Seminar: Dynamische Modelle komplexer Systeme Vortrag: Symmetriebrechung & Musterbildung Dienstag,...

Seminar: Dynamische Modelle komplexer Systeme

Vortrag:

„Symmetriebrechung & Musterbildung“

Dienstag, 12.07.200517:15 Uhr, SR/GMG

Referent:Philippe Bourdin

Blattnervatur eines tropischen Farns [3]

Musterbildung ist ein Prozeß, bei dem einräumlich homogener Zustand instabil wird und einem inhomogenen Zustand, also einem Muster weicht.

Meist wird eine solchespontane Symmetriebrechungdurch Veränderung einesParameters in einemnichtlinearen System erzielt.

Definition: „Symmetriebrechung & Musterbildung“

[2]

• Ein bißchen Geschichte

• Zweidimensionale Muster

• Das Bénard-Experiment

• Komplexe Ginzburg-Landau-Gleichung (CGLE)

• Belousov-Zhabotinsky-Reaktion (BZ)

• Reaktions-Diffusions-Gleichungen (RD)

• Simulation: Der Brüsselator

• Weitere Muster in der Natur

Inhalt: „Symmetriebrechung & Musterbildung“

Ein bißchen Geschichte

• Wie entstehen zweidimensionale Muster ?

Ein bißchen Geschichte

• Wie entstehen zweidimensionale Muster ?

• Ab 1965 erforscht u.a. von A. Gierer und H. Meinhardt (MPI)

• Einfaches Turing-Modell: System aus Aktivator und Inhibitor

• beschreibbar durch zwei nichtlineare, partielle Differentialgleichungen

Zweidimensionale Muster

• Beispiel: Astwachstum am Süßwasserpolypen


• Beispiel: Astwachstum am Süßwasserpolypen

• Substrat nötig, Fluktuation („Samen“) startet für Zellwachstum

• Wachstum geht zur höchsten Substrat-Konzentration

• Inhibitor zieht weiter mit Aktivator

• Ist Aktivator weit genug entfernt, kann ein Abzweig entstehen, da der Inhibitor ebenfalls fehlt

• Zweig-Wachstum wieder zur höchsten Substrat-Dichte

• Wachstum geht weiter, bis Substrat aufgebraucht ist

• Kein „zusammenwachsen“ [2]


• Simulation versus Beobachtung: Wachstum von ZnSO4

• Dendritische Ablagerung simulierbar durch Zelluläre Automaten

[6]

Das Bénard-Experiment

• Temperaturgradient sorgt für Wärmetransport


• Temperaturgradient sorgt für Wärmetransport

• Viskosität der Flüssigkeit bremst Konvektion

[4]


• Kritischer Temperaturgradient notwendig für ein Umschlagen

Tem

per

atu

rgra

die

nt

stei

gt

Ko

nvektio

nsro

llen

[4]


• Aus: Naviér-Stokes-Gleichung, Bewegungsgleichungen, Kontinuitätsgleichung und Wärmeleitungs-Gleichung.

• Boussinesq-Approximation:

(mit als thermischen Ausdehnungskoeffizient) Alle anderen Materialparameter konstant.

• Man erhält mit weiteren Näherungen und Vereinfachungen die spezielle Navier-Stokes-Gleichung:

(u: innere Energie q: transportierte Wärmemenge g: Gravitation)

0

2

00

iii

i

ii

ij

i gxx

uqp

xu

xu

t

u

00 1 TT


• Damit lassen sich die Konvektionsrollen erklären:

laminare Konvektionsrollen Chaotisch bei höherem T.-Gradienten

[4]


• Offene Randbedingungen => Hexagonale Konvektionszellen

Entspricht rein qualitativ den Konvektions-Granulen der Sonne =>

[4]

Komplexe Ginzburg-Landau-Gleichung (CGLE)

• Allgemeine Formulierung des Problems:

,,, jjk

ii XXFttrX


• Allgemeine Formulierung des Problems:

• Vereinfacht:

• Störungsrechnung: mit

Ruhezustand + kleine Störung

• Taylor-Entwicklung:

xLxhxLdt

txd Ordnung

ritätNichtlineaLinearteil

.1

,

,XFdttXd

,,, jjk

ii XXFttrX

txXtX S

0, SXF

:SX :tx


• Differentialgleichung:

• Lösungs-Ansatz:

• => Eigenwertgleichung:

• Stabilitätsbedingung:

• Wenn

=> Bifurkation

xLdt

txd Ordnung

.1

teutx

uuL

instabil 0Re stabil 0Re

CT 0ReRe CC T

[1]


• Allgemeine Ausgangs-Gl.:

• Entwicklung um kritischen Punkt:

• Taylor-Entwicklung für:

• und:

• In Systemen großer räumlicher Ausdehnung:

• man erhält:

,,,,

xhxL

t

trx

...22

1 C

..., 22

1 xxtrx

2Im

Tt C

...

r

,,

10 xhxLxLt

trx


• Einsetzen und Koeffizientenvergleich in Ordnungen von :

(analog zur linearen Analyse)

• In dritter Ordnung erhält man inhomogenes Gleichunssystem

• Lösbarkeitskriterium mittels „Satz von Friedholm“ (kompliziert)

0Im 10

xLT

O CC

cceucx iT ,1

11202

2

1Im xxhxL

TO xxCC

022

22

2 pcccepcx Ti


• Man erhält schließlich (mit ):

• Die „Komplexe Ginzburg-Landau-Gleichung“ (CGLE)

• Höhere Ordnungen von sind nicht enthalten.

