Referat von Christopher Hardt fileProtein E benötigt Energie (metabolische Energie, essentielle...

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Optimalsteuerung III Optimale Enzymkonzentration (bzgl. Energiehaushalt) Seminar Regulationsnetze Referat von Christopher Hardt

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Optimalsteuerung III

Optimale Enzymkonzentration(bzgl. Energiehaushalt)

Seminar Regulationsnetze

Referat von Christopher Hardt

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Zur Ökonomie im Proteinhaushalt der lebenden Zelle

J. G. Reich

Biomed. Biochim. Acta 42 (1983) 7/8, 839 - 848

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InhaltHintergrund / MotivationTheorie (2 mathematische Modelle)& ErgebnisseDiskussionZusammenfassung

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MotivationE. coli in Laktose-Umgebungβ-Galaktosidase 3% des neugebildeten

ProteinsDurch genetische Manipulation steigerbarAber: Schlechteres Wachstum als beim Wildtyp

3% offenbar optimaler Wert (erfordert Regulationsmechanismen, die diesen Wert einstellen)

Hintergrund

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TheorieAufrechterhaltung bzw. Neusynthese von Protein E benötigt Energie (metabolischeEnergie, essentielle Faktoren, begrenzte Kapazitäten)

Aufrechterhaltung von E muss Nutzen haben

Rentabilität maximieren: Nutzen (E) – Kosten (E) = Max

Theorie

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Das GrundmodellKinetisches Schema (E als Variable):

TheorieMetabolismus (oben) und Anabolismus (unten)

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Das GrundmodellErgebnisse zur Rentabilität:

Theorie

)(60 rechtsa )(4;2,0;1,0;16 bzwlinksK SE ===== γτγ

esaa vvE γγψ −=)(

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Das GrundmodellErgebnisse:

Theorie

)(KEopt

8,0=c

Zugeh. Substrataufnahmerate

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Das erweiterte ModellKinetisches Schema (E und ATP variabel):

Theorie

• ATP dynamisch und abhängig von E

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Das erweiterte ModellErgebnisse:

Theorie

)( skE)(3 skA

1;1,0/;3,0;1;6,0 ===== eacpas kkkkγγ

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Das erweiterte ModellErgebnisse:

Theorie

Rentabilität (ψ = N-K)Produktbildungsrate

132

32

+⋅⋅⋅⋅

=AAk

AAkN es kAkE /3⋅=3AhK ⋅=

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Diskussion

Modelle lassen nur qualitative, keine quantitativen Analysen zuSehr einfaches System (wenige Parameter, 2 Kenngrößen)Um Produktausbeute zu erhöhen, müssen innere und äußere Bedingungen angepasst werden

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Zusammenfassung

In der Zelle synthetisierte Proteine haben Nutzen, aber auch Kosten (Energie, Material) als Funktion der ProteinmengeOptimale Konzentration, wenn

Rentabilität (Nutzen minus Kosten) maximal

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ZusammenfassungEnzym für Substrataufnahme (Nutzen), aber Kosten der BiosyntheseAufstellung von kinetischen Modellen / mathematischen Formulierungen mit Vorauss.: - metabol. Nutzen (Sättigung)- Kosten (linear)Zeigen, dass ein Optimum für [E] existiert

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Noch Fragen?

Ansonsten danke für die Aufmerksamkeit