OC BIOLOGIE WS2019 - Universität Innsbruck€¦ · E-Isomer Z-Isomer E-Isomer Z-Isomer EINIGE...
Transcript of OC BIOLOGIE WS2019 - Universität Innsbruck€¦ · E-Isomer Z-Isomer E-Isomer Z-Isomer EINIGE...
4. Stoffgruppen
4.1. Gesättigte Kohlenwasserstoffe (Alkane)
CH
H HH H3C CH3 H3C CH3
HH
MethanCH4
EthanC2H6
PropanC3H8
ButanC4H10
H3C
HHCH3
H H
àà für n C-Atome ergibt sich: CnH2n+2
Offenkettige Alkane
àà Es gibt primäre, sekundäre, tertiäre und quarternäre C Atome
à in gesättigten Kohlenwasserstoffen findet man NUR ss-Bindungen, d.h. Bindungsrotationen sind erlaubt,daraus ergeben sich unterschiedliche räumliche Anordnungen, die man Konformere nennt.
CH
H H
CH
H H
CH
H H
CH
H H
gestaffelt(staggered)
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
gestaffelt(staggered)
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
H
H HC
H
HHH
H
HC
H
HH
60 °
120 °
gestaffelt(staggered)
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
C CH
H
H H
H
HBlick-
richtung
HC C
H
H HH H
HC C
HH H
HH
Aufbau der Alkane und Konformationen
Beispiel: Ethan CH3-CH3
Sägebock-Projektion
Keilstrichformel
Newman-Projektion
Ethankonformere
HC C
H
H HH H
HC C
HH H
HHHC C
H
H HH H
HC C
HH H
HH HC C
H
H HH H
gestaffelt(staggered)
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
gestaffelt(staggered)
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
Blick-richtung
CH3
H HC
CH3
HHH
CH3
HC
CH3
HH
ENERGETISCHGÜNSTIGstaggered
ENERGETISCHUNGÜNSTIG
ekliptisch, auf Deckung(eclipsed)
kleine AktivierungsenergieBei Raumtemperatur (RT) stehen die dreiKonformere in einem schnellenGleichgewicht:
15% M-synclinal15% P-synclinal70% antiperiplanar
synplanaranticlinal anticlinal
M-synclinal(gauche WW)
P-synclinal(gauche WW)antiperiplanar
0 60 120 180 240 300 360
synplanar
H3CC C
HH CH3
HH
Butankonformere
Cyclische Alkane
Cycloalkane sind gesättigte Kohlenwasserstoffe mit ringförmig geschlossenem Kohlenstoffgerüst (durchRingschluss ändert sich Summenformel im Vergleich zu offenkettigen Alkanen à CnH2n).
Konformere von cyclischen Alkanen
In kleinen Cycloalkanen (weniger als 6 C-Atome) treten Ringspannungen aufgrund derAbweichung von der idealen Tetraeder-Geometrie auf (Baeyer Spannung). Zusätzlich tretenekliptische Anordnungen auf (z.B. Cyclopropan, Pitzer Spannung).
Blick-richtung
C3 C1
H
H
Haxial
HäquatorialH
HH
H
H
HH
H
H
HC3
Hax
HäqH
HC1
Haxial
Häquatorial
Sessel 1
C1
C3
H
H
H
HH
HH
H
Haxial
HäquatorialH
H
Blick-richtung
H
HC3
Hax
HäqH
HC1
Haxial
HäquatorialSessel 2
via Übergangszustand: Wanne(energetisch ungünstig) Wanne
Konformere von Cycloalkan
Konformere von Cycloalkan
Methylcyclohexan
äquatoriale Methylgruppe7.5 kJ/mol stabiler
axiale Methylgruppesterische Wechselwirkung mit Protonen in
1,3-Position (1,3-diaxiale WW)
H
H
CH3
H
H
H
H
CH3
H
H
H
H
à sterisch anspruchsvolle Substitutenten möglichst in äquatorialer Position !
Konformere von höhersubstituierten Cycloalkanen
1,2-disubstituierte Cycloalkane
äquatorial, äquatorial Stellungenergetisch günstiger
äq
äq
ax
ax
axial, axial Stellungenergetisch ungünstiger
Substituenten sind auf unterschiedlichen Seiten der Ringebene.
trans Form
Substituenten sind auf der gleichen Seite der Ringebene.
cis Form
Äquatorial-1, axial-2 Stellung
äq1ax2
äq2
ax1
Äquatorial-2, axial-1 Stellung
1,3-disubstituierte Cycloalkane
äq2
ax1 äq1
ax2
äq
axäq
ax
äquatorial, äquatorial Stellungenergetisch günstiger
axial, axial Stellungenergetisch ungünstiger
Äquatorial-1, axial-2 Stellung
Äquatorial-2, axial-1 Stellung
Substituenten sind auf unterschiedlichen Seiten der Ringebene.
trans Form
Substituenten sind auf der gleichen Seite der Ringebene.
cis Form
1,3-disubstituierte Cycloalkane
äqäq
ax
ax
äq2
ax2
äq1
ax1
axial, axial Stellungenergetisch ungünstiger
Substituenten sind auf unterschiedlichen Seiten der Ringebene.
trans Form
Substituenten sind auf der gleichen Seite der Ringebene.
cis Form
äquatorial, äquatorial Stellungenergetisch günstiger Äquatorial-1, axial-2 Stellung
Äquatorial-2, axial-1 Stellung
à Bei 2 cyclische Verbindungen, die über eine gemeinsame C-C Bindung verknüpft sind, spricht man von einemkondensierten System.
Beispiel 1: Decalin (Decahydronaphtalin)
H
H
trans-Decalin
H
H H
H
cis-Decalin
H
H
Beispiel 2: Steran (Gonan)-Grundgerüst à Steroide leiten sich davon ab.
H H
H
H
H HA B
C D
5a-Steran
H
HH H
HH
H H
H
H
H HA B
C D H
H H
HH
H
5b-Steran
H
HO
H H= Cholesterin
Kondensierte Ringsysteme
4.2. Ungesättigte Kohlenwasserstoffe (Alkene, Alkine)
àAlkene (früher:Olefine) sind organische Verbindungen mit einer oder mehreren C=CDoppelbindungen. Diese Doppelbindung(en) werden durch die Endung –en in der Nomenklaturberücksichtigt. Analog zu den Alkanen gibt es unverzweigte, verzweigte und cyclische Alkene.
à Allgemeine Summenformmel: CnH2n
à Diastereoisomerie: durch gehinderte Rotation aufgrund von p-Bindung: E-Z-Isomerie
C CH
H H
HC CH
H CH3
HC CH
H H2C
H
CH3C CH
H
CH3
CH3
Ethen Propen 1-Buten 2-Methylpropen(Isobuten)
Unverzweigte Alkene, homologe Reihe (jeweils ein C mehr)
Verzweigtes Alken, Konstitutionsisomer zu 1-Buten
Cyclohexen
Cyclisches Alken
H3C H
CH3H
H CH3
CH3H
E-2-Buten Z-2-Buten
E-Z-Isomerie
Alkene
E/Z Isomerie in Alkenen
Bei höhersubstituierten Doppelbindungen werden Substituenten nach Cahn-Ingold-Prelog Regeln (CIP-Regeln) nach
fallender Ordnungszahl geordnet.
E-Isomer Z-Isomer E-Isomer Z-Isomer
EINIGE WICHTIGE ORDNUNGSZAHLEN: Wasserstoff H OZ = 1, Kohlenstoff C OZ = 6, Brom Br OZ = 35, Chlor Cl
OZ = 17, Fluor F OZ = 9, Iod I OZ = 53, Sauerstoff O OZ = 8, Stickstoff N OZ = 7, Schwefel S OZ = 16
Übungs-Beispiele:
Konjugierte Doppelbindungen
EthenFunktion als Phytohormon und dient zur Regulation des Pflanzenwachstums und Fruchtreifung. Tomaten prodzuierenEthen aus der Aminosäure Methionin, das Ethen bewirkt den Reifungsprozeß der Tomate. In genmanipulierte Tomatenist das Gen zur Ethenproduktion ‚ausgeschalten‘. Diese Tomaten können durch externe Begasung mit Ethen auf Wunsch gereift werden.
Geschlechts- und Alarmpheromone
Biologisch relevante Alkene
Isoprenoide
H
O LichtEnergie
O HE Z
Retinal – Bestandteil von Rhodopsin (Sehfarbstoff)
Biologisch relevante Alkene
b-Carotin – Farbstoff der Karotte
Lycopin– Farbstoff der Paprika und Tomate
Fumagilin – ein Antibiotikum
O
O
O
OH
OCH3
O
O
O
O OH OH
OH
OH OH
OH
O
OH
O
OH
O
HOCH3
H3C
H3C
O
OHNH2
OHCH3
Amphotericin B – ein Antibiotikum
Elektrophile Additionsreaktion
C C+E+ + Nu-C C+E
C CE Nu
C C+E+ C+E
+ Nu- C CE Nu
Zweistufiger Mechanismus
1. Elektrophil wird nucleophil von Mehrfachbindung angegriffen: Ausbildung einer s-Bindungzwischen C-Atom und Elektrophil, Bildung eines Carbokations (sp2 hybridisiert bei Alkenen,sp hybridisiert bei Alkinen).
2. Angriff eines Nucleophils auf Carbokation unter Ausbildung einer weiteren s-Bindung.
Elektrophile Additionsreaktion - Halogenierung
stereospezifischer anti-Angriff
Bei konjugierten Systemen 1,2- und 1,4 -Addition möglich
Br Brδ+
δ-
Br-
Br+(b)
(a)
Br
Br
(a)
(b)Br
Br
C+R1R2
R3
Stabilitätsfolge von Carbokationen
R1=R2=R3=CH3 à tertiäres Carbokation stabiler als
R1=H, R2=R3=CH3 à sekundäres Carbokation stabiler als
R1=R2=H, R3=CH3 à primäres Carbokation stabiler als
R1=R2=R3=H à Methyl-Carbokation
àà ergibt sich aus +I-Effekt der Alkyl-Gruppe !!
BEVORZUGTES ZWISCHENPRODUKTàà sekundäres Carbokation stabiler !
WIRD NICHT BEOBACHTETàà primäres Carbokation weniger stabil !
Addition von Halogenwasserstoffen an Alkene – Regel von Markownikow
H
H CH3
CH3HBr C+
H
H CH3
CH3H
H
H CH3
CH3HBr C+
H
H CH3
CH3H
H
H CH3
CH3H+ Br-C+
H
H CH3
CH3H C
H
H CH3
CH3H Br
Addition von Halogenwasserstoffen an Alkene – Regel von Markownikow
BEVORZUGTES ZWISCHENPRODUKT àà tertiäres Carbokation stabiler !
WIRD NICHT BEOBACHTET àà primäres Carbokation weniger stabil !
H
H3C H
H
H+
starke Säure z.B. H2SO4
C+
H
H3C H
HH
HO
H
HH3C
H
HH
O+HH
- H+
HH3C
H
HH
HO
Alken Alkohol
Addition von Wasser an Alkene
Squalen
O2Enzym
O
Squalenoxid
H+
C+HO
HO
C+
Dominoreaktion - H+
HO Lanosterin
Biologisch relevante Alkenreaktion
4.6. Amine
primäre, sekundäre und tertiäre Amine (bezieht sich auf Substitutionsgrad des Stickstoffes)
Methylamin(primäres Amin)
Dimethylamin(sekundäres Amin)
H3C NH2 H3CHN CH3 H3C N CH3
CH3
Trimethylamin(tertiäres Amin)
Di- und Triamine
H2N CH2 CH2 NH2
Ethylendiamin 2,4,6-Triamino-benzoesäure
Cyclische Amine
Piperidin Pyrrolidin
Anilin
Aromatische Amine
NH2
HO O
NH2H2N
NH2
NH
NH
Beispiele
§ schwächere Basen, da freies Elektronenpaar von Stickstoff mit pp-System des Aromaten wechselwirken kann (+M-Effekt).
NH2
C-
+NH2H
C-
+NH2H
C-
+NH2
H
à Geringere Basizität aromatischer Amine ist Folge der größeren Resonanzstabilisierung des Amins im Vergleich zumAmmoniumsalz.
à Protonierung hebt Mesomerie zum Teil auf:
N+HHH N+H
HH
Aromatische Amine
OHHO
NH2
Dopamin(bei Mangel Parkinsonsche Krankheit)
OHHO
NH2HO
Noradrenalin(Vorläufer von Adrenalin)
OHHO
NHO
CH3
H
Adrenalin(blutdrucksteigernd, Stresshormon)
OCH3H3CO
NH2
OCH3
Mescalin(kommt in Peyotl-Kaktus vor àälteste-bekannte Halluzinogen)
NH
CH3CH3
HO
EphedrinBlutdrucksteigernd, anregend für
Nervensystem à Aufputschmittel, zB Amphetamine)
HON+CH3
CH3CH3
OH-
Cholin(gefäßerweiternd, blutdrucksenkend,
regelt Darmbewegung)
ON+CH3
CH3CH3
OH-O
Acteylcholin(Neurotransmitter, blutdrucksenkend,
stark muskelkontrahierend)
Biochemisch wichtige Amine
4.7. Aldehyde und Ketone
§ Aldehyde (Alcohol dehydrogenatus) und Ketone sind durch Oxidation von Alkoholen zugänglich:
§Aldehyde tragen die Endung -al, Ketone -on
H H
O
H3C H
O
H
OO H
FormaldehydMethanal
AcetaldehydEthanal
Butanal Benzaldehyd
Aldehyde
KetoneH3C CH3
O
CH3
OO CH3 O
AcetonPropanon Butan-2-on Acetophenon
Methylphenylketon Benzophenon
O
H
OH
HH
O
CH3
OH
CH3H
Beispiele
§ Kohlenstoff und Sauerstoff sind sp2-hybridisiert und durch eine Doppelbindung verbunden. Die dreiBindungen, die vom Kohlenstoff ausgehen liegen in einer Ebene und schließen einen Winkel von ca. 120 ein.
CO
δ+
δ-
C+O-Nucleophiles Zentrum
Elektrophiles Zentrum
Elektrophil und Nucleophil
§ keine H-Brückenà tieferer Siedepunkt als Alkohol, niedere Aldehyde und Ketone sind wasserlöslich.
§ Keto-Enol-Tautomerie: tautomeres Gleichgewicht = Tautomere sind durch Wanderung eines H-Atomsineinander überführbar.
H3C CH2
OH
H3C CH2
OH
AcetonKeto-Form:99.9997 %
AcetonEnol-Form:0.0003 %
CH2
CH2
OH
CH2
CH2
OH
Keto-Form:15 %
Enol-Form:85 %
H3C
O
H3C
O
Eigenschaften
OH
OCH3
Anisaldehyd
OH
OH
Vanillin
OCH3
Zimtaldehyd
O
H
Muscon: Moschus Geruch
O
H3C H
Vitamin K1: Blutgerinnung
CH3
O
O 2
O
O
H3CO
H3CO
CH3
Hn
Ubichinone: Oxidationen in Mitochondrien
O
R1
R2R3
HO
Tocopherole: Vitamin E-Reihe - Radikalfänger
OHOH
O
O
Alizarin: Färbestoff
Biologisch wichtige Aldehyde und Ketone
§ Addition von Nucleophilen an die Carbonyl-Gruppe:
CO
R2R1
R1, R2 = Alkyl KETONR1 = Alkyl, R2 = H ALDEHYD
Nu- CO-
R1 R2Nu
+ H+
COH
R1 R2Nu
Folgereaktion
à Elektrophiles Carbonyl-C wird von Nucleophil angegriffenà verschiedenste Nucleophile sind möglich: z.B. Stickstoff (N)-, Sauerstoff (O)- oder auch Kohlenstoff (C)- Nucleophile.
§ Bildung von Enolat-Anionen:
H3C CH2
OH
α-Position
Base
H3C CH2
O-HBase+
à Proton kann von a-Kohlenstoff relativ leicht abstrahiert werden unter Bildung eines Enolat-Anions.
Enolat-Anion
Reaktionen von Aldehyden und Ketonen
§ Addition von Wasser (H2O) an die Carbonyl-Gruppe:
CO
R2R1CO-
R1 R2O+
CO
R1 R2O
HOH
H H H
H
§ Addition von Alkoholen (HO-R) an die Carbonyl-Gruppe à Bildung von Acetalen:
RCO
HO
H CO-
R HO+
H
COH
R HO
Aldehyd Halbacetal
COH
R HO
Halbacetal
OH
- H2OCO
R HO
Acetal
+ H+
(zB Schwefel-säure)
àà Acetale sind im Sauren NICHT stabil, imBasischen stabil.
Cyclisches Acetal bei DiolenR
CO
HO
H OH
RC
H
HO O
OH
- H2OC
+ H+
(zB Schwefel-säure)
R HO O
Aldehyd Ethylenglykol(1,2-Ethandiol)
cyclischesAcetal
Addition von O-Nucleophilen
Addition von N-Nucleophilen
R1
O
HNH2
R2R1
OH
HNH
R2
- H2O
R1
N
H
R2
§ Addition von primären Aminen an die Carbonyl-Gruppe:
Halbaminal Imin, Schiff‘sche Base
§ Addition von sekundären Aminen an die Carbonyl-Gruppe:
O
HNHR2 OH
NH
R2
- H2O N
H
R2
R3R1H H R3
H
R1H R1
H
R3
Enamin
§ Enamin-Imin Tautomerie
4.8. Carbonsäuren und Derivate
§ Carbonsäuren können durch Oxidation von Aldehyden erhalten werden. Sie enthalten eine Carboxyl-Gruppe (-COOH).
R COOH
sp2-hybridisiert
Saures Proton
R COOH R C
OO-
H+
Carboxyl Carboxylat Proton
HO
OH H3C
O
OHO
OH
O
OH
§ Beispiele
Ameisensäure Essigsäure Propionsäure Buttersäure
O
OH
Benzoesäure
HO
O
OH
O
Malonsäure cis-9-Octadecensäure(ungesättigte Fettsäure)
Beispiele und Eigenschaften
nucleophil
saures (leichtabspaltbares) ProtonR C
OO H
elektro-phil
§ Carbonsäuren besitzen eine POLARISIERTE C=O
Bindung. Das C-Atom ist elektrophil, es kann durchNucleophile angegriffen werden. Einer der C-gebundenen
Sauerstoffe ist nucleophil.
§ Carbonsäuren können Wasserstoffbrücken-Bindungenbilden, sie können z.B. Dimere bilden.
§ Die höhere Acidität (im Vergleich zu anderenVerbindungen wie Alkohole) beruht auf der Mesomerie-Stabilisierung der konjugierten Carboxylat-Base.R
O
O
HR
O
O
H
H-Brückenbildung
O
O H- H+ O
O-
O-
O
MesomeriestabilisiertesCaroboxylat
Eigenschaften
§ Elektronenziehende Effekte (-I –Effekt)
Elektronenziehende Substituenten (z.B. Halogene, -CN, -NO2 oder auch –COOH) bewirken eine Zunahme derAcidität. Die Stärke des –I Effektes ist kurzreichweitig, aber additiv.
O
OH
O
OHCl
O
OHCl
Cl
O
OHCl
ClClpKa = 4.76
pKa = 2.81
pKa = 1.30
pKa = 0.65
O
OHClpKa = 4.10
O
OHCl
pKa = 2.80
§ Elektronengebende Effekte (+I –Effekt)
Elektronengebende Substituenten (z.B. Alkyl-Subsituenten) bewirken eine Abnahme der Acidität.
O
OHpKa = 4.76
O
OHpKa = 5.05
HO
OHpKa = 3.77
Einflüsse auf Säurestärke
§Mesomerer Effekt
Elektronenziehende bzw. elektronendichte-verringernde Substituenten am Aromaten (z.B. Halogene, -CN, -NO2oder auch –COOH) bewirken eine Zunahme der Acidität.
O
OH
O
OH
O2N
pKa = 4.22
pKa = 3.42
O
OH
O2N
NO2
NO2pKa = 0.65
§ H-Brückenbildung
H-Brücken können das entstehende Carboxylat-Anion stabilisieren, zB Salicylsäure (Vorläufer von Aspirin©)
O
OO H
H - H+
O
O-
OH
pKa = 2.97
Einflüsse auf Säurestärke
pKa-Werte von Carbonsäuren
RO
OH
SOX2
R'-OH
R'-NH2
RO
X X = Cl, Br
RO
O R'
RO
NH
R'
Carbonsäurehalogenide
Carbonsäureester
Carbonsäureamide
§ Beispiele
O
ClONH2
O
O
Benzoesäurechlorid Essigsäureethylester Acetamid
Reaktionen von Carbonsäuren
RO
Y
Y = OH, NH2, OR'
HNuR
OYNu
H
RO
NuHY
tetrahedralesZwischenprodukt (sp3)
à Additions-Eliminations-Reaktion: in der Regel Gleichgewichtsreaktionen, Reaktion durch Säuren (Protonierung derCarboxylgruppe) und Basen (Deprotonierung des Nucleophils) beschleunigbar.
Beispiel: Hydrolyse von Carbonsäurederivaten zu Carbonsäuren
tetrahedralesZwischenprodukt (sp3)
NH2
OH2O/H2SO4
OH
O
+H+
NH2
O+H
NH2+
OH
+H2O
NH2O
H
OH2+-H+ NH2
OH
OH
OH
OH+
OH+
OH
+H+ N+OH
OH
-NH3
-H+
HHH
Additions-Eliminationsreaktion
R OH
O R'-OH/H2SO4
R OR'
O
+H+
R OH
O+H
R OH+
OH
+R'-OH
ROH
OH
O+
-H+
ROH
OH
OR'
R OR'
OH+
OR'+
OH
+H+
RO+
OH
OR'
-H2O
-H+
H
H
R
R' H
àAdditions-Eliminations-Reaktion
à Gleichgewichtsreaktion: um Ester zu erhalten Überschuß an Alkohol verwenden und starke Säuren, entstehendesWasser entfernen.
à Esterhydrolyse (= Umkehr der Veresterung): Verseifung, im Alkalischen
Herstellung von Carbonsäureestern
Coenzym A mit einer Thiol (S-Alkohol)-Funktionalität àà Bildung von energiereichen Thioester zB Acetyl-CoA
Acetyl-CoA: Aktivierte Essigsäure, wichtigstes Carbonsäurederivate im Stoffwechsel zB beteiligt in Auf- und Abbau von Fettsäuren,Alkoholstoffwechsel, Citratcyclus
O
NH
SH
HN
OOH
OPOP
O
O-
O
O-O
O
O OHP
N
N
N
N
OHO
-O
NH2
O
NH
S
HN
OOH
OPOP
O
O-
O
O-O
O
O OHP
N
N
N
N
OHO
-O
NH2O
O
SCoA
Energiereiche C-S-Bindung
Biologisch wichtige Carbonsäurederivate