ingenerf Institut für Medizinische Informatik Universität zu Lübeck GMDS-Jahrestagung...

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Dr. Josef Ingenerf Institut für Medizinische Informatik Universität zu Lübeck GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005 Standardisierte Terminologien in der Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik Anwendungspragmatik

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Dr. Josef Ingenerf

Institut für Medizinische InformatikUniversität zu Lübeck

GMDS-Jahrestagung 2005, FreiburgMittwoch, 14. September 2005

Standardisierte Terminologien in der Medizin Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und zwischen Begriffssemantik und

AnwendungspragmatikAnwendungspragmatik

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Ingenerf, Lübeck (2)

Vortragsinhalte

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für

Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren

Zusammenfassung

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Ingenerf, Lübeck (3)

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?

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Ingenerf, Lübeck (4)

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?

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Ingenerf, Lübeck (5)

ISO/TC 215/WG 3 "Semantic content" (vorher "Health concept representation“)

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?

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Ingenerf, Lübeck (6)

Vortragsinhalte

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für

Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren

Zusammenfassung

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Ingenerf, Lübeck (7)

Typisierung von Terminologien

Abstract-Band, S.80

Bildungs-prinzipien

System vonBegriffen (Worten)

Präkoordination,Identifikation

System vonKlassen/Themen

Hierarchisierung

EinfachePostkoordination

FormalePostkoordination

Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC

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Ingenerf, Lübeck (8)

LOINC-Terminologie (RELMA)

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Ingenerf, Lübeck (9)

Alpha-ID (“Entry Terms” der ICD-10)

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Ingenerf, Lübeck(10)

Vortragsinhalte

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien i.w.S. Ordnungssystem für

Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren

Zusammenfassung

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Ingenerf, Lübeck(11)

Unterscheidung von Begriff, Thema, Klasse

Thema (Deskriptor, Schlagwort, Topic)

Wüster, E (1971). Begriffs- und Themaklassifikation: Unterschiede in ihrem Wesen und in ihrer Anwendung. Nachrichten für Dokumentation 22 (3 & 4): 98-104 & 143-150.

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Ingenerf, Lübeck(12)

MeSH-Thesaurus

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Ingenerf, Lübeck(13)

MeSH-Thesaurus

Themenhierarchieversus

logische Begriffshierarchie

Soualmia, LF, Golbreich, C, Darmoni, SJ (2004). Representing the MeSH in OWL: Towards a Semi-Automatic Migration. In: Hahn, U (ed.). Proc. of the First Int. Workshop on Formal Biomedical Knowledge Representation (KR-MED 2004) in Whistler (BC), Canada, 1 June, 2004. Online-Publikation (CEUR-Workshop Proceedings), siehe http://CEUR-WS.org/Vol-102/, 81-87.

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Ingenerf, Lübeck(14)

MeSH-Thesaurus

Nelson, SJ, Johnston, D, Humphreys, BL (2001). Relationships in Medical Subject Headings (MeSH), chapter 11. In: Bean, CA, Green, R (eds.). Relationships in the Organization of Knowledge. New York: Kluwer Academic Publishers, 171-184.

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Ingenerf, Lübeck(15)

MeSH-Thesaurus: Deskriptor- und Konzeptebene

desc2005.dtd

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Ingenerf, Lübeck(16)

Typisierung von Terminologien

Abstract-Band, S.80

Bildungs-prinzipien

System vonBegriffen (Worten)

Präkoordination,Identifikation

System vonKlassen/Themen

Hierarchisierung

EinfachePostkoordination

FormalePostkoordination

Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC

- Einfache Themenliste

Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten

Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,

z.B. MeSH, Colon-Klass.

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Ingenerf, Lübeck(17)

ICD-Klassifikation: Systematik

Statistische Klassifikation versus

Formales Begriffssystem

Ingenerf, J, Giere, W (1998). Concept oriented Standardization and Statistics oriented Classification: Continuing the Classification versus Nomenclature Controversy. Meth.Inform.Med. 37 (4-5): 527-539.

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Ingenerf, Lübeck(18)

Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10

ICD-10 Text der ICD

K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 MagenulkusK25.9 MagengeschwürK25.9 MagenschleimhautdefektK25.9 Ulcus pyloricumK25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculiK25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus… …

Alpha-ID

I5051 I5057 I5052 I19021 I11881 I32930

I85926…

Synonymie?

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Ingenerf, Lübeck(19)

Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10

ICD-10 Text der ICD

K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 MagenulkusK25.9 MagengeschwürK25.9 MagenschleimhautdefektK25.9 Ulcus pyloricumK25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculiK25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus… …

Alpha-ID

I5051 I5057 I5052 I19021 I11881 I32930

I85926…

SNOMED-CT

1453200862960062537400079660004556500842666000

53189005…

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Ingenerf, Lübeck(20)

Typisierung von Terminologien i.w.S.

Abstract-Band, S.80

Bildungs-prinzipien

System vonBegriffen (Worten)

Präkoordination,Identifikation

System vonKlassen/Themen

Hierarchisierung

EinfachePostkoordination

FormalePostkoordination

Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC

- Einfache Themenliste- Klassierter Wertebereich

Statistische Klassifikation,z.B. ICD-10, NLM-Klass.

Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten

Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,

z.B. MeSH, Colon-Klass.

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Ingenerf, Lübeck(21)

Begriffsorientierte Terminologie SNOMED-CT

Smith, B, Ceusters, W, Temmermann, R (2005). Wüsteria. In: Geissbuhler, A, Baud, R, Lovis, C (eds.). Proc. of the MIE 2005 conference, Geneva (Switzerland), 6 pages.

Formales Begriffssystem Deduktion von Begriffswissen Beachtung von ontologischen Prinzipien

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Ingenerf, Lübeck(22)

89662003 Helicobacter-assoziiertes pylorisches Ulkus (Störung)Fully defined by ...- ist ein/e - 128070006 infektiöse Krankheiten des Abdomens - 312121001 bakterielle Infektionskrankheit des Magen-Darm-Trakts - 39204006 pylorusnahes Magengeschwür - 6185008 in Verbindung mit Helicobacter stehende Krankheit

- verursachendes Agens 80774000 Helicobacter pylori- Group - assoziierte Morphologie 56208002 Geschwür - Befundlokalisation 280119005 Struktur des Magenpförtners

Begriffsorientierte Terminologie „SNOMED-CT“

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Ingenerf, Lübeck(23)

Typisierung von Terminologien

Abstract-Band, S.80

Bildungs-prinzipien

System vonBegriffen (Worten)

Präkoordination,Identifikation

System vonKlassen/Themen

Hierarchisierung

EinfachePostkoordination

FormalePostkoordination

Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC

Monoaxiales Begriffssystem(Taxonomie)

- Einfache Themenliste- Klassierter Wertebereich

Statistische Klassifikation,z.B. ICD-10, NLM-Klass.

Multiaxiales Begriffssystem,z.B. SNOMED II/III

Formales Begriffssystem,z.B. SNOMED CT

Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten

Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,

z.B. MeSH, Colon-Klass.

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Ingenerf, Lübeck(24)

Zusammenfassung

Abstract-Band, S.80

Bildungs-prinzipien

System vonBegriffen (Worten)

Präkoordination,Identifikation

System vonKlassen/Themen

Hierarchisierung

EinfachePostkoordination

FormalePostkoordination

Enumerative Begriffsliste,z.B. Alpha-ID, LOINC

Monoaxiales Begriffssystem(Taxonomie)

- Einfache Themenliste- Klassierter Wertebereich

Statistische Klassifikation,z.B. ICD-10, NLM-Klass.

Multiaxiales Begriffssystem,z.B. SNOMED II/III

Formales Begriffssystem,z.B. SNOMED CT

Einfache Themenhierarchie,z.B. Gelbe Seiten

Thesaurus oder multi-axiale Themenklassifikation,

z.B. MeSH, Colon-Klass.


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