Lipide. Grundlagen Was sind Lipide? Arten und Funktionen von Lipiden Glycerophospholipide Mono-, Di-...

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Lipide

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Lipide

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Grundlagen• Was sind Lipide?

• Arten und Funktionen von Lipiden• Glycerophospholipide• Mono-, Di- und Triglycerine• Ergosteriol und Ergosterylester• Freie Fettsäuren• Sphingolipide

• Isolierung• Auftrennung• Wieso 2D DC?• Nachweis

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Arbeiten mit radioaktiven Substanzen• Eigener Bereich für radioaktives Arbeiten• Art der Strahler • Umgang mit radioaktiven Substanzen• Substanzen gesondert entsorgen• Nach abgeschloßener Arbeit: Dekontamination des

Arbeitsplatzes

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Durchführung

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Vorbereitung der Hefekultur

Zellkonzentration mittels OD bestimmen

Zellen in Minimalmedium

vorinkubieren

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Zugabe von 1-14C-Palmitinsäure

Lösung inkubieren

BSA-Lösungzugeben

Zellpellet waschen

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Zellen

aufschließen

Lipide extrahieren

Mittels DC auftrennen

Aktivität der Fraktionen bestimmen

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Durchführung des Aktivitätsassays

Vorbereitung des Reaktionsansatzes

Zuagen von Stopplösung nach 0, 10, 20 Minuten

Bestimmen der Aktivität

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ZählausbeuteProbe Cocktail cpmLE cpmBW dpmLE dpmBW cpm*/dpm* %Zählausbeute

6 Safety Cocktail MW Probe 6 MW Probe 9 MW Probe 6 MW Probe 9 (Probe6-Probe9)/(Probe6-Probe9) cpm*/dpm*100

7 Safety Cocktail + H2O MW Probe 7 MW Probe 10 MW Probe 6 MW Probe 9 (Probe7-Probe10)/(Probe6-Probe9) cpm*/dpm*100

8 Safety Cocktail + H2O + Kieselgel MW Probe 8 MW Probe 11 MW Probe 6 MW Probe 9 (Probe8-Probe11)/(Probe6-Probe9) cpm*/dpm*100

Berechnungen

Spezifische Aktivität der Palmitinsäure

GBq/mmol dpm/mmol cpm/mmol

2,1 2,1*60 *10^9 dpm*Zählausbeute

Theoretische Totalaktivität

MBq/100ml fV dpm/10ml

37 10 37*60/fV*10^6

Bilanz

Probe Messvolumen µl cpm/Messung cpm*/Messung Gesamtvolumen ml Gesamtaktivität dpm

Totalaktivität 100 MWProbe 1 Probe1-Probe6 10,1 cpm*/Zählausbeute*Messvolumen/Gesamtvolumen

Medium 100 MWProbe2 Probe2-Probe6 11 cpm*/Zählausbeute*Messvolumen/Gesamtvolumen

Waschwasser1 100 MWProbe 3 Probe3-Probe6 5 cpm*/Zählausbeute*Messvolumen/Gesamtvolumen

Waschwasser2 100 MWProbe 4 Probe4-Probe6 10 cpm*/Zählausbeute*Messvolumen/Gesamtvolumen

Zellen 100 MWProbe 5 Probe5-Probe6 10 cpm*/Zählausbeute*Messvolumen/Gesamtvolumen

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Aufnahmerate

theorethische Konzentration 37000*60*1000/10,1/132000000 µmol/l

tatsächliche Konzentration cpm*Totalaktivität/Zählausbeute*10000/132000000 µmol/l

Zellkonzentration 1 mg/ml

Inkubationszeit 10 min

Einbau GesamtaktivitätZellen/GesamtaktivitätTotalaktivität*100 %

Aufnahmerate GesamtaktivitätZellen/100*Zählausbeute cpm*/(mg*min)

GesamtaktivitätZellen/100 dpm*/(mg*min)

GesamtaktivitätZellen/100/1,32*10^8 nmol/(mg*min)

Gesamtlipide

cpm cpm* % AktivitätLSC % Gesamtaktivität

Phospholipide MW MW-BW MW-BW/Summe MW-BW MW-BW/MW-BW

Diacylglycerine MW MW-BW MW-BW/Summe MW-BW MW-BW/MW-BW

freie Fettsäuren MW MW-BW MW-BW/Summe MW-BW MW-BW/MW-BW

Triacylglycerine MW MW-BW MW-BW/Summe MW-BW MW-BW/MW-BW

Sterolester MW MW-BW MW-BW/Summe MW-BW MW-BW/MW-BW

Summe Summe MW Summe MW-BW Summe=100% Summe MW-BW/MW-BW

Gemessene Gesamtaktivität MW MW-BW

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Phospholipide

cpm cpm* % Aktivität 1.Dim % Aktivität 2.Dim % Gesamtaktivität

PC 2421 2345 42,6 30,8 28,8

PS 481 405 7,4 5,3 5,0

PI 1958 1882 34,2 24,8 23,1

PE 826 750 13,6 9,9 9,2

DMPE 57 0 0,0 0,0 0,0

PA 439 363 6,6 4,8 4,5

LP 152 76 1,4 1,0 0,9

CL 25 0 0,0 0,0 0,0

FS 536 460 8,3 6,1 5,6

JVL 1398 1322 24,0 17,4 16,2

Summe 8293 7603 138,0 100,0 93,4

Gemessene Gesamtaktivität 8219 8143

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0 10 200

0.5

1

1.5

2

2.5

f(x) = 0.100118243243243 x − 0.0562049549549546R² = 0.986391545948243

Aktivitätsassay

Zeit [min]

Men

ge [n

mol

*f]

Anfangsgeschwindigkeitzeit dpm mmol nmol nmol*f zeit dpm mmol nmol nmol*f

0 173 2,64E-11 2,64E-05 0,01 0 MW MW/6,55E+12 mmol *E+6 nmol*442,2510 11976 1,83E-09 0,00183 0,81 10 MW MW/6,55E+13 mmol *E+6 nmol*442,2520 29808 4,55E-09 0,00455 2,01 20 MW MW/6,55E+14 mmol *E+6 nmol*442,25

Serin konz.Ci/ml Ci/mmol Bq/mmol dpm/mmol

0,001 29,5 1,0915E+11 6,549E+12 1Ci 3,7E+10Bq

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Diskussion

Phospholipide Diacylglycerine freie Fettsäuren Triacylglycerine Sterolester Sterole0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

Gesamtlipide

Wildtyp Mutante psd1psd2 Vergleich WildtypVergleich Mutante

% d

er G

esam

takti

vitä

t des

Coc

ktai

ls

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PC PS PI PE DMPE PA LP0.0

10.0

20.0

30.0

40.0

50.0

60.0

70.0

Phospholipide

Wildtyp Mutante psd1psd2 Vergleich Wildtyp

% d

er G

esam

takti

vitä

t des

Coc

ktai

ls

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0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

1.2

PS : PE

Wildtyp

Mutante psd1psd2

Vergleich Wildtyp

Vergleich Mutante

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Aktivitätsassay

0 5 10 15 20 250

0.5

1

1.5

2

2.5

3

3.5

4

4.5

f(x) = 0.197280405405405 x + 0.194695945945947R² = 0.981465973602446

f(x) = 0.100118243243243 x − 0.0562049549549546R² = 0.986391545948243

Wildtyp

Zeit [min]

Konz

entr

ation

[nm

ol]