Kapitel II Elemente, kleine Moleküle, Makromoleküle · ©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis,...

35
Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 1 Kapitel II Elemente, kleine Moleküle, Makromoleküle Wiederholung

Transcript of Kapitel II Elemente, kleine Moleküle, Makromoleküle · ©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis,...

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 1

Kapitel IIElemente, kleine Moleküle, MakromoleküleWiederholung

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Anteil der Elemente die im menschlichen Körper und in der Erdkruste vorhanden sind (in %)

2

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 3

Die wichtigsten Elemente in Lebewesen und ihre Anordnung im Periodensystem

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Elemente und ihre Wechselwirkungen mit anderen Atomen

4

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Die Ionenbindung bei Natriumchlorid

5

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Spezielle Geometrien mit kovalenten Bindungen

6

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Spezielle Geometrien mit kovalenten Bindungen

7

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Viele kleine Kräfte halten das Leben zusammen

8

hydrophobe WW (Ausschluss von Wasser) ≈ 8 kJ/mol (≈ 100 meV)

Wasserstoffbrücken ≈ 10 kJ/mol (≈ 120 meV)

Elektrostatische WW ≈ 15 kJ/mol (≈ 200 meV)

van der Waals WW ≈ 1-5 kJ/mol (≈ 5-50 meV)

zum Vergleichthermische Energie ≈ 2 kJ/mol (≈ 25 meV/Teilchen)kovalente Bindungen bis zu 400 kJ/mol

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Makromoleküle in Bakterienzellen

9

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 10

Moleküle in wässriger Umgebung

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/chemBonds1.php

= δ

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 11

Hydrophilen und hydrophobe Oberflächen

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/chemBonds1.php

= δ

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 12

Inter- und intramolekulare Kräfte in wässriger Lösung -> Elektrostatische Wechselwirkung

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/chemBonds1.php

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 13

Bausteine der DNA/RNA

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/garland_PDFs/gar_PDF_indx.php

in RNA

deoxyribosein DNA

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 14

DNA and RNA Structure

http://www.uic.edu/classes/phys/phys461/phys450/ANJUM04/RNA_sstrand.jpg

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 15

DNA im Zellkern

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1a/Chromosom.svg/1000px-Chromosom.svg.png

Länge der menschlichen DNA im Zellkern jeder Zelle: ~1,80mØ Zellkern: 5 - 16 µm

http://de.wikipedia.org/w/index.php?title=Datei:Genom_bsteinmann.jpg&filetimestamp=20060609171237

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 16

DNA Coiling in Chromosomen

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/chemBonds1.php

Molekulardynamik-simulationen

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 17

Zuckermoleküle (Saccharide)

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/garland_PDFs/gar_PDF_indx.php

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 18

Di-, Oligo- und Polysaccharide

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/chemBonds1.php

Speicherstoff Stärke -> Polysaccharid homolog zu Glycogen -> α-1,4-glykosidischen Verknüpfungen

bei Überhitzung (>170°C) von Stärken (Backen, Braten, Rösten, Grillen und Frittieren) in Gegenwart der Aminosäure Asparagin entsteht das möglicherweise Krebs erregende Acrylamid

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 19

Lipide sind amphiphil -> Kompartimente

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/garland_PDFs/gar_PDF_indx.php

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 20

Lipide und ZellmembranAbgrenzung und Barriere

http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/chemBonds1.phphttp://www.cedarville.edu/personal/hk/phospholipid.gif

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 21

Aminosäuren, die Bausteine der Proteine

©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. http://www.essentialcellbiology.comPublished by Garland Publishing, a member of the Taylor & Francis Group.

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 22

Aminosäuren, die Bausteine der Proteine

©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. http://www.essentialcellbiology.comPublished by Garland Publishing, a member of the Taylor & Francis Group.

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 23

Aminosäuren, die Bausteine der Proteine

©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. http://www.essentialcellbiology.comPublished by Garland Publishing, a member of the Taylor & Francis Group.

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 24

Peptidkette

©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. http://www.essentialcellbiology.comPublished by Garland Publishing, a member of the Taylor & Francis Group.

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 25

Peptidbindung

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 26

Peptidbindung

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 27

Kovalente Bindung zwischen zwei nicht benachbarten Aminosäuren im Proteinkovalente Bindung zwischen den Schwefel-Atomen zweier

CysC

Cysteinethree letter code

one letter code

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 28

Sekundärstrukturen in ProteinenDisulfidbrücken

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 29

Jedes Protein hat exakt eine dreidimensionale Struktur

©1998 by Alberts, Bray, Johnson, Lewis, Raff, Roberts, Walter. http://www.essentialcellbiology.comPublished by Garland Publishing, a member of the Taylor & Francis Group.

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 30

Sekundärstrukturen in Proteinenα-Helix

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 31

Tertiärstruktur

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 32

Sekundärstrukturen in Proteinenβ-Faltblatt

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 33

Sekundärstrukturen in Proteinen

beta sheet

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle 34

Proteine sind die Maschinen der Zelle

Beispiele

Erkennungsprozesse -> Antikörper, RezeptorenTransport -> HämoglobinStruktur -> Mikrotubuli, AktinKatalyse -> EnzymeSignale -> SignalproteineDurchlässigkeit -> MembrankanäleMotoren -> Myosin, Kinesin

Biologie für Physikerinnen und Physiker Kapitel II Elemente, Moleküle, Makromoleküle

Kapitel III

-> Organellen

35