Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg

Zentrum für Biosystemanalyse (ZBSA)(Center for Systems Biology)

Albert-Ludwigs-Universität Freiburg

Eine im Rahmen der Ausschreibung“Lebenswissenschaftliche Zentren

Baden-Württemberg”geförderte zentrale Einrichtung der Universität

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Systembiologie

Standardisierte Systeme

Quantitative, zeitauflösende Datenerhebung

Modellbildung

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Systembiologie - Schwerpunkte ZBSA Freiburg

Standardisierte Systeme

Quantitative, zeitauflösende Datenerhebung

Modellbildung

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Interaktionen im Freiburger Zentrenverbund

Z BSAZ e n tr um f ü r

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B ioin fo rm a t ikFDM ZBSA ZfBI

BiosystemanalyseDatenanalyse

undModellbildung

Bioinformatik

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Center for Systems Biology - ZBSA

• Realisiert im Rahmen der Baden-Württemberischen Initiative “Lebenswissenschaftliche Zentren

• Das ZBSA ist interdisziplinär ausgerichtet.

• Räumliche Zusammenführung von Kernkompetenzen bei der Erhebung und dem Management komplexer biologischer Datensätze. • Genomics (Expressionsprofilierung u.a.)• Proteomics• Biological Imaging• Mögliche Anbindung der Mikrosystemtechnik könnte neuartige Ansätze der Datenerhebung realisieren.

• Räumliche Integration der mit bioinformatischen Ansätzen arbeitenden Arbeitsgruppen

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Wissenschaftliche Organisation des

Zentrums für Biosystemanalyse

Projektbereiche und Kernkompetenzen im ZBSA-Gebäude (orange) und in affiliierten Arbeitsgruppen (gelb) etablieren die Biosystemanalyse in Freiburg.

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Projektbereich A: Zelluläre Schaltsysteme

• Im Mittelpunkt steht die Zelle als unabhängige, funktionelle, biologische Einheit.

• Das Hauptaugenmerk liegt dabei auf der Analyse integraler Schaltsysteme der Zelle.

• Für definierte Schaltprozesse in der Zelle sollen relevante Systemeigenschaften erschlossen werden, die nicht nur für das jeweils betrachtete, spezielle zelluläre System von Bedeutung sind, sondern Modellcharakter für die Zelle als biologische Funktionseinheit besitzen.

Beispiel: Leberzelle

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Projektbereich B: Regulatorische Netzwerke - Suprazelluläre Organisation

Ziel der Projekte dieses Bereiches ist es, die Gesamtheit der regulatorischen Einflüsse zu verstehen, die zur Differenzierung eines bestimmten Zelltypes, der Organisation von Zellen in Organe, und letztendlich zu komplexen Funktionen wie neuronalen Verschaltungen beitragen.

Beispiel: Aktivitätsmuster im Gehirn

Projektbereich C: MetabolomicsZiel ist die Erstellung von Modellen zu Metabolitflüssen durch Profiling niedermolekularer und sekundärer Stoffwechselendprodukte eingerichtet werden. (= Metabolomics, d. h. nach Möglichkeit die Erfassung aller Sekundärmetaboliten). Beispiel: Metabolitflüße Vitamin-Synthesen im Reis

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Beiträge zum ZBSA: Life Sciences in FreiburgMPI

Biologie I, II, III

Forstwissenschaften

Anatomie

BiochemiePhysiologieChemie&PharmaziePhysik

Kliniken

InformatikMikrosystemtechnik

FDM

molekular-organismischeForschungsbereichemolekulare &molekularbiologischzellbiologische Forschungsbereicheklinische ForschungsbereicheInformatikMikrosystemtechnikDatenanalyse

ZBSA

Zentrum fürBiosytemanalyse

Biotech-Park

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ZBSA

Baufertigstellung geplant Anfang 2005

Ca. 100 Mitarbeiter

Ca. 3000 qm

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Systems Biology Bioinformatik Modellbildung

Sozial-bereich

Labore S1 / S2: quantitative Datenerhebung

ZBSA: Integration von Datenerhebung und Theorie

OG1

OG2

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