• Entwicklung in auch für Bénard-Zelle möglich: => „Newell-Whitehead-Segel-Gleichung“ (NWSE)

zc

zzizizt

zC

211

Die BZ-Reaktion

• Oszillierende Reaktion in einer Petrischale:

• Bromid und Cer 3+/4+

Die BZ-Reaktion

• Oszillierende Reaktion in einer Petrischale:

• Bromid und Cer 3+/4+

• Inhibitor: Bromid

• Reaktion 1: verbraucht Bromid

• Reaktion 2: oxidiert Ce3+

(Farbwechsel)

• Reaktion 3: bildet Ce4+ und Bromid zurück

[1]

Reaktions-Diffusions-Gleichungen

• Allgemeine Formulierung für oszillierende Reaktionen:


• Allgemeine Formulierung für oszillierende Reaktionen:

• „Brüsselator“-Modell (Prigogine, Lefever, Nicolis, Brorckmans: 1968-1988)

• Quelle der Nicht-Linearität: autokatalytische Reaktion

• Reaktionsgeschwindigkeiten … => Ratengleichungen

XYXk

323

CYXBk

2

XAk1

DXk4

(autokatalytisch)

1k 4k


• Ratengleichungen:

• Allgemein, mit Diffusionsterm (D: Diffusionskonstante):

• Lösung nur numerisch durch Zelluläre Automaten

• Zum Vergleich: Bénard-Zelle beschreibbar durch Lorenz-Gleichungen:

XkYXkBXkAkdtdX 42

321

YXkBXkdtdY 232

XDYXFdt

dX ,,

bZXYdtdZ

XZYRXdtdY

YXdtdX

...dt

dY(analog)

Simulation: Der Brüsselator

• Ratengleichungen: XkYXkBXkAkdtdX 42

321

YXkBXkdtdY 232


• Ratengleichungen:

• Numerische Simulation: (A=1, B=3, X0=Y0=1, k1=…=k4=1)

XkYXkBXkAkdtdX 42

321

YXkBXkdtdY 232

YXc ,

T Xc

Yc

[8]


• Die BZ-Reaktion Simulation versus Beobachtung:

• Spiralwellen und Chaotische Oszillationen

[2]


• Stabilitätsbetrachtung des Brüsselators:

• Stationäre Zustände:

• Mit A=1 und B=1,5 ergibt die Simulation:

0 dtdYdtdX

Ak

kX S

4

1

A

B

kk

kkYS

13

24

T[8]


• Stabilitätmatrix:

• Berechne Eigenwerte:

• Instabil für:

232

2342

S

S

XkBk

XkkBk

22

4

21

2

3

2

42

2

3

2

4 Ak

k

k

k

k

kX

k

k

k

kB S

ilImaginärte

243

2

242

3

Realteil

42

32 42

1SSS XkkBkkXkkXkBk

Weitere Muster in der Natur


• Schneckenmuster:

• Aktivator, Inhibitor, Diffusionsterme, Zerfallsraten, Grundproduktion

2

22

x

aDarb

b

as

t

aaaa

2

22

x

bDbrsa

t

bbb

[Amoria dampieria] [Natica Stercusmuscarum]


• Musterbildung:

Katalytische CO-Oxidation

[5]

Zusammenfassung

• Wir sahen Muster in: der Natur, der Physik und der Chemie

• Theoretische Modelle bieten eine gute Beschreibung

• Simulationen zeigen teilweise gute Übereinstimmungen zwischen Theorie und der Beobachtung

• Trotz allem gibt es bisher keine eindeutigen Beweise, daß die Muster in der Natur tatsächlich durch diejenigen Prozesse entstehen, die in den theoretischen Modellen zugrunde gelegt worden sind.

• Es gibt noch viel zu tun…

Literatur

• [1] G. Nicolis: „Introduction to nonlinear science“ 1995, Cambridge University Press

• [2] H. Meinhardt: „Biological Pattern Formation“ http://www.biologie.uni-hamburg.de/b-online/e28_1/pattern.htm

• [3] P. Prusinkiewicz: „Musterbildung“ http://www.biologie.uni-hamburg.de/b-online/d28/28b.htm

• [4] E. Jakobi: Vortrag „Selbstorganisation“ 2003, http://prp0.prp.physik.tu-darmstadt.de/~ejakobi/rbkonv.pdf

• [5] M. Kim, M. Bertram, H. Rotermund: „CO Oxidation“ 2001, Science, 292:1357-1359

• [6] Simulations-Software: „The Virtual Laboratory“ http://algorithmicbotany.org/virtual_laboratory/

• [7] P. Meakin: „A new model for biological pattern formation“ 1986, Journal of Theoretical Biology, 118:101-113

• [8] J. Krieger: „Reaktions-Diffusions-Systeme“ http://jkrieger.de/bzr/inhalt.html

